[SW3] Rase - http://github.com/c2-d2/rase-pipeline- python,snakemake,make,r和bash。使用纳米孔测序对实时预测抗生素耐药性实时预测的基因组邻居的概念验证框架。管道,工具,库,两个物种数据库(肺炎链球菌和淋病N. gonorrhoeae),用于新数据库的骨架以及分离株和元基因组的几分钟内诊断的证明。[SW4] prophyle - http://prophyle.github.io - Python,C和C ++。基于k -mer传播,简单和k -mer使用burrows -wheeler变换,基于k -mer繁殖,简单和k -mer索引的精确,柔软和确定性的元基因组分类器。[2.21m下载] [SW5] SamSift - http://github.com/karel-brinda/samsift - Python。使用Python表达式对SAM/BAM对齐的高级过滤和标记。[445k下载]
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