摘要书籍程序摘要#1探索阴影增强剂建筑的功能意义Jillian Ness,Yu Wang,Christian Mei,Renata Serio,Renata Serio,Zeba Wunderlich Boston University,美国,美国许多发育基因都受到一套看似冗余的增强剂的调节,这些增强剂可以推动重叠的Spatiotemporpormoral模式。这些多增强器系统被称为阴影增强剂。阴影增强子可以缓冲遗传和环境应力以驱动正常的基因表达模式。使用果蝇胚作为模型,我们表明,前后图案基因的阴影增强子通过结合不同的输入转录因子的不同集来驱动一致的基因表达模式。尽管如此,尚不清楚为什么阴影增强子转录因子结合位点分布在多个增强器上,而不是在单个增强器中。可以想象,阴影增强子使用的机制可以编码为单个增强剂。我们已经生成了增强剂记者,其中消除了阴影增强剂之间的内源性DNA以做出“挤压”配置。令人惊讶的是,我们发现毛压和内源间隔增强子之间的RNA模式,水平和动力学几乎没有差异,这表明阴影功能不需要内源性间距。我们正在构建各个长度的合成污垢增强子,以测试squish增强子保留功能的较低尺寸限制。要理解引起阴影增强子的进化动力学,我们已经使用生物信息学来识别发育阴影增强子集的起源。星期四,我们发现重复事件和可转座元素似乎是果蝇中相对较小的(<10%)的发育阴影增强子出生来源,与我们在小鼠基因组中的发现相比(〜30%)。这些数据表明,合并的单个增强剂可以与不同的阴影增强子相比功能,而不会在压力下损害忠诚度。我们将探测创造和维持阴影增强子的进化动力学,以使其在动物发育中的普遍作用合理化。由NIH授予R01HD095246资助的工作。
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