研究揭示了“垃圾” DNA

一项新的国际研究表明,嵌入我们基因组中的古代病毒DNA,长期以来被视为遗传“垃圾”,实际上可能在调节基因表达中起着强大的作用。来自日本,中国,加拿大和美国的研究人员专注于一个名为MER11的序列家庭,表明这些因素已经发展为影响基因的开启和关闭方式,尤其是在早期人类发展中。

来源:英国物理学家网首页
一项新的国际研究表明,长期以来被视为遗传“垃圾”的古代病毒DNA实际上可能在调节基因表达中起着强大的作用。学分:Ashbi/Kyoto University

一项新的国际研究表明,嵌入我们基因组中的古代病毒DNA,长期以来被视为遗传“垃圾”,实际上可能在调节基因表达中起着强大的作用。来自日本,中国,加拿大和美国的研究人员专注于一个名为MER11的序列家庭,表明这些因素已经发展为影响基因的开启和关闭方式,尤其是在早期人类发展中。

这些发现发表在《科学进展》杂志上。

已发布 科学进步

转座元素(TES)是起源于古代病毒的基因组中的重复DNA序列。它们在数百万年的时间内通过复制和粘贴机制传播到整个基因组。

今天,TES构成了人类基因组的几乎一半。尽管他们曾经被认为没有任何有用的功能,但最近的研究发现,其中一些的作用像“遗传开关”,控制着附近基因在特定细胞类型中的活性。 但是,由于TE是高度重复的,并且通常在顺序上几乎相同,因此很难研究它们。特别是,像MER11这样的年轻家族在现有的基因组数据库中的分类很差,从而限制了我们了解其作用的能力。 为了克服这一点,研究人员开发了一种分类的新方法。他们没有使用标准注释工具,而是根据其进化关系以及它们在灵长类动物基因组中的保守程度分组。 这种新方法使他们可以将MER11A/B/C分为四个不同的亚家族,即MER11_G1至G4,从最古老到最年轻。 基因表达 转录因子 更多信息: doi:10.1126/sciadv.ads9164 www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ads9164 期刊信息:科学进展

今天,TES构成了人类基因组的几乎一半。尽管他们曾经被认为没有任何有用的功能,但最近的研究发现,其中一些的作用像“遗传开关”,控制着附近基因在特定细胞类型中的活性。

但是,由于TE是高度重复的,并且通常在顺序上几乎相同,因此很难研究它们。特别是,像MER11这样的年轻家族在现有的基因组数据库中的分类很差,从而限制了我们了解其作用的能力。

为了克服这一点,研究人员开发了一种分类的新方法。他们没有使用标准注释工具,而是根据其进化关系以及它们在灵长类动物基因组中的保守程度分组。

这种新方法使他们可以将MER11A/B/C分为四个不同的亚家族,即MER11_G1至G4,从最古老到最年轻。 基因表达 转录因子 更多信息: doi:10.1126/sciadv.ads9164

www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ads9164期刊信息:科学进展