摘要代谢功能障碍相关的脂肪分裂性肝病(MASLD)是一种全球健康流行病,全球发生约30%。MASLD的发病机理是一种复杂的多系统疾病,由遗传学,生活方式和环境在内的多种因素驱动。患者的异质性提出了开发MasLD治疗剂的挑战,为临床试验创建患者同伙以及针对特定患者队列的治疗策略的优化。为药物开发实施临床前实验模型带来了重大挑战,因为简单的体外系统和动物模型并未完全概括MASLD进展的发病机理和复杂性的关键步骤。为了解决这个问题,我们实施了一种精确的医学策略,该策略将使用患者来源的原代细胞构建的肝脏腺泡微生物生理系统(LAMP)。我们研究了与MASLD的肝细胞中与MASLD相关的遗传变异型PNPLA3 rs738409(I148M变体),因为它与MASLD进展有关。我们与基因分型野生型和变体PNPLA3肝细胞一起构建了灯,并构建了关键的非核细胞,并量化了模型的可重复性。我们将培养基成分改为模仿血液化学,包括胰岛素,葡萄糖,游离脂肪酸和免疫激活分子,以反映正常禁食(NF),早期代谢综合征(EMS)和晚期代谢综合征(LMS)条件。最后,我们调查了用代谢综合征相关的脂肪性肝炎(MASH)的Resmetirom治疗的反应,MASL的进行性形式。这项研究使用原代细胞是使用使用一组可重复指标的患者IPSC衍生的肝细胞构建的“患者仿生双胞胎”的研究基准。与野生型CC灯相比,我们观察到脂肪变性增加,免疫激活,星状细胞活化和纤维化标记物的分泌,与野生型CC灯相比,与该变体的临床表征一致。与多个MASLD指标的GG变体相比,我们还观察到PNPLA3野生型CC灯的重新融合功效更大,包括脂肪变性,星状细胞活化和促纤维化标记的分泌。总而言之,我们的研究证明了LAMPS平台开发MASLD Precision Therapeiutics的能力,对临床试验的患者队列丰富,以及针对具有不同临床性状和疾病阶段的患者亚组的治疗策略的优化。
摘要代谢功能障碍相关的脂肪分裂性肝病(MASLD)是一种全球健康流行病,全球发生约30%。MASLD的发病机理是一种复杂的多系统疾病,由遗传学,生活方式和环境在内的多种因素驱动。患者异质性为开发MasLD治疗学,为临床试验创建患者队列以及针对特定患者队列的治疗策略的挑战带来了挑战。实施药物开发前的临床前实验模型也带来了重大挑战,因为简单的体外系统和动物模型并未完全概括MASLD进展的发病机理和复杂性的关键步骤。为了应对这一挑战,我们实施了一种精确的医学策略,该策略将使用患者衍生的原代细胞或诱导多能干细胞(IPSC)构建的肝脏微生物生理系统(MPS)(MPS)。在这项研究中,我们研究了原发性肝细胞中最常见的MASLD相关遗传变异PNPLA3 rs738409(I148M变体),因为它与Masld进展密切相关。我们使用基因型的野生型和变体PNPLA3肝细胞以及关键的非核细胞构建了肝脏腺泡微生物生理系统(LAMP),并量化了模型的可重复性。我们将培养基成分改为模仿血液化学,尤其是胰岛素,葡萄糖,游离脂肪酸和免疫激活分子以反映正常禁食(NF),早期代谢综合征(EMS)和晚期代谢综合征(LMS)条件。最后,我们调查了对用代谢综合征相关的脂肪性肝炎(MASH)(MASH)(MASH)的第一种药物进行Resmetirom的反应,这是MASLD的进行性形式。这项研究使用原代细胞为我们的研究提供了使用“患者仿生双胞胎”的基准,该基准使用患者IPSC衍生的肝细胞使用一组可重复的指标构建。与野生型CC灯相比,我们观察到增加的脂肪变性,免疫活化,星状细胞活化和纤维化标记物在高危PNPLA3 GG变体中的分泌,与该变体的临床表征一致。此外,与多个MASLD指标中的GG变体相比,我们观察到PNPLA3野生型CC灯的重中式功效更大,包括脂肪变性,星状细胞活化和促纤维化标记的分泌。总而言之,我们的研究证明了LAMPS平台开发MASLD Precision Therapeiutics的能力,对临床试验的患者队列丰富,以及针对具有不同临床性状和疾病阶段的患者亚组的治疗策略的优化。
