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由于2 x 151读取长度和短扩增子设计,在读取的开头和结尾都将遇到PCR研究期间引入的合成引物序列。这些人工序列必须在变体调用之前剪辑。为实现这一目标,我们设计了对齐后软剪接底漆底座的推荐工具。Primerclip生物信息夹在5'和3'底漆碱基上,消除了从这些合成序列中调用变体的风险。除了速度外,PrimerClip还具有改进对齐末端的变体调用的优点,而对齐的末端可能会因边缘效应而受到损害。在扩增子的边缘/末端存在的变体将有更大的调用。
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