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白皮书 - 人类疾病研究的全长和单细胞同工型测序
转录本同工型是人类发育和疾病的关键动力。在散装和单细胞转录组中的全长同工型测序可以表征复杂的替代剪接，开放式读取框（ORF）的预测以及鉴定细胞类型特异性，等位基因特异性的同工型表达式。简短的读数只能提供基因级信息，并且通常呈现同工型的不完整或错误组装的表示。PACBIO®ISO-SEQ®方法和Kinnex™试剂盒利用高度准确的HIFI测序来捕获全长的转录本，而无需组装。这可以使同工型水平的转录组进行更高的分辨率图，这对于理解人类生物学和疾病中的功能性细胞多样性和动态表达至关重要。
表达全长刺突蛋白的改良安卡拉痘苗 SARS-CoV-2 疫苗
摘要 迫切需要开发疫苗来预防 SARS-CoV-2 感染并减轻 COVID-19 大流行。在这里，我们开发了两种基于改良安卡拉痘苗 (MVA) 的疫苗，它们表达在融合前状态稳定的膜锚定全长刺突蛋白 (MVA/S) 或形成三聚体并分泌的刺突的 S1 区 (MVA/S1)。两种免疫原都含有受体结合结构域 (RBD)，这是抗体介导的中和的已知靶标。用 MVA/S 或 MVA/S1 免疫后，两种刺突蛋白重组体均诱导了针对纯化的全长 SARS-CoV-2 刺突蛋白的强 IgG 抗体。MVA/S 对纯化的 RBD、S1 和 S2 诱导了强烈的抗体反应，而 MVA/S1 诱导了对 RBD 区域外的 S1 区域的抗体反应。两种疫苗均在肺部诱发抗体反应，并与支气管相关淋巴组织的诱导有关。接种 MVA/S 而非 MVA/S1 疫苗的小鼠对 SARS-CoV-2 产生了强大的中和抗体反应，这与 RBD 抗体结合滴度密切相关。从机制上讲，S1 与 ACE-2 的结合很强，但在室温下长时间预孵育后会降低，这表明 RBD 会随时间发生变化。这些结果表明 MVA/S 是针对 SARS-CoV-2 感染的潜在候选疫苗。
BTK 活性位点抑制剂对全长 BTK 构象状态的不同影响
摘要布鲁顿酪氨酸激酶 (BTK) 是治疗 B 细胞疾病（包括白血病和淋巴瘤）的靶向药物。目前已获批准的 BTK 抑制剂，包括伊布替尼（一种首创的 BTK 共价抑制剂），可直接与激酶活性位点结合。虽然药物结合可有效阻断 BTK 的催化活性，但药物结合对全长 BTK 整体构象的影响尚不清楚。在这里，我们发现了一组活性位点抑制剂在全长 BTK 中引起的一系列构象效应，包括调节域构象平衡的大规模转变。此外，我们发现 BTK SH2 结构域中的远程伊布替尼抗性突变 T316A 通过破坏全长 BTK 的紧凑自抑制构象来驱动虚假的 BTK 活性，使构象集合远离自抑制形式。 BTK 抑制剂的未来开发将需要考虑抑制剂结合的长期变构后果，包括这些 BTK 抑制剂在治疗 COVID-19 中的新兴应用。
微生物组种类分析，用于全长16S rRNA测序的kinnex套件
结果表明，Kinnex 16S测序可以在单个Revio SMRT单元格上以1,536-plex或在续集IIE SMRT单元格上的768-plex下的平均读数> 30k平均读数。图5a显示了续集II系统上的常规全长16S库的显示2.1-330万（M）的读取，而Kinnex则显示为19.6-28.4 m，在Revio系统上，从8.5-10.1 m的Revio系统上读取，而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。 此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。 将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较，我们发现物种组成有很高的相关性（图5B）。 在20种物种的微生物标准上，Kinnex 16S库与预期的物种表示相比，由于读取深度较高，因此与常规16S库相关（图5C）。显示2.1-330万（M）的读取，而Kinnex则显示为19.6-28.4 m，在Revio系统上，从8.5-10.1 m的Revio系统上读取，而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较，我们发现物种组成有很高的相关性（图5B）。在20种物种的微生物标准上，Kinnex 16S库与预期的物种表示相比，由于读取深度较高，因此与常规16S库相关（图5C）。