KRAS突变会导致卵巢癌的代谢重编程,从而导致转移能力增加。这项研究研究了卵巢癌中KRAS突变引起的代谢重编程变化以及二甲双胍与谷氨酰胺酶1抑制剂联合的作用机理(CB-839)。KRAS-卵巢癌占卵巢癌的14%。在KRAS卵巢癌细胞中,与葡萄糖代谢相关的表达(PFKFB3,HK2,GLUT1和PDK2)和与谷氨酰胺代谢相关的酶(GLS1和ASCT2)的表达升高,在KRAS-突出的卵巢癌细胞中与野生型细胞相比。KRAS-突出细胞的有氧氧化能力高于野生型细胞。二甲双胍抑制了与对照细胞相比,KRAS-突出细胞的增殖,与葡萄糖代谢相关酶的表达以及KRAS-突出细胞的有氧氧化能力。此外,它增强了KRAS-突出细胞中与谷氨酰胺代谢相关的酶的表达。二甲双胍与CB-839结合抑制KRAS-突变细胞的增殖和有氧氧化程度要比在野生型细胞中观察到的更大程度。此外,二甲双胍和CB-839在KRAS-突变卵巢癌点数抑制作用的抑制作用明显高于药物组中的模型。KRAS突变导致卵巢癌细胞中葡萄糖和谷氨酰胺代谢增强,二甲双胍与CB-839结合抑制。
saccharomyces cerevisiae pif1是一种多功能DNA解旋酶,在维持核和线粒体基因组的维持中起多种作用。PIF1的两个同工型通过使用替代的翻译起始站点从单个开放的阅读框架中产生。PIF1的线粒体靶向信号(MT)位于两个起始位点之间,但是尚未确定核定位信号(NLS)。在这里,我们使用序列和功能分析来识别NLS元素。在859氨基酸PIF1的羧基末端结构域中缺乏四个碱性氨基酸(781 kKRK 784)的PIF1(PIF1-NLSΔ)的突变等位基因在野生型水平上表达并保留野生型野生型线粒体界功能。然而,PIF1-NLSδ细胞在四个测试中的核功能中有缺陷:端粒长度维持,Okazaki碎片处理,突破性诱导的复制(BIR)以及与核靶位点结合。将NLS融合了NLS,从Simian病毒40(SV40)T-抗原融合到PIF1-NLSδ蛋白质,可减少PIF1-NLSδ细胞的核缺损。因此,绝大多数核PIF1功能需要PIF1羧基附近的四个碱性氨基酸。我们的研究还揭示了先前描述的功能PIF1-M2等位基因丧失与这项工作中产生的其他三个PIF1突变等位基因之间的表型差异,这对于研究核PIF1功能将很有用。
我们在11个BRCA1/2野生型和2个BRCA1突变癌细胞系中进行了CRISPR筛选,以识别与BRCA1突变合成致死的靶标。除了USP1,PARP1和POLQ外,我们还将DNA连接酶基因lig1确定为新的靶标,当被击倒后,会选择性地杀死BRCA1突变细胞。对乳腺癌和卵巢癌细胞系中Achilles数据库中BRCA突变的内部分析进一步验证了BRCA1突变细胞在LIG1上的超依赖性。使用CRISPRN,CRISPRI和RNAI对LIG1的单基因扰动证实了LIG1在BRCA1突变细胞系中失活的致命作用,但不能BRCA1/2野生型细胞系。可以通过与外源性野生型LIG1 cDNA相辅相成,证明遗传工具的目标性质可以挽救这种生存能力。使用可降解的DNA连接酶I融合蛋白,我们证明了DNA连接酶I蛋白水平与BRCA1突变细胞中的生存能力之间存在很强的相关性。酶上无活性的DNA连接酶I突变蛋白(LIG1 K568A)无法营救由内源性LIG1耗竭引起的生存力的损失,从而从小分子抑制剂的角度来支持该靶标的易生化性。使用BRCA1突变体MDA-MB-436衍生的肿瘤在体内复制这些数据,其中肿瘤生长在LIG1丢失后抑制了> 80%。
摘要 背景/目的:肺炎克雷伯菌在医疗器械上形成的生物膜会增加感染风险。菌毛和荚膜多糖 (CPS) 是参与生物膜形成的重要因素。据报道,肺炎克雷伯菌 NTUH-K2044 中的 KP1_4563 是一种含有 DUF1471 结构域的小蛋白,可抑制 3 型菌毛功能。在本研究中,我们旨在确定 KP1_4563 同源物在每个肺炎克雷伯菌分离株中是否保守,以及它在克雷伯菌生物膜中起什么作用。方法:比较了肺炎克雷伯菌 NTUH-K2044、CG43、MGH78578、KPPR1 和 STU1 的基因组。肺炎克雷伯菌 STU1 中的 KP1_4563 同源物被命名为 orfX。对来自肺炎克雷伯菌 STU1 和一个临床分离株 83535 的野生型和 orfX 突变菌株的生物膜进行了量化。通过 RT-qPCR 研究了 3 型菌毛基因 mrkA 和 mrkH 的转录水平。通过蛋白质印迹法观察野生型和 orfX 突变体的 MrkA。通过透射电子显微镜 (TEM) 观察细菌细胞的形态。对细菌 CPS 进行了量化。结果:orfX 的基因和上游区域在五种肺炎克雷伯菌分离株中是保守的。orfX 的缺失增强了克雷伯菌生物膜的形成。然而,野生型和 orfX 突变体之间 mrkA 和 mrkH 的 mRNA 量以及 MrkA 蛋白的水平没有差异。相反,orfX 突变体中的 CPS 量增加,
