质粒 DNA(标记为红色)被选为我们在实验室中制备的单向导 RNA 的靶序列。马丁将这些单向导 RNA 添加到纯化的 Cas9 蛋白中,并将它们与质粒 DNA 分子一起在实验室试管中孵育。为了分析该实验的结果,他在琼脂糖凝胶系统中将不同的切割 DNA 产物彼此分离,如图所示。您可以在该凝胶系统的每个泳道中看到,根据向导 RNA 与质粒 DNA 相互作用的位置,Cas9 会产生切口。通过在不同的位置切割质粒,以便同时将两个双链断裂引入质粒,我们可以将这些切割的 DNA 片段释放到凝胶系统中。如您所见,每个切割的质粒 DNA 片段根据片段的大小迁移到不同的位置。