使用 Cas9 和 AAV 研究全长 CFTR cDNA 替换引起的不利基因组和调控变化
一种替代全长 CFTR cDNA 的“通用策略”可治疗 99% 以上的囊性纤维化 (pwCF) 患者，无论他们的具体突变如何。基于 Cas9 的基因编辑被用于在气道基底干细胞的 CFTR 基因座处插入 CFTR cDNA 和截短的 CD19 (tCD19) 富集标签。该策略将 CFTR 功能恢复到非 CF 水平。在这里，我们通过评估 CFTR cDNA 插入后的基因组和调控变化来研究这种方法的安全性。首先通过使用 CAST-seq 量化基因重排来评估安全性。在验证编辑和富集的气道细胞中恢复的 CFTR 功能后，使用 ATAC-seq 表征 CFTR 基因座开放染色质谱。使用 scRNA-seq 评估编辑细胞中的再生潜力和差异基因表达。 CAST-seq 发现 0.01% 的等位基因发生易位，主要发生在非致癌脱靶位点，1% 的等位基因发生大量插入缺失。分化气道上皮细胞的开放染色质谱除 CFTR cDNA 和 tCD19 盒对应的区域外，没有出现明显变化，表明基因调控没有可检测到的变化。编辑后的干细胞产生的气道细胞类型与对照相同，基因表达的改变最小。总体而言，通用策略显示出轻微的不良基因组变化。
全长研究论文现代光学传感技术及其在农业Sheetanshu Gupta 1，Dhirendra Kumar 2，Ahmed
全长研究论文现代光学传感技术及其在农业工作表上的应用1，dhirendra kumar 2，艾哈迈德·阿齐兹3，穆罕默德·A·E·E·阿卜杜拉曼4,5，科斯坦扎·菲奥伦蒂诺6 *范围，北阿坎德邦263145，印度2，印度哈里亚纳邦Bhiwani的Chaudhary Bansi Lal University植物学系。3塔什肯特州经济大学，乌兹别克斯坦塔什肯特。4环境研究和土地使用部，国家遥感和太空科学的国家权威（NARS），开罗1564年，埃及。5农业和农村事务部农业遥感的主要实验室/中国农业科学院农业资源与地区规划研究所，中国北京100081，中国。6农业，林业和环境科学学院（安全），巴西里卡塔大学，Viale Dell'ateneo Lucano，10，85100 Potenza，意大利Potenza。 7农业学院Sohag University，Sohag的农业学院，埃及82524。 2024年6月12日收到； 2024年7月25日接受的现代农业面临的挑战是在更少的土地上生产更多的食物，以满足不断增长的全球人口的需求，同时最大程度地减少其对环境的影响。 为了实现这一目标，精确的农业已成为一种变革性的方法，利用了尖端技术来优化农业实践。 在这些技术中，现代光学传感由于其多功能性，无损性和高分辨率功能而引起了极大的关注。6农业，林业和环境科学学院（安全），巴西里卡塔大学，Viale Dell'ateneo Lucano，10，85100 Potenza，意大利Potenza。7农业学院Sohag University，Sohag的农业学院，埃及82524。 2024年6月12日收到； 2024年7月25日接受的现代农业面临的挑战是在更少的土地上生产更多的食物，以满足不断增长的全球人口的需求，同时最大程度地减少其对环境的影响。 为了实现这一目标，精确的农业已成为一种变革性的方法，利用了尖端技术来优化农业实践。 在这些技术中，现代光学传感由于其多功能性，无损性和高分辨率功能而引起了极大的关注。7农业学院Sohag University，Sohag的农业学院，埃及82524。2024年6月12日收到； 2024年7月25日接受的现代农业面临的挑战是在更少的土地上生产更多的食物，以满足不断增长的全球人口的需求，同时最大程度地减少其对环境的影响。为了实现这一目标，精确的农业已成为一种变革性的方法，利用了尖端技术来优化农业实践。在这些技术中，现代光学传感由于其多功能性，无损性和高分辨率功能而引起了极大的关注。本评论探讨了光学传感技术的最新发展及其在农业中的广泛应用，深入研究了这些传感器背后的原理，它们的优势以及它们彻底改变农业的各个方面的潜力，包括作物监测，疾病检测，土壤分析和养分管理。此外，还讨论了针对农业中光学传感的广泛采用的挑战和机遇，这突出了导致适当采用的数据集成，技术标准化和农民意识的需求。通过对当前的最新和未来前景进行全面检查，本综述旨在证明现代光学传感技术如何有可能实现可持续和高效的农业。关键词：光学感应，精确农业，作物监测，疾病检测，土壤分析，养分管理，归一化差异植被指数（NDVI）。引言精确农业的不断发展的景观一直是人类文明的基石，
