探索 Gnaphosidae 蜘蛛的遗传多样性:iPBS 标记在 Araneae 中的首次应用

作者:Benedikt - 最初以 Callilepis nocturna 的身份发布到 Flickr,CC BY-SA 2.0,https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=10205912探索 Gnaphosidae 蜘蛛的遗传多样性:iPBS 标记在 Araneae 中的首次应用抽象Araneae 是蛛形纲中最常见的群体之一(门:节肢动物门)表现出极大的形态多样性,约有 51 000 种。蜘蛛科(Araneae)是一个分布广泛的科,是蜘蛛科中物种数量最多、多样性最丰富的科之一。 DNA 指纹分析尽管数据含量很高,但很少用于蜘蛛的遗传多样性研究。在当前的研究中,研究了引物间结合位点(iPBS)标记作为在物种水平上区分蜘蛛标本的工具的效用。这项研究使用了 10 个属、28 个种的 89 个样本,使用三种 iPBS 引物扩增了 226 个条带,并表现出 100% 的多态性模式。对条带模式评分产生的二元矩阵用于定义引物参数 PIC(多态性信息内容)、D(辨别能力)、R(分辨能力)、h(Nei’s 基因多样性)和 I(香农信息指数)。三个引物的平均 PIC 和 D 值分别为 0.15 和 0.99。对 89 个样本进行了未加权配对算术平均法 (UPGMA) 树状图的评估,并在样本之间进行了清晰的划分

来源:Arácnido

探索 Gnaphosidae 蜘蛛的遗传多样性:iPBS 标记在 Araneae 中的首次应用

摘要

蛛形纲是蛛形纲(节肢动物门)中最常见的类群之一,具有极大的形态多样性,约有 51 000 种。蜘蛛科(Araneae)是一个分布广泛的科,是蜘蛛科中物种数量最多、多样性最丰富的科之一。 DNA 指纹分析尽管数据含量很高,但很少用于蜘蛛的遗传多样性研究。在当前的研究中,研究了引物间结合位点(iPBS)标记作为在物种水平上区分蜘蛛标本的工具的效用。这项研究使用了由 10 属 28 种 Gnaphosidae 组成的 89 个样本,使用三种 iPBS 引物扩增了 226 个条带并表现出 100% 多态性模式。对条带模式评分产生的二元矩阵用于定义引物参数 PIC(多态性信息内容)、D(辨别能力)、R(分辨能力)、h(Nei’s 基因多样性)和 I(香农信息指数)。三个引物的平均 PIC 和 D 值分别为 0.15 和 0.99。对 89 个样本进行了未加权配对算术平均法 (UPGMA) 树状图的评估,并观察到了物种之间的清晰划分。贝叶斯分析支持使用 iPBS 引物获取的样本之间的种内和种间区别。这些结果表明,iPBS 标记系统是一种经济高效、快速且强大的方法,可用于检查 Gnaphosidae 物种的遗传多样性和种内变异。本研究是首次尝试研究 iPBS 标记系统对蜘蛛目的适用性。