1加利福尼亚大学大气科学系,洛杉矶,加利福尼亚州90024,美国2 Max-Planck-Institut Ftir Meteorologie,W-000 Hamburg,FRG 3 Koninklijk Nederlands MeteOllands MeteOlogisch Instituut劳伦斯·利维莫尔国家实验室,利维莫尔,加利福尼亚州94550,美国6国家大气研究中心博尔德,80307,美国7,美国7地球物理学与行星物理学研究所,加利福尼亚州洛杉矶,CA 90024,CA 90024,美国,美国,美国霍克学会,霍克斯大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学。美国新泽西州普林斯顿实验室,美国10大气与海洋科学计划,普林斯顿大学,普林斯顿大学,新泽西州08542,美国11,美国11级水流过程实验室,NASA Goddard太空飞行中心,Greenbelt,Greenbelt,MD 20771,美国MD 20771,USA,USA,美国12个气象研究所,日本12-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-纳吉米,tsukuba,tsukuba,tsukuba,tsukuba,我
癌症疗法的发展受到合适药物靶点的限制。可以根据合成致死率 (SL) 的概念来识别潜在的候选药物靶点,SL 指的是基因对,对于这些基因对来说,单独一个基因的畸变不会致命,但畸变同时发生则会对细胞造成致命影响。在这里,我们介绍了 SLIdR(R 中的合成致死率识别),这是一个用于从大规模扰动筛选中识别 SL 对的统计框架。即使样本量很小,SLIdR 也能成功预测 SL 对,同时最大限度地减少假阳性靶点的数量。我们将 SLIdR 应用于 Project DRIVE 数据,并找到已建立和潜在的泛癌症和癌症类型特异性 SL 对,这与文献和药物反应筛选数据的结果一致。我们通过实验验证了肝细胞癌中预测的两种 SL 相互作用(ARID1A-TEAD1 和 AXIN1-URI1),从而证实了 SLIdR 识别潜在药物靶点的能力。
糖尿病是全球最重要的公共卫生问题之一,对全球公共卫生和社会经济发展造成了沉重的负担。尽管某些国家的发病率已经开始降低,但近几十年来,其他发达国家和发展中国家的糖尿病患病率也有所增加(1)。2型糖尿病(T2D)约占糖尿病病例的90%(2),根据世界卫生组织的说法,即使在年轻人中,被诊断为T2D的人数也在增加(2)。T2D的发展主要是由不健康的生活方式以及环境和遗传因素的相互作用引起的。尽管其中一些因素受到个人控制,例如生活方式,但其他因素却没有,例如年龄,性别和遗传学的增加。饮食也归因于T2D的风险(3,4)。在许多前瞻性研究中已经确认了这种关联(5-8)。此外,T2D是一种越来越普遍的代谢疾病,引起严重的微血管并发症,即心血管疾病(CVD),视网膜病变,神经病和肾病(3,9)。此外,据报道,减肥或生活方式改良的有益影响可以预防,延迟和减少疾病的发生率(2,10)。因此,对整体饮食模式(习惯食品和营养摄入量)的有效估计已成为研究饮食与健康状况之间关系的基本方面(8)。一般饮食习惯可以提供超出营养和单一食物作用的见解(2,11)。基于食品和食物组的RF,MDS和AMDS某些指数基于国家营养建议和国家饮食指南,这些指南评估了整体营养模式,包括健康饮食指数,替代健康饮食指数,健康饮食指标,推荐食品评分(RFS),饮食质量指数,饮食质量指数,饮食质量质量评分,地中海饮食评分(MDS)以及替代地中海饮食(MDS)和替代饮食(AMDS)。
植物病原体对农作物生产造成严重破坏,对农业和自然生态系统构成威胁。深入了解植物-病原体相互作用对于制定创新的农作物疾病控制和环境保护策略至关重要(Bulasag 等人)。尽管数十年来一直致力于研究植物免疫的复杂性,但理解不同宿主和微生物之间复杂的跨界相互作用仍然具有挑战性。这本 Frontiers 电子书“植物病原体相互作用中的植物防御机制”提供了 19 篇文章,涵盖了植物与病原体之间各种机制的研究。本摘要旨在为在一系列植物-病原体相互作用中控制植物免疫的复杂机制提供新的视角和新见解。
植物激素生长素调节植物生长和发育的许多重要方面(Lavy and Estelle,2016年)。越来越多的证据表明生长素调节植物宿主与其相关微生物之间的相互作用,包括有益的共生体,内生菌和引起疾病的致病生物。因此,生长素也被微生物生成或分解了影响宿主信号,生理和发育不足为奇。此外,最近的研究表明,生长素(尤其是吲哚-3-乙酸,IAA)可以充当信号分子,直接影响微生物发育和/或基因表达(Kunkel and Johnson,2021)。在本研究主题中,我们邀请研究人员提交文章,调查生长素影响宿主和/或微生物生物学的各种方式。自2021年底发布电话以来,我们仅收到了与此主题相关的少数手稿。在事后看来,考虑到这一调查领域的新事物,这并不意外。本研究主题中的四篇文章报告报告了通过植物相关的微生物和生长素在调节植物微生物相互作用中的作用来推进IAA的合成和修饰。
