我们描述了 C-5 吲哚标记嘧啶和 C-8 吲哚标记嘌呤核苷亚磷酰胺的合成及其掺入长度为 15 个碱基对的双链 DNA 的过程。在测试的 23 种序列修饰中,有两种修饰在生理盐条件下诱导 DNA 双链采用 Z 型左手构象,从而绕过了左手 Z-DNA 结构通常所需的特定序列。这些修饰的影响因接头类型而异:柔性丙基接头与刚性炔丙基接头相比表现出不同的效果。值得注意的是,直接位于限制位点上或附近的修饰强调了接头刚性在控制 DNA 构象中的关键作用。具体而言,柔性接头引起的构象变化会影响核酸酶和限制性内切酶的切割,从而降低序列特异性。相反,刚性接头抑制了这种影响。此外,我们的研究结果表明,使用柔性丙基接头用吲哚连接核苷酸修饰的核酸双链体在较长的 DNA 序列中具有明显的形成 BZ 或 Z 样区域的趋势。更高密度的修饰甚至可能在整个双链中诱导完整的 Z 样构象。这些修饰的核苷酸具有开发新型反义疗法的潜力,并为体外筛选针对扭曲的 B-DNA、BZ-DNA 和 Z-DNA 结构的小分子引入了有价值的工具。
。CC-BY 4.0 国际许可,根据 提供(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者,此版本于 2020 年 6 月 9 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.06.09.141705 doi:bioRxiv 预印本
RNase T1 是一种来源于米曲霉 (Aspergillus oryzae) 的核糖核 酸内切酶,可特异性地在单链 RNA 的鸟嘌呤核糖核苷酸 (G) 后进行 切割,产生 3' 磷酸末端。 RNase T1 能够形成核苷 2' , 3'- 环磷酸中 间体,以切割 3'- 鸟苷残基与邻近核苷 5'-OH 基团之间的磷酸二酯键, 产生含末端 3'-GMP 的寡核苷酸和 3'-GMP 。
① 本产品目录中记载的焊接材料、熔敷金属、焊缝金属等的性能数据,仅用于说明产品的典型性能和使用效果,不作为《标准》的规定。本产品目录中没有记载任何性能数据。应被解释为明示或暗示的保证。 ②请注意,实际焊接结构的性能受结构设计、钢板化学成分、施工方法、焊接条件、施工人员的技能等因素的影响。对客户的通知和要求
Michael BASSIK 高彩霞 Pietro GENOVESE 星野淳 秋津堀田 许爱龙 柯亨范 Henry KIM Silvana KONERMANN 智二 真尾圭二 西田宏 西濱修 濕木司 大森秀之 冈野秀之 Leopold PARTS 秦文宁 斋藤弘英 斋藤诚 佐佐木惠梨香 佐藤森敏 Virginijus SIKSNYS 矢千江望 山本隆 游佐耕介
成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关 (Cas) 系统通过使用 CRISPR RNA (crRNA) 引导入侵核酸的沉默,为细菌和古细菌提供针对病毒和质粒的适应性免疫。我们在此表明,在这些系统的一个子集中,与反式激活 crRNA (tracrRNA) 碱基配对的成熟 crRNA 形成双 RNA 结构,该结构指导 CRISPR 相关蛋白 Cas9 在靶 DNA 中引入双链 (ds) 断裂。在与 crRNA 引导序列互补的位点,Cas9 HNH 核酸酶结构域切割互补链,而 Cas9 RuvC 样结构域切割非互补链。当双 tracrRNA:crRNA 被设计为单 RNA 嵌合体时,它还会指导序列特异性 Cas9 dsDNA 切割。我们的研究揭示了一个使用双 RNA 进行位点特异性 DNA 切割的核酸内切酶家族,并强调了利用该系统进行 RNA 可编程基因组编辑的潜力。B
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。
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癌症治疗的合成致死策略利用癌症特异性基因缺陷来识别对肿瘤细胞存活至关重要的靶点。本文我们表明,RAD27/FEN1 编码瓣状内切酶 1 (FEN1),这是一种在 DNA 复制和修复中发挥作用的结构特异性核酸酶,与酿酒酵母基因组不稳定性基因具有最多的合成致死相互作用,是基于抑制剂的方法杀死同源重组 (HR) 缺陷癌症的可用药物靶点。研究表明,小分子 FEN1 抑制剂和 FEN1 小干扰 RNA (siRNA) 可选择性杀死 BRCA1 和 BRCA2 缺陷的人类细胞系,从而证实了 HR 缺陷癌症容易受到 FEN1 缺失的影响。此外,在小鼠中重现了对 FEN1 抑制的不同敏感性,小分子 FEN1 抑制剂降低了药物敏感但无耐药性癌细胞系中形成的肿瘤的生长。FEN1 抑制在敏感和耐药细胞系中均诱导了 DNA 损伤反应;然而,即使去除抑制剂,敏感细胞系也无法恢复和复制 DNA。尽管 FEN1 抑制在敏感细胞中将 caspase 激活到更高水平,但这种凋亡反应发生在 p53 缺陷细胞中,而泛 caspase 抑制剂无法阻断细胞杀伤。这些结果表明,FEN1 抑制剂具有治疗靶向 HR 缺陷癌症的潜力,例如由 BRCA1 和 BRCA2 突变和其他遗传缺陷引起的癌症。