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近年来,RNA测序(简短的RNA-Seq)已成为一种非常广泛的技术,可以分析一个不断变化的细胞转录组,即一个细胞或一个细胞中的所有RNA分子的集合。RNA-seq最常见的目标之一是通过鉴定两个或多个生物学条件之间差异表达(DE)的基因或分子途径来填充基因表达。从RNA-seq数据中检测DE基因和途径的计算工作流量需要使用多种命令行工具和大多数用户可能无法访问的大量计算资源。Galaxy [1]是一个强大且易于使用的基于Web的平台,用于科学数据分析。分析中的步骤是通过运行Galaxy工具执行的,该工具描述了如何将命令行软件的参数转换为用户友好的Web界面。图形网络界面以及大量高质量,社区开发和维护的工具和培训材料,可以为新手和专家用户进行快速的交互式分析。对于分析的每个步骤,Galaxy捕获了几个元数据(例如,工具标识和版本,输入和参数)启用

Galaxy中的RNA-Seq数据分析

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