基因与复制的起源的接近性在细菌中的复制和转录相关过程中起关键作用。潜在来源位置的计算预测在起源发现中具有重要作用,从而严重降低了实验成本。我们将ORCA(复制评估的起源)作为可视化核苷酸差异的快速且轻巧的工具,并预测了复制起源的位置。orca使用核苷酸差异,DNAA盒区域和靶基因位置的分析来找到潜在的起源位点,并具有随机的森林分类器来预测这些位点可能是起源的。orca的预测和可视化功能使其成为有助于实验确定复制起源的有价值方法。orca用Python-3.11编写,以最少的精力处理任何操作系统,并且可以处理大型数据库。完整的实施详细信息在补充材料中提供,源代码可在GitHub上免费获得:https://github.com/zoyavanmeel/orca。
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