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系统神经科学通常依赖于使用植入的装置和病毒注射来刺激和记录解剖学或遗传定义的神经元种群。要正确解释所得数据，至关重要的是映射植入设备或注射的位置，以及在常见的解剖坐标系统中由多个动物产生的池。显微镜和组织清除方面的最新发展允许对完整啮齿动物大脑的全自动，高分辨率成像1。存在许多将这些3D全脑显微镜数据集注册到地图集的方法，但是这些方法通常不灵活，耗时，需要相当大的计算技能2。另外，一旦注册，就没有开源的，用户友好的工具来分割和分析这些图像中任何类型的结构。在这里，我们已经开发了脑部和脑部段，这是两个用户友好的工具，可在几分钟内用于注册和细分全脑显微镜数据集。
改进了量子应用的非线性设备
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