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隧道尽头的光明：非小细胞肺癌KRAS突变亚型的临床特征和治疗前景
肺癌是最常见的癌症死亡原因之一，非小细胞肺癌（NSCLC）约占所有肺癌病例的85%。KRAS是RAS家族三种亚型之一，是与人类癌症相关的最常见致癌基因，并编码肿瘤中的关键信号蛋白。30%的NSCLC病例认为KRAS致癌突变是起始因素，占与驱动突变相关的NSCLC病例的最大比例。由于传统的小分子抑制剂难以有效抑制KRAS的相关功能，因此KRAS蛋白被称为“无药可用靶点”。然而，近年来，KRAS基因中一种常见突变——甘氨酸12突变为半胱氨酸（G12C）的发现，带来了共价抑制剂的设计和合成，为有效靶向KRAS提供了新的策略。本综述对KRAS的结构、功能、信号转导通路等进行了综述，并讨论了NSCLC中KRAS突变亚型（特别是G12C、G12V、G12D）可用的治疗策略和潜在的治疗前景，为NSCLC治疗中选择KRAS突变亚型提供参考。
利用下一代肺泡 2 型类器官平台模拟肺腺癌的多种遗传亚型
肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因。肺腺癌 (LUAD) 是最常见的组织学亚型，占所有病例的 40%。虽然现有的基因工程小鼠模型 (GEMM) 重现了人类 LUAD 的组织学进展和转录进化，但它们耗时且技术要求高。相比之下，细胞系移植模型快速灵活，但这些模型无法捕捉疾病进展的全部范围。类器官技术提供了一种创建下一代癌症模型的方法，该模型整合了自体系统和基于移植的系统的最有利特征。然而，目前缺乏强大而可靠的 LUAD 类器官平台。在这里，我们描述了在类器官培养中持续扩增小鼠肺泡 2 型 (AT2) 细胞（LUAD 的主要起源细胞）的优化条件。这些类器官表现出 AT2 细胞的典型特征，包括标记基因表达、层状体的存在以及分化为 AT1 谱系的能力。我们利用该系统开发了灵活且多功能的免疫功能正常的类器官模型，用于 KRAS 、 BRAF 和 ALK 突变型 LUAD。值得注意的是，类器官肿瘤表现出广泛的负担和完全渗透性，并且在组织病理学上与原发肿瘤没有区别。总之，该类器官平台是一个功能强大、用途广泛的新型 LUAD 研究模型系统。
共识分子亚型 4 (CMS4) 靶向治疗原发性结肠癌：一项概念验证研究
1 荷兰乌得勒支大学医学中心影像与癌症科转化肿瘤学实验室，2 荷兰乌得勒支大学医学中心病理学系，3 荷兰阿默斯福特 Meander 医学中心内科系，4 荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心内科/肿瘤学系，5 荷兰阿默斯福特 Meander 医学中心胃肠病学系，6 荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯医学中心肿瘤内科系，7 荷兰乌得勒支大学医学中心胃肠病学系，8 荷兰乌得勒支 Diakonessenhuis 胃肠病学系，9 荷兰乌得勒支大学医学中心影像与癌症科外科肿瘤学系，荷兰，10 乌得勒支大学医学中心肿瘤医学系，乌得勒支大学，荷兰乌得勒支，
重新定义乳腺癌亚型以指导治疗优先次序并最大程度提高疗效：10 种癌症疗法中的预测生物标志物
† 主要联系人和通讯作者：Denise Wolf 博士，加利福尼亚大学旧金山分校实验室医学系，2340 Sutter Street，旧金山 CA 94115，denise.wolf@ucsf.edu。其他通讯作者：Christina Yau cyau@buckinstitute.org，Laura van 't Veer laura.vantveer@ucsf.edu。作者贡献 DMW 和 CY 对本研究的贡献相同。DMW、CY、LV、JW 和 EFP 设计了这项研究，解释了数据，并与 LE 和 LP 一起准备和审阅了手稿。DMW 和 CY 在 PEL、ZZ、MM 和 AB 的协助下分析了数据。JW、IRG 和 EFP 生成了 RPPA 数据。LBS 领导 I-SPY 实验室，负责监督分子检测。NO 管理数据。 GLH 管理由 LV 领导的生物标志物工作组，成员包括 DMW、CY、JW、LBS、MM、RS、AB、AD、MCL、JPC 和 WFS。LS 管理 I-SPY2/2.2 P01；JP 和 AD 是患者倡导者；NL、MCL、PP、WFS、HSR、CI、AMD、DY 是 I-SPY2 工作组负责人。SMA 管理 I-SPY 试验运营；RL 和 JB 是试验统计员；LE、DB 和 NH 是 I-SPY2 的主要研究人员。I-SPY2 试验研究人员和生物标志物及其他工作组成员参与试验的各个方面，并为试验的成功做出贡献。所有作者都参与了稿件的准备和审查。*贡献相同
重新定义乳腺癌亚型以指导治疗优先次序并最大程度提高疗效：10 种癌症疗法中的预测生物标志物
