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巨型醋蛛 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征摘要在蛛形纲动物中，染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中，研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝，该进化枝由三个目组成，这三个目构成了蜘蛛的姊妹群，它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一空白。我们表明，这种高度完整的基因组保留了许多基因家族的原形条件，这些基因家族在更多样化的蜘蛛中经历了谱系特异性衍生。与 Uropygi 的系统发育位置一致，M. giganteus 基因组中的大合线证实了古老的全基因组复制的特征。Siddharth S Kulkarni、Benjamin C Klementz、Prashant P Sharma，巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组表现出前志留纪全基因组复制的特征，Journal of Heredity，2024；，esae074，https://doi.org/10.1093/jhered/esae074
来源:Arácnido巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征
摘要
在蛛形纲动物中，染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中，研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝，该进化枝由三个目组成，形成蜘蛛的姊妹群，它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一空白。我们表明，这个高度完整的基因组保留了许多基因家族的原形条件，这些基因家族在更多样化的蜘蛛中经历了谱系特异性衍生。与Uropygi的系统发育位置一致，M. giganteus基因组中的大合线证实了古代全基因组重复的特征。
Siddharth S Kulkarni，Benjamin C Klementz，Prashant P Sharma，巨型醋龙的染色体水平基因组 Mastigoproctus giganteus 表现出前志留纪全基因组重复的特征， 遗传杂志 ，2024；，esae074， https://doi.org/10.1093/jhered/esae074