新研究揭示了“垃圾” DNA的隐藏调节作用

一项新的国际研究表明,曾经被视为“垃圾DNA”的东西实际上可能在调节基因表达中起着至关重要的作用。该研究的重点是嵌入人类基因组中的一组替元(TE)。 TES是起源于古代病毒的重复DNA序列。这些基因可以“跳”并改变[…]

来源:宇宙杂志
信用:Ashbi/Kyoto University

一项新的国际研究表明,曾经被视为“垃圾DNA”的东西实际上可能在调节基因表达中起着至关重要的作用。

该研究的重点是嵌入人类基因组中的一组可替代元素(TE)。

是起源于古代病毒的重复DNA序列。这些基因可以“跳跃”并改变其在染色体上的位置。

在芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock)于1983年发现之后,TES被认为没有已知的生物学功能,赢得了昵称垃圾DNA。

Barbara McClintock

然而,最近的研究表明,这种构成人类基因组的一半的“垃圾”可能具有更重要的作用。

“我们的基因组很久以前已经进行了测序,但其许多部分的功能仍然未知,”日本京都大学研究的作者Fumitaka Inoue博士说。

来自日本,中国,加拿大和美国的研究人员团队将他们的研究集中在一个相对年轻的TE序列中,称为MER11。

考虑到此序列以前已被现有基因组数据库分类不佳,研究团队设计了一种新方法。

他们不使用标准注释工具,而是将序列分为从最年轻到最年轻的亚家族。

团队发现这种新的分类方法与以前的模型更紧密地与实际调节功能保持一致。

测试基因表达,研究人员使用了一种称为慢病毒大规模平行报告基因测定法(Lentimpra)的技术,该技术允许一次测试数千个DNA序列。

lentimpra

他们这样做是为了测量近7,000个MER11序列对人和灵长类动物早期神经细胞和干细胞的影响。

结果表明,名为MER11_G4的最年轻的亚家族具有强大的基因表达能力并影响基因对外部和发育信号的反应。

古代病毒DNA 科学进步