† 主要联系人和通讯作者：Denise Wolf 博士，加利福尼亚大学旧金山分校实验室医学系，2340 Sutter Street，旧金山 CA 94115，denise.wolf@ucsf.edu。其他通讯作者：Christina Yau cyau@buckinstitute.org，Laura van 't Veer laura.vantveer@ucsf.edu。作者贡献 DMW 和 CY 对本研究的贡献相同。DMW、CY、LV、JW 和 EFP 设计了这项研究，解释了数据，并与 LE 和 LP 一起准备和审阅了手稿。DMW 和 CY 在 PEL、ZZ、MM 和 AB 的协助下分析了数据。JW、IRG 和 EFP 生成了 RPPA 数据。LBS 领导 I-SPY 实验室，负责监督分子检测。NO 管理数据。 GLH 管理由 LV 领导的生物标志物工作组，成员包括 DMW、CY、JW、LBS、MM、RS、AB、AD、MCL、JPC 和 WFS。LS 管理 I-SPY2/2.2 P01；JP 和 AD 是患者倡导者；NL、MCL、PP、WFS、HSR、CI、AMD、DY 是 I-SPY2 工作组负责人。SMA 管理 I-SPY 试验运营；RL 和 JB 是试验统计员；LE、DB 和 NH 是 I-SPY2 的主要研究人员。I-SPY2 试验研究人员和生物标志物及其他工作组成员参与试验的各个方面，并为试验的成功做出贡献。所有作者都参与了稿件的准备和审查。*贡献相同
CRISPR 介导的 αV 整合素亚型激活... - ArTS
神经元分化是一个复杂的过程，其功能障碍会导致脑部疾病。开发新工具以针对神经元分化过程中的特定步骤至关重要，这有利于更好地理解所涉及的分子机制，并最终为神经发育障碍制定有效的治疗策略。通过与细胞外基质蛋白的相互作用，整合素家族的细胞粘附分子通过调节细胞迁移、神经突生长、树突棘形成和突触可塑性，在功能性神经元回路的形成中发挥重要作用。然而，不同的整合素受体如何促进神经元分化的连续阶段仍有待阐明。在这里，我们实施了一个 CRISPR 激活系统来增强特定整合素亚基在神经元分化的体外模型（鼠神经母细胞瘤 Neuro2a 细胞系）中的内源性表达。通过将 CRISPR 激活与形态学和 RT-qPCR 分析相结合，我们表明 α V 家族的整合素是神经元分化的强大诱导剂。此外，我们确定了 α V 整合素在控制神经突生长方面具有亚型特异性作用。虽然 α V β 3 整合素在增殖条件下启动 Neuro2a 细胞的神经元分化，但 α V β 5 整合素似乎负责促进已分化细胞中的复杂树突分化。有趣的是，原代神经元在发育过程中表现出 β 3 和 β 5 整合素亚基的互补表达模式。我们的研究结果揭示了分化过程中 α V 整合素亚型之间存在发育转换，并表明 CRISPRa 及时控制调节 α V 整合素的表达提供了一种促进神经元分化的方法。
对现实世界中大量小细胞肺癌患者的综合分析，可识别出不同的基因亚型，并深入了解组织学转化
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2022 年 7 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.07.27.501738 doi：bioRxiv 预印本
重新定义乳腺癌亚型以指导治疗优先次序并最大程度提高疗效：10 种癌症疗法中的预测生物标志物
Denise M. Wolf, 1 , 17 , 18 , * Christina Yau , 2 , 17 , * Julia Wulfkuhle , 3 Lamorna Brown-Swigart , 1 Rosa I. Gallagher , 3 Pei Rong Evelyn Lee , 1 Zelos Zhu , 2 Mark J. Magbanua , 1 Rosalyn Sayaman , 1 Nicholas O'Grady , 2 Amrita Basu , 2 my Delson, 4 Jean Philippe Coppe ́ , 1 Ruixiao Lu, 5 Jerome Braun, 5 I-SPY2 Investigators, Smita M. Asare, 5 Laura Sit, 2 Jeffrey B. Matthews, 2 Jane Perlmutter, 6 Nola Hylton, 7 Minetta C. Liu, 8 Paula Pohlmann, 9 W. Fraser Symmans, 11 Claudine Isaacs, 12 Angela M. DeMichele, 13 Douglas Yee, 14 Donald A. Berry, 15 Lajos Pusztai, 16 Emanuel F. Petricoin, 3 Gillian L. Hirst, 2 Laura J. Esserman, 2 and Laura J. van 't Veer 1 , * 1 Department of Laboratory Medicine, University of California, San Francisco, 2340 Sutter Street, San Francisco, CA 94143, USA 2 Department of Surgery, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94143, USA 3 Center for Applied Proteomics and Molecular Medicine, George Mason University, Manassas, VA 20110, USA 4 Breast Science Advocacy Core, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94143, USA 5 