报道的用于噬菌体基因组遗传操纵的第一个策略之一是噬菌体重新组合电子的DNA(繁殖,图,图,图。1)。该技术最初是为了产生裂解分枝杆菌噬菌体中的点突变,插入,缺失和基因替代的创建[13,14]。在繁殖方法中,噬菌体DNA和感兴趣的DNA(靶取代,缺失或插入)同时通过电穿孔到配备了重组系统(通常是λ红或RAC系统)的细菌细胞中引入,从而增强了同源性重组的频率[13]。也已用于遗传工程大肠菌噬菌体[15,16],并且有人建议通过对方案进行了略微修改并适当的重新调节系统,该方法可以应用于许多其他针对不同细菌种类物种的其他细菌。与育种相关的主要问题之一是筛选突变噬菌体。但是,可以使用反选择技术来进一步改善突变噬菌体的选择。近年来,为此目的开发了多种基于CRISPR的方法,其中野生型噬菌体是由程序化的CRISPR-CAS系统瞄准的。DNA和RNA靶向CRISPR-CAS系统均已成功使用[17-23]。