摘要:whirly1是一种小型植物特异性的ssDNA结合蛋白,双重位于叶绿体和核中,讨论是作为一种逆行信号,可作为逆行信号传递从叶绿素传递到细胞核的应激信号,并在那里触发与压力相关的基因表达。在这项工作中,我们调查了使用两条过表达线(OEW1-2和OEW1-15)在大麦的干旱应力反应中的功能。Whirly1的过表达延迟了原发性叶片中与干旱应力相关的发作。干旱应激的两个脱甲酸(ABA)依赖性标记基因HVNCED1和HVS40,其在干旱治疗期间诱导的野生型中的表达并未在过表达线中诱导。此外,叶片中的ABA浓度与干旱相关的浓度增加在Whirly1过表达线中被抑制。分析Whirly1功能获得的影响对核基因表达与干旱相关的重编程的影响,进行了RNASEQ进行比较野生型和过表达线的影响。群集分析揭示了一组高度上调的基因,该基因响应野生型的干旱,而不是在Whirly1过表达线中。是许多胁迫和脱落酸(ABA)相关的基因。与野生型相比,在OEW1系中上调的另一个簇包含上调的基因。这些与原代新陈代谢,叶绿体功能和生长有关。我们的结果表明,Whirly1充当枢纽,平衡与压力相关和发育途径之间的权衡。测试Whirly1的功能获得的功能是否影响与压力相关基因表达的表观遗传控制,我们分析了启动子不同区域和HVNCED1和HVS40的转录起始位点的干旱相关组蛋白修饰。有趣的是,在Whirly1过表达线中,两个基因的构想标记水平(H3K4ME3和H3K9AC)显然降低了。我们的结果表明,被讨论以作为逆行信号的Whirly1会通过差异组蛋白的修饰在干旱过程中影响与ABA相关的核基因表达的重编程。
内源性大麻素系统是一种关键的大脑信号通路,在包括阿尔茨海默氏病(AD)在内的各种脑部疾病中失调。大麻素靶向的疗法和成像方法已越来越兴趣。但是,内源性大麻素系统在疾病中的生物学影响需要进一步验证。我们旨在研究大麻素受体1(CB1)和单酰甘油脂肪酶(MAGL)的变化,在PET Imaging的AD小鼠模型中,内源性大麻素信号传导和降解的成分。方法:[18 f] fmpep- d 2和[18 f] magl-2102是在商业放射合成模块上产生的。PET-CT图像在3岁时,具有突变的人淀粉样蛋白前体蛋白(APP NL-G-F)的AD型小鼠模型中获取,并与野生型小鼠进行了比较。使用[18 f] fmpep- d 2和[18 f] magl-2102,免疫荧光和蛋白质印迹的[18 f] fmpep- d 2和[18 f] fmpep-d 2和[18 f] fmpep- d 2和[18 f] fmpep- d 2和蛋白质印迹。雄性野生型和5xFAD小鼠在结束治疗后两天用MAGL抑制剂JZL184长期治疗,并用[18 F] MAGL-2102成像。结果:PET成像显示CB1和MAGL可用性的性别,年龄和基因型依赖性变化。在4个月(早期β-淀粉样蛋白病理学)时,与野生型相比,男性应用NL-G-F的雌性APP NL-G-F小鼠的CB1可用性较低,而男性应用NL-G-F的MAGL可用性也有所增加。在8个月中,未观察到CB1的基因型差异,但在APP NL-G-F额叶皮质中降低了MAGL的可用性,而男性APP NL-G-F小鼠的MAGL比大脑范围更高的MAGL更高。App NL-G-F斑块分期通过硫诺夫蛋白S染色确认。与野生型相比,在12个月(晚期β-淀粉样病理学)中,在APP NL-G-F中观察到[18 F] FMPEP-D 2的吸收率明显降低,[18 F] MAGL-2102结合[18 F] MAGL-2102的结合没有变化。成像发现是通过自显影,免疫荧光和蛋白质印迹补充的。[18 F] MAGL-2102的可用性对MAGL抑制剂JZL184在野生型和5XFAD小鼠中的目标参与有反应。结论:本研究表明,早期β-淀粉样蛋白病理学的CB1和MAGL可用性的动态年龄,性别和病理相关的变化,表明内源性大麻素系统是诊断和治疗AD的有用靶标。最后,这些结果强调了内源性大麻素的性别差异应在诊断和药物开发中考虑。
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患者细胞(n = 4)(图a)。杀死功效的异质性,从加速/爆炸期疾病患者的样品的细胞毒性较低(n = 2,图,图。a),可能反映了突变体和野生型细胞的百分比和mutcalr-tpo-r复合物的表达水平