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摘要背景转移性肾细胞癌 (mRCC) 中肿瘤特异性基因组改变的临床意义正在显现，一些研究表明 PBRM1 突变与免疫疗法 (IO) 反应之间存在关联。我们试图确定对血管内皮生长因子-酪氨酸激酶抑制剂 (VEGF-TKI) 和 IO 的不同反应的基因组预测因子。方法确定接受基因组分析的连续患者；包括接受 VEGF- TKI 或 IO 的患者。使用临床实验室改进修正案 (CLIA) 认证的检测方法 (Ashion Analytics；美国亚利桑那州凤凰城) 进行临床肿瘤正常全外显子组测序和肿瘤全转录组测序测试。在 VEGF-TKI 治疗患者群和 IO 治疗患者群中，比较了有临床益处 (CB；完全/部分缓解或病情稳定 >6 个月) 和无临床益处 (NCB) 患者的基因组结果。结果 91 名患者接受了基因组分析，58 名患者接受了 VEGF-TKI 和/或 IO 治疗。17 名患者接受了 VEGF-TKI 和 IO 的顺序治疗，结果 IO 队列中有 32 名患者，VEGF-TKI 队列中有 43 名患者。最常用的 IO 和 VEGF-TKI 是 nivolumab (66%) 和舒尼替尼 (40%)。整个队列中检测到的最常见变异是 VHL (64%)、PBRM1 (38%)、SETD2 (24%)、KDM5C (17%) 和 TERT (12%)。TERT 启动子突变与 IO 队列中的 NCB 相关 (p=0.038)；转录组分析揭示了 TERT 下游的多个差异调控通路。发现 TERT 启动子突变和 PBRM1 突变是互相排斥的。虽然 PBRM1 突变在接受 IO 和 VEGF-TKI 治疗的 CB 患者中更为普遍，但未发现统计学上显着的关联。结论我们的分析发现，TERT 启动子突变可能是 IO 结果的负面预测因素，并且与 PBRM1 功能丧失突变相互排斥。
综合基因组
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