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基因组和甲基组学特征与两种近亲狼蛛基因组稳定性维持和适应性进化相关
两种近缘狼蛛的基因组和甲基化特征与维持基因组稳定性和适应性进化有关摘要帕多萨蜘蛛属于狼蛛科,由于其在害虫控制方面的作用,在维持森林和农业生态系统的健康方面发挥着至关重要的作用。这项研究展示了两种近缘帕多萨蜘蛛物种 P. laura 和 P. agraria 的染色体水平基因组组装。这两个物种的基因组都显示出 helitron 转座因子的显著扩增,这导致它们的基因组尺寸较大。甲基化组分析表明,与 P. agraria 相比,P. laura 具有更高的整体 DNA 甲基化水平。DNA 甲基化不仅可能有助于转座因子驱动的基因组扩增,而且还会在转座子扩增后对 P. laura 的三维组织产生积极影响,从而可能增强基因组稳定性。与 P. agraria 相比,P. laura 中与高差异甲基化区域相关的基因在与 mRNA 加工和能量产生相关的功能方面富集。此外,转录组和甲基组分析相结合揭示了 DNA 甲基化和基因表达之间复杂的调控相互作用,强调了基因体甲基化在基因表达调控中的重要作用。比较基因组分析显示,P. laura 中角质层蛋白和解毒相关基因家族显著扩增,这可能会改善其适应性
来源:Arácnidopardosa蜘蛛在维持森林和农业生态系统的健康中起着至关重要的作用,因为它们在害虫控制中的功能。这项研究介绍了两种盟友P. Laura和P. agraria的染色体水平基因组组件。这两种物种的基因组都均显示出可显着的旋转元素的膨胀,这有助于其大型基因组大小。甲基分析表明,与阿格拉里亚假单胞菌相比,劳拉假单胞菌的总DNA甲基化水平更高。 DNA甲基化不仅可能有助于转座元件驱动的基因组扩展,而且还积极影响了转座子扩增后的劳拉(P. laura)的三维组织,从而有可能增强基因组稳定性。与劳拉假单胞菌(与阿格拉里亚假单胞菌相比)中与超差甲基化区域相关的基因富含与mRNA加工和能量产生有关的功能。此外,结合转录组和甲基化体分析已经发现了DNA甲基化和基因表达之间的复杂调节相互作用,强调了基因体甲基化在基因表达调节中的重要作用。比较基因组分析表明,劳拉(P. Laura)中角质层蛋白和与解毒相关的基因家族的显着扩展,这可能会改善其对各种栖息地的适应性。这项研究提供了必不可少的基因组和甲基甲基洞察,从而更深入地了解可替代元件与基因组稳定性之间的关系,并阐明了盟军蜘蛛之间的适应性进化和物种分化。
pardosa pardosa P. Laura P. Agraria P. 劳拉 P. Agraria P. 劳拉 P. 劳拉 P. Agraria P. 劳拉 分子生态资源 https://doi.org/10.1111/1755-0998.14071