Quantum Leap Healthcare. San Francisco, CA 94118, USA 6 Gemini Group, Ann Arbor, MI 48107, USA 7 Department of Radiology, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94143, USA 8 Department of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN 55905, USA 9 MedStar Georgetown University Hospital of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030, USA 11 Division of Hematology/Oncology, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA 12 Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University, Washington, DC 20007, USA s, MN 55455, USA 15 Berry Consultants, LLC, Austin, TX 78746, USA 16 These authors contributed equally 18 Lead contact *Correspondence: denise.wolf@ucsf.edu (DMW), cyau@buckinstitute.org (CY), laura.vant veer@ucsf.edu (LJvV) https://doi.org/10.1016/j.ccell.2022.05.005
通过亚型和分期推断揭示皮层基底节综合征和进行性核上性麻痹的脑萎缩时间进展模式 (SuStaIn)
区分表现为皮层基底节综合征 (CBD-CBS) 的皮层基底节变性与伴有理查森综合征的进行性核上性麻痹 (PSP-RS)，尤其是在早期阶段，通常很困难，因为这两种神经退行性疾病在临床表现和病理方面非常相似。尽管已经对 CBS 和 PSP-RS 患者的脑磁共振成像 (MRI) 体积测定进行了研究，但评估脑萎缩进展的研究有限。因此，我们旨在纯粹基于横断面数据，使用亚型和阶段推断 (SuStaIn)——一种集成了聚类和疾病进展模型的新型无监督机器学习技术，揭示 CBS 患者和 PSP-RS 患者脑萎缩时间进展模式的差异。我们将 SuStaIn 应用于 25 名 CBS 患者、39 名典型 PSP-RS 患者和 50 名健康对照者的横断面区域脑体积，以估计 CBS 和 PSP-RS 两种疾病亚型和轨迹，它们具有不同的萎缩模式。将 CBS 和 PSP-RS 的进展模型和分类准确度与之前的研究进行比较，以评估 SuStaIn 的性能。SuStaIn 确定了 CBS 和 PSP-RS 脑萎缩的不同时间进展模式，这与之前的证据基本一致，在交叉验证下具有高可重复性（99.7%）。我们基于横断面结构性脑 MRI 数据对这些疾病进行了高精度（0.875）和高精度（分别为 0.680 和 1.000）分类，其精度高于之前研究的报告值。此外，SuStaIn 分期正确反映了疾病的严重程度，而无需疾病分期标签，例如疾病持续时间。此外，SuStaIn还表现出了分化能力
IQ亚型，大脑体积和免疫标记 毒理学 - UCL发现 - 伦敦大学学院 在正常范围内HBA1C之间的关联... 在支持1型糖尿病决策中以人为中心的机器学习的共同设计机会 预测电池的稳定锂铁硫化物... 远程随机电路中的运输和纠缠增长 定量评估临床前铸造的原代基因编辑人干细胞中染色体重排的定量评估 Neuroml-DB：共享和表征数据驱动的神经科学模型 数据注释人群神经影像学：全面的生成 关于安迪·派克（Andy Pike）地理政治经济学的评论 终生并通过细胞改善欧洲医疗保健 - 社论：衰老神经科学的深度学习 2型糖尿病在患者症状归因中的作用... 基于挑战性髓鞘的深度学习分割 布鲁顿的酪氨酸激酶抑制剂：一种新的治疗疗法... 胆固醇酯转移蛋白作为心血管疾病的药物靶标 大脑通信 - UCL发现 热还原石墨烯/MXENE膜，用于增强的li- ... 第2章能源安全的定义
1。UCL皇后广场神经病学研究所，英国伦敦UCL皇后广场研究所2.心理医学学院，心理学和神经科学研究所，英国伦敦国王学院，英国伦敦国王学院3.大脑映射单元，精神病学系，剑桥大学Herchel Smith大脑和心理科学大楼。精神病学部，英国伦敦帝国学院帝国学院； 5。 英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。 MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，精神病学部，英国伦敦帝国学院帝国学院； 5。英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。 MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。英国伯明翰大学心理健康研究所。10。爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，