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抗生素治疗会对微生物群产生有害影响并导致抗生素耐药性。为了开发一种针对多种临床相关的大肠杆菌的噬菌体疗法,我们筛选了一个包含 162 种野生型 (WT) 噬菌体文库,确定了 8 种对大肠杆菌具有广泛覆盖度、与细菌表面受体互补结合并能稳定携带插入货物的噬菌体。选定的噬菌体经过尾纤维和 CRISPR-Cas 机制改造,以专门针对大肠杆菌。我们发现,工程噬菌体可以靶向生物膜中的细菌,减少噬菌体耐受性大肠杆菌的出现,并在共培养实验中胜过其祖先 WT 噬菌体。四种最具互补性的噬菌体的组合,称为 SNIPR001,在小鼠模型和小型猪中均具有良好的耐受性,并且比单独的组成部分更好地减少小鼠肠道中的大肠杆菌负荷。 SNIPR001 目前正在临床开发中,旨在选择性杀死大肠杆菌,大肠杆菌可能会导致血液癌症患者出现致命感染。

具有抗菌 CRISPR–Cas 的工程噬菌体可选择性地减少小鼠中的大肠杆菌负担

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