1植物医疗系,安登国立大学,安东斯36729,大韩民国; smvahsan@gmail.com 2 Applied Biosciences,Kyungpook国立大学,Daegu 41566,大韩民国; inmamumrassel@gmail.com(m.i.-u.-h.); ashim@knu.ac.kr(a.k.d.)3植物与土壤科学系,美国德克萨斯州科技大学基因组学研究所,德克萨斯理工大学,德克萨斯州拉伯克,美国德克萨斯州79409; mrahman@bsmrau.edu.bd 4 4602,杜姆基杜姆基Patuakhali科学技术大学昆虫学系8602; mahiimam@pstu.ac.bd 5 5 Kumho Life Science Laboratory,Chonnam国立大学,Gwangju 61186,大韩民国; ncpaulcnu@gmail.com 6大加工大学大麻生物技术学院,朝鲜共和国安东斯36729 *通信:hwchoi@anu@anu.ac.kr3植物与土壤科学系,美国德克萨斯州科技大学基因组学研究所,德克萨斯理工大学,德克萨斯州拉伯克,美国德克萨斯州79409; mrahman@bsmrau.edu.bd 4 4602,杜姆基杜姆基Patuakhali科学技术大学昆虫学系8602; mahiimam@pstu.ac.bd 5 5 Kumho Life Science Laboratory,Chonnam国立大学,Gwangju 61186,大韩民国; ncpaulcnu@gmail.com 6大加工大学大麻生物技术学院,朝鲜共和国安东斯36729 *通信:hwchoi@anu@anu.ac.kr
气候变化是对生物多样性和生态系统功能的最严重威胁之一。当前的温度变化速率主要由化石燃料的人类组合驱动,远远超过至少10,000年(较低的PleistoCene)和更长的时间(IPCC,2014年)。最后一次重大的气候变化事件引起了巨大的灭绝,导致许多大型四足动物突然灭亡,包括诸如羊毛猛mm,羊毛犀牛,毛s,牛皮龙,巨型麋鹿,巨型麋鹿,saber齿的虎和dire虎[1]等特征物种[1]。在先前的气候变化事件时,景观之间的主要差异之一是当前的景观是,生物圈现在由单个物种Homo Sapiens Sapiens主导,该物种已深刻改变并简化了许多陆地和水生生态系统。因此,除了气候变化外,自然生态系统还因其他人类引起的变化而改变了,包括森林砍伐,富营养化,过度收获,非本地物种的引入和各种类型的污染。因此,物种和种群受到多种压力源的挑战,使他们更难适应气候制度的快速变化。人们可以强烈认为我们不再生活在全新世,而是在人类世[2,3]。
根瘤菌是土壤细菌,可以与豆科植物建立氮固定共生。作为水平传播的共生体,根瘤菌的生命周期包括土壤中的自由生活阶段和植物相关的共生阶段。在整个生命周期中,根瘤菌暴露于与它们相互作用的无数其他微生物中,从而调节其拟合度和共生性能。在这篇综述中,我们描述了根茎与其他微生物之间相互作用的多样性,这些微生物在根际,结节开始和结节中可能发生。这些根瘤菌 - 微生物相互作用中的某些是间接的,并且发生某些微生物的存在以一种以根瘤菌的方式反馈的植物生理学的存在。我们进一步描述了这些相互作用如何对根瘤菌施加显着的选择性压力并修改其进化轨迹。对复杂的生物环境中根茎的生态进化动力学进行更广泛的研究可能会揭示出这种认真的共生相互作用的引人入胜的新方面,并为未来的农艺应用提供了关键的知识。
尽管Vision Transformer(VIT)在计算机视觉方面取得了显着的成功,但由于缺乏内部绘制互动和特征量表的多样性有限,它在密集的预测任务中表现不佳。大多数现有的研究致力于设计视觉特定的变压器来解决上述问题,从而涉及额外的培训前成本。因此,我们提出了一种普通的,无培训的且具有特征增强的vit背骨,并具有指定性的特征性动作,称为Vit-Comer,可促进CNN和Transformer之间的双向相互作用。与现状相比,VIT-COMER具有以下优点:(1)我们将空间金字塔多触发性场卷积特征注入VIT体系结构,从而有效地减轻了VIT中局部信息相互作用和单场表述的有限问题。(2)我们提出了一个简单有效的CNN转换器双向交互模块,该模块在跨层次特征上执行多尺度融合,这对Han-dling密集的预测任务有益。(3)我们评估了在各种密集的预测任务,不同框架和多个高级预训练中VIT-COMER的能力。值得注意的是,我们的VIT-COMER-L在没有额外训练数据的情况下可可Val2017上的AP达到64.3%,而ADE20K Val上的MIOU为62.1%,这两种方法都与最先进的方法相当。我们希望VIT-COMER可以作为密集预测任务的新骨干,以促进未来的研究。该代码将在https://github.com/traffic-x/vit-comer上发布。