IDT DNA寡素和超大寡寡做（RUO22-1339_001 01/22）
DNA寡核能全长产品耦合效率图1。IDT专有平台比其他供应商具有更好的耦合效率，后者在您的订单中提供更全长的寡核苷酸。耦合效率的少量增加（≤1％）会导致全长产品产量可测量增加。曲线根据99.4％的耦合效率（IDT Oligos，n = 126）和99.1％（其他供应商，三个不同供应商的n = 134），使用公式，使用公式，全长百分比product =（eff）（eff）（n – 1） *100 is n is n is n is n in – 99.4 = 4.4 = 4.4 = 4.4 = 4.4 = 4.4 = 4.4.4.4.4.4.4.4.4.4.4. n = coupling效率（例如，99.4）使长度为n的寡核所需的耦合反应数。
耶鲁智能门传感器套件手册
•圆形磁铁传感器可用于全长保持的PVCU门（如图所示）。通过将其将其推入同一孔（与智能模块上的耶鲁徽标一致），从全长保持全长并替换为PVCU门框传感器中删除虚拟传感器。•用于复合 /木门的细长磁铁传感器。通过卸下2个固定螺钉，卸下框架上的虚拟传感器；用原始固定件替换为提供并固定的磁性传感器。
完全从克隆的互补DNA中拯救第一个alphanucleorhabdovirus：一种有效的载体，用于MAI
fi g u r e 1从植物中的全长cDNA克隆中拯救感染性玉米镶嵌病毒（MMV）。（a）PJL-MMV-WT，PTF-N＆P和PJL-L-Lintron质粒的示意图。全长的MMV型质粒设计用于转录，以产生MMV抗原组RNA（AgRNA），并包含位于截短的CAMV Double 35S启动子（2×35s）和肝炎乙肝（RZ）rzl89 bjl89 bilary prinary prinary pharine pharione phinary phinary phinary phincy sequence之间的全长MMV cDNA。请注意，序列以抗原（mRNA）感显示。在PTF二进制质粒中的2×35s和35s终结序列之间插入了N和P的全长cDNA。L的全长cDNA与植物内含子ST-LS1插入2×35s和35S终结序列之间的植物内含子cDNA，在PJL89二元质粒中。（b）用含有PJL-MMV-GFP，PTF-N＆P和PJL-L-INTRON质粒的农杆菌菌株的农杆菌菌株的示意图，并说明了PJL-MMV-GFP质粒构建。全长PJL-MMV-GFP包含重复的N/P基因连接，将MMV抗原组cDNA的N和P基因之间的GFP基因两侧。le，领导者； TR，拖车； Ter，终结者； TEV，烟草蚀刻病毒； LB，左边界序列； RB，右边界序列。（c）通过烟草本尼亚娜（Nicotiana Benthamiana）的MMV救援程序的例证，并转移到玉米和Peregrinus Maidis Planthoppers。dpi，接种后天。图1C：使用biore nder.com
呼吸道合胞病毒的基因组表征：全基因组测序和全长 G 和 F 基因序列的新系统
1. 西班牙马哈达翁达卡洛斯三世卫生研究所国家微生物学中心呼吸道病毒参考和研究实验室 2. 西班牙马哈达翁达卡洛斯三世卫生研究所科学和技术中央单位生物信息学部门 3. 西班牙马德里拉巴斯大学医院、拉巴斯医院健康研究所（IdiPAZ 基金会）儿科传染病和热带病科 4. 传染病 CIBER （CIBERINFEC），ISCIII，马德里，西班牙 5. 流行病学和公共卫生 CIBER（CIBERESP），ISCIII，马德里，西班牙 6. 塞韦罗·奥乔亚大学医院儿科，莱加内斯，Puerta de Hierro- Majadahonda 大学医院生物医学科学研究所，马德里，西班牙 7. 圣玛丽亚奈医院，奥伦塞，西班牙 * 这些作者的贡献相同