QBI作为有组织的研究部门(ORU)的起源位于先前成立的药学学院ORU学院,分子设计学院(MDI),由Irwin“ Tack” Kuntz,PhD于1993年创建,如今,今天是药学学院药学学院的药学学院授权教授。MDI的最初目标是促进新型药物的发现,设计和交付。尝试创建MDI时,根本无法使用基于定量方法的药物设计的许多实验和计算工具。多亏了过去20年来定量和计算生物学的最新革命,QBI处于独特的位置,可以利用定量方法来揭示几乎任何疾病领域背后的基本生物学,并最终确定可能具有治疗价值的化合物和治疗方法。现任药学院的院长约瑟夫·古利尔莫(B. Joseph Guglielmo)在UCSF校园和总统办公室的大力支持下,将MDI转变为QBI。