摘要背景:冠状病毒(COV)是一种新兴的人类病原体,在世界范围内引起严重的急性呼吸道综合征(SARS)。早期对SAR的生物标志物的鉴定可以促进检测并降低疾病的死亡率。 因此,通过集成的网络分析和结构建模方法,我们旨在探索冠状病毒药物SARS的潜在药物靶标和候选药物。 方法:使用Limma进行了COV感染宿主基因(HGS)表达谱的差异表达(DE)分析。 高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用(PPI)网络。 结果:使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1(202个节点);从PPI网络检索模块2(126个节点)和模块3(121个节点)模块。 MYC,HDAC9,NCOA3,CEBPB,VEGFA,BCL3,SMAD3,SMAD3,SMURF1,KLHL12,CBL,ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标(PDT),这些药物靶标(PDT)在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。 功能项生长因子受体结合,C型凝集素受体信号传导,白介素1介导的信号传导,通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现,刺激T细胞受体信号传导,刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路,信号传输和细胞座的免疫通道富集。早期对SAR的生物标志物的鉴定可以促进检测并降低疾病的死亡率。因此,通过集成的网络分析和结构建模方法,我们旨在探索冠状病毒药物SARS的潜在药物靶标和候选药物。方法:使用Limma进行了COV感染宿主基因(HGS)表达谱的差异表达(DE)分析。高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用(PPI)网络。 结果:使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1(202个节点);从PPI网络检索模块2(126个节点)和模块3(121个节点)模块。 MYC,HDAC9,NCOA3,CEBPB,VEGFA,BCL3,SMAD3,SMAD3,SMURF1,KLHL12,CBL,ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标(PDT),这些药物靶标(PDT)在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。 功能项生长因子受体结合,C型凝集素受体信号传导,白介素1介导的信号传导,通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现,刺激T细胞受体信号传导,刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路,信号传输和细胞座的免疫通道富集。高度整合的De-cov-HG被选择构建蛋白质蛋白质相互作用(PPI)网络。结果:使用WalkTrap算法高度互连模块包括模块1(202个节点);从PPI网络检索模块2(126个节点)和模块3(121个节点)模块。MYC,HDAC9,NCOA3,CEBPB,VEGFA,BCL3,SMAD3,SMAD3,SMURF1,KLHL12,CBL,ERBB4和CRKL被鉴定为潜在的药物靶标(PDT),这些药物靶标(PDT)在COV感染后在人类呼吸系统中高度表达。功能项生长因子受体结合,C型凝集素受体信号传导,白介素1介导的信号传导,通过MHC I类的TAP依赖性抗原处理以及肽抗原的呈现,刺激T细胞受体信号传导,刺激性T细胞受体信号传导以及先天的响应信号通路,信号传输和细胞座的免疫通道富集。
主要关键词