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Aquaponics System（AP）是将来大量生产食品的一种有希望的形式。该系统减少了大规模水生产的需求。通过与水培系统（HP）连接，从循环水产养殖系统（RAS）中清除氮废物的问题。微生物在水产养殖系统中的生化活性中至关重要，例如氮循环，废物分解和排毒。但是，系统中过多的微生物将增加水生生物和植物的疾病风险。在RAS系统中，高密度繁殖丰富了营养。微生物管理更为关键。通过区域隔离的设计，该系统将不同的生化反应局限于特定的间隔，从而通过具有环境优势来塑造主要的细菌相，从而增强其性能，并同时减少微生物对培养生物体的干扰。水培养殖强调了植物，水生生物和微生物之间的共生关系，将产生比RAS系统更多样化和复杂的微生物群。相关研究表明，使用微生物区管理的未耦合的水培技术可能是降低管理风险并提高生产能力的正确方法。关于水生系统微生物阶段的研究仍然很少。有限的研究表明，水培技术中的微生物群可能随季节和农场的地理位置而变化很大。更积极的细菌研究和建立有效的管理措施是未来水产养殖管理的核心技术。
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