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SNP微阵列分析是使用Affymetrix Oncoscan(TM)FFPE测定试剂盒进行的,其唯一目的是识别DNA拷贝数的收益和损失以及杂合性丧失的区域。该测定法利用了分子反转探针(MIP)技术,该技术已针对高度降级的FFPE样品(仅40个碱基对的探针询问位点)进行了优化。对于拷贝数,该测定法在选定的900个癌症基因中的分辨率为50-100 kb,在癌症基因之外的300 kb分辨率。镶嵌的检测阈值是可变的,具体取决于段的大小。CNV。收益和损失包括已知的临床意义癌症基因,或者在临床肿瘤学之外的3MB重要区域大于3MB,杂合性的丧失大于10MB。分析基于GRCH37组件。

肿瘤的染色体微阵列分析

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