新框架设置以指导数据重用公共微生物组数据

一项对微生物组科学家进行调查的国际研究发现,在数据重用方面,需要调整由科学界驱动的一套通用道德准则。

来源:英国物理学家网首页
对306位科学家对数据重用的调查的总结结果。学分:自然微生物学(2025)。 doi:10.1038/s41564-025-02116-2
自然微生物学

一项对微生物组科学家进行调查的国际研究发现,在数据重用方面,需要调整由科学界驱动的一套通用道德准则。

加拿大环境微生物学研究主席Laura Hug是一个团队的一部分,该团队对全球300多家科学家进行了调查,以获得有关数据重用的见解。研究人员发现了过时的准则和一种不一致的方法,可以在机构之间重复使用数据。

在自然微生物学上发表的文章是“公平重复使用公共微生物组数据的路线图”,提出了易于遵循的准则,以促进公平序列数据再利用。对于依靠共享数据的微生物组科学家来说,这些准则的适应可能会删除主要的障碍,从而节省了时间,否则花费了时间来追踪数据集所有者。

“我经常会发现有价值的数据集,但是我花了几天的时间才能弄清楚谁拥有它们,” Hug说。 “这个想法是将这些标准与数据的标志相结合到数据库中,以确保与数据所有者有明确的连接。”

标志是公共序列数据的数据重用信息(DRI)标签,与至少一个开放研究员和贡献者ID(ORCID)链接。此机器可读的标签向研究人员发出信号,表明数据所有者更喜欢在重复使用之前联系并提供其信息。

实施这些准则已经开始,欧洲核苷酸档案实施了OrcID元数据类别,该类别允许数据创建者将识别信息附加到其提交中。

科学合作越来越重要,来自世界各地的共享数据集有助于发展研究。但是拥抱强调在没有全部图片时使用数据时需要谨慎。

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