•编程和脚本:熟练掌握R,Python,Matlab,Bash进行数据分析,统计建模和生物信息学管道。•生物信息学:在单细胞和空间转录组学,变体分析,RNA-seq和多摩学集成中经验丰富。•数据分析和可视化:使用Seurat,Deseq2和Pseudobulk等工具开发自定义工作流程进行生物数据分析的熟练。使用GGPLOT2和绘图的数据可视化中的强大功能。•云和高性能计算:设置和管理云基础架构(AWS,GCP)和HPC环境方面的专业知识,使用Slurm和Docker进行可扩展计算。•软件和Web开发:开发了带有r闪亮,简化和反应的生物信息学Web应用程序,重点是交互式数据探索。•机器学习与建模:应用机器学习技术到生物医学数据,具有特征选择,分类模型和网络分析的经验。•工作流程管理:使用NextFlow和管道开发进行大规模基因组数据处理的工作流管理经验。
主要关键词