新的计算机语言有助于发现隐藏污染物

由UC Riverside提供的生物学家和化学家提供了一种新的编程语言,可以发现以前未知的环境污染物和其他信息以惊人的速度 - 而无需它们来编码。

来源:加州大学河滨分校

生物学家和化学家有一种新的编程语言,可以以惊人的速度发现以前未知的环境污染物 - 而无需他们编码。通过使搜索大量化学数据集变得更加容易,该工具已经确定了隐藏在平坦视线中的有毒化合物。

UCR计算机科学家Mingxun Wang在他的实验室中。王为科学家创建了新的编程语言。 (stan lim/ucr) 质谱数据就像是一种化学指纹,向科学家展示了样品中的分子,例如空气,水或血液以及多少。它有助于识别从水中的污染物到新药的化学物质的所有物品。 在UC Riverside,大众查询语言或MassQL开发的功能,例如用于质谱数据的搜索引擎,使研究人员能够找到否则需要高级编程技能的模式。有关该语言的技术细节,以及如何帮助识别公共水道上的阻燃化学物质的一个例子,在新的《自然方法》杂志文章中描述了。 文章 “我们想给化学家和生物学家,他们通常也不是计算机科学家,他们可以准确地挖掘他们的数据的能力,而不必花几个月或数年的时间学习编码。” UCR计算机科学助理教授Mingxun Wang说。 展示了该语言的有效性,现在位于圣地亚哥分校的UCR博士后生Nina Zhao使用MassQL筛选了全世界的质谱数据,介绍了已向公众提供的水样品。她正在寻找有机磷酸酯,通常在阻燃剂中发现。 “从字面上看,这些数据中有十亿个分子的测量。您不能手动浏览它,”王说。 “但是,对于这些化学物质,该语言就像过滤器一样,它拔出了数千种。” (封面图片:PeopleImages/Istock/Getty)

UCR计算机科学家Mingxun Wang在他的实验室中。王为科学家创建了新的编程语言。 (stan lim/ucr)

质谱数据就像是一种化学指纹,向科学家展示了样品中的分子,例如空气,水或血液以及多少。它有助于识别从水中的污染物到新药的化学物质的所有物品。

在UC Riverside,大众查询语言或MassQL开发的功能,例如用于质谱数据的搜索引擎,使研究人员能够找到否则需要高级编程技能的模式。有关该语言的技术细节,以及如何帮助识别公共水道上的阻燃化学物质的一个例子,在新的《自然方法》杂志文章中描述了。

文章

“我们想给化学家和生物学家,他们通常也不是计算机科学家,他们可以准确地挖掘他们的数据的能力,而不必花几个月或数年的时间学习编码。” UCR计算机科学助理教授Mingxun Wang说。

展示了该语言的有效性,现在位于圣地亚哥分校的UCR博士后生Nina Zhao使用MassQL筛选了全世界的质谱数据,介绍了已向公众提供的水样品。她正在寻找有机磷酸酯,通常在阻燃剂中发现。

“从字面上看,这些数据中有十亿个分子的测量。您不能手动浏览它,”王说。 “但是,对于这些化学物质,该语言就像过滤器一样,它拔出了数千种。”(封面图片:PeopleImages/Istock/Getty)