氨氧化古细菌(AOA)是微生物群落的无处不在成分,并在某些土壤中占据了硝化的第一阶段。当我们开始了解土壤病毒动力学时,我们对那些感染硝基菌的人的组成或活性或其影响过程的潜力不了解。这项研究旨在表征在两种硝化pH的硝化土壤中感染自身噬菌AOA的病毒,这是通过通过DNA稳定的异位素探测和化合物分析转移了同化的CO 2衍生的13 C从宿主到病毒的13 C。将13 C掺入低GC MOL%AOA中,病毒基因组增加了CSCL梯度中的DNA浮力密度,但导致与富含非增强的高GC MOL%基因组共同移民,减少了测序depth和Contig组装。因此,我们开发了一种杂种方法,其中AOA和病毒基因组是从低浮力DNA组装而成的,随后映射13 C同位素富集的高浮力密度DNA读取以识别AOA的活性。元基因组组装的基因组在两种土壤之间是不同的,并且代表了广泛的活性种群。识别64个AOA感染病毒运营分类单元(投票),与先前特征的原核生物病毒没有明确的相关性。这些投票在土壤之间也有所不同,其中42%的富含宿主的13 C富集。大多数人被预测为能够溶裂性,辅助代谢基因包括一种AOA特异性多孔氧化酶,表明感染可能会增强对中央代谢功能所必需的铜摄取。这些发现表明AOA的病毒感染可能是硝化过程中经常发生的过程,可能会影响宿主生理和活性。
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