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由于抗生素失活而筛选重组体是一个繁琐的过程，因为它需要同时在具有不同抗生素的两个平板上进行培养。因此，已经开发出替代性选择标记，根据重组体在有显色底物存在下产生颜色的能力，将重组体与非重组体区分开来。在此过程中，将重组 DNA 插入酶 β-半乳糖苷酶的编码序列中。这导致合成该酶的基因失活，这称为插入失活。
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