蛋白质化学的新复杂性:算法发现被忽视的化学连接

蛋白质是生物学研究最多的分子之一,但是哥廷根大学的新研究表明,它们仍然可以拥有令人惊讶的秘密。研究人员在存档蛋白质结构中发现了先前未发现的化学键,揭示了蛋白质化学的意外复杂性。

来源:英国物理学家网首页
在氨基酸甘氨酸和半胱氨酸之间的新发现的新发现的氮氧硫的代表,称为NOS,NOS(蓝色:氮:氧,黄色:硫)。信用:Sophia Bazzi(蛋白质数据库的结构数据,使用COOT软件可视化)

蛋白质是生物学研究最多的分子之一,但是哥廷根大学的新研究表明,它们仍然可以拥有令人惊讶的秘密。研究人员在存档蛋白质结构中发现了先前未发现的化学键,揭示了蛋白质化学的意外复杂性。

这些新确定的氮氧硫硫(NOS)连接扩大了我们对蛋白质如何响应氧化应激的理解,在这种情况下,有害氧基的分子堆积并可能损害细胞的蛋白质,DNA和其他必要部分。新发现发表在通信化学中。

氧化应激 已发布 通信化学。

研究团队系统地重新分析了来自蛋白质数据库的86,000多个高分辨率蛋白质结构,蛋白质数据库是一个全球蛋白质结构的公共存储库,使用了一种新算法,他们开发了一种称为InsifliedyBondfinder的内部算法。该管道结合了机器学习,量子机械建模和结构改进方法,以揭示传统分析所遗漏的微妙化学键。

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出乎意料的是,NOS连接不仅限于先前已知的氨基酸对,而在精氨酸甲氨酸 - 半胱氨酸和甘氨酸 - 半胱氨酸之间也被发现。 NOS联系是由GöttingenUniversity的Kai Tittmann教授领导的研究首先发现的。

更多信息:Sophia Bazzi等人,通过系统地重新评估蛋白质结构,透露精氨酸 - 白素和甘氨酸 - 半胱氨酸NOS链接,通信化学(2025)。 doi:10.1038/s42004-025-01535-w

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