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电动机阈值（MT）是确定RTMS处理“剂量”的方式。这是大多数RTMS协议的重要度量。MT测量的准确性是实现治疗有效性和安全性的关键。与治疗位置映射一起，必须快速但准确地执行MT测定。Neuro-MS.NET软件提供了用于MT确定和大脑映射的一系列工具：使用EMG放大器，使用步骤algo Rithers，F3定位器和Visual帮助的自动MT测定，半自动MT确定。
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