翼手目又分为两个亚目,大翼手目和小翼手目 (Koopman, 1993)。大翼手目均分布在旧大陆热带和亚热带地区,以水果、花蜜和花粉为食,主要栖息在树上 (Hill & Smith, 1984)。翼手目有一个科,即翼手科 (Pteropodidae),包含 42 个属和 166 个物种 (Koopman, 1993)。最大的属翼手属 (Pteropus) 的 57 个物种主要为岛屿物种,特有性水平极高;35 个物种仅在一个岛屿或一小群岛屿上发现 (Mickleburgh et al., 1992)。大蝙蝠不使用高频回声定位,但眼睛大,视力好,使用视觉和嗅觉作为主要的位置感觉。小蝙蝠几乎遍布世界各地,有 16 个科、135 个属和 759 个物种 (Koopman, 1993)。小蝙蝠使用高频回声定位,并依靠听觉作为主要的位置感觉。它们可能以昆虫、水果、花蜜、花粉、鱼、其他脊椎动物或血液为食,它们栖息在各种各样的地方,包括洞穴、建筑物和树木 (Hill & Smith, 1984)。最大的科,小蝙蝠科,有大约 300 个物种,几乎遍布全球。