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开源计算工具阐明了“ Wiggly”蛋白质
最研究的蛋白质被折叠，这意味着它们具有定义的三维形状，有助于确定每个蛋白质的特定功能。但是，随着科学工具的改善，人们也了解到，即使进行重要的细胞过程，许多重要的蛋白质（或蛋白质的部分）也没有保持固定形状。
来源:英国物理学家网首页最研究的蛋白质被折叠，这意味着它们具有定义的三维形状，有助于确定每个蛋白质的特定功能。但是，随着科学工具的改善，人们也了解到，即使进行重要的细胞过程，许多重要的蛋白质（或蛋白质的部分）也没有保持固定形状。
称为本质上无序的蛋白质，这些摇摆不定的结构持续运动，因此很难研究。尽管诸如Alphafold之类的计算工具（赢得了2024年诺贝尔化学奖）具有变革性的变革性，用于了解折叠蛋白的工作原理，但Alphafold在研究这些摇摆不定的蛋白质方面效果不佳。
计算工具对这些形状转变蛋白的更好理解可以识别以前未知的人类疾病原因，并为新疗法提供了新的方法。
现在，由生物化学和分子生物物理学助理教授Washu医学杂志发表在《科学》杂志上的研究，描述了他的团队开发的一种计算方法，旨在帮助预测固有无序的蛋白质如何表现。
已发布 分子生物物理学 计算方法该工具分析了蛋白质的构建块的化学相互作用，称为氨基酸，并预测哪些无序蛋白质的位将吸引或对体内其他分子的抑制作用。通过仅基于化学的预测，该方法即使在没有定义的3D结构的情况下，科学家也可以对相互作用进行建模。
构建块 氨基酸Finches是开源的，调查人员可作为GitHub上和Web服务器上的Python软件包。
Python软件包 Web服务器 更多信息： doi：10.1126/science.adq8381期刊信息：科学
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