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World File Search System原位杂交
SAR11、SAR86、拟杆菌和 Aurantivirga 在浮游植物大量繁殖期间的原位细胞分裂和死亡率揭示了种群控制的差异
摘要 可以使用 16S rRNA 荧光原位杂交 (FISH) 研究微生物种群的净增长，即丰度随时间的变化。然而，这种方法不能区分死亡率和细胞分裂率。我们结合稀释培养实验，将基于 FISH 的图像细胞术用于研究两种不同的浮游植物水华中四种细菌类群的净增长、细胞分裂和死亡率：寡营养菌 SAR11 和 SAR86 以及富营养菌门拟杆菌门及其 Aurantivirga 属。细胞体积、核糖体含量和细胞分裂频率 (FDC) 随时间共同变化。在这三者中，FDC 是计算所选类群细胞分裂率的最合适的预测因子。 SAR86 的 FDC 衍生细胞分裂率高达 0.8/天，Aurantivirga 的 FDC 衍生细胞分裂率高达 1.9/天，这与寡养生物和富养生物的预期不同。令人惊讶的是，SAR11 的细胞分裂率也达到了高达 1.9/天的高水平，甚至在浮游植物大量繁殖之前也是如此。对于所有四个分类群，丰度衍生的净增长率（-0.6 到 0.5/天）比细胞分裂率低一个数量级。因此，死亡率与细胞分裂率相当高，表明大约 90% 的细菌产物在 1 天内被回收，没有明显的时间滞后。我们的研究表明，确定特定分类单元的细胞分裂率是对基于组学的工具的补充，并为包括自下而上和自上而下控制在内的单个细菌生长策略提供了前所未有的线索。
星形细胞瘤的临床病理学和分子特征
结果：本研究纳入4例女性患者，年龄从8岁到44岁不等。1例患者的肿瘤位于右顶叶，另3例患者的肿瘤位于脊髓。组织学通常以星形母细胞的假菊形团和血管透明变性为特征。这些肿瘤表现出与传统颅内星形母细胞瘤相似的生长方式，4例患者的组织学表现均为高级别，表现为肿瘤细胞高密度区或坏死。免疫组化染色显示4例患者均表达OLIG2、EMA和波形蛋白，3例患者还表达GFAP和S-100。3例患者的Ki-67阳性指数约为15%，1例患者约为10%。使用分离探针的荧光原位杂交（FISH）显示3例患者存在EWRS1断裂，1例患者存在MN1断裂。进一步的DNA或RNA靶向双等位基因测序发现病例1存在EWSR1(外显子1-7)-BEND2(外显子2-14)融合，病例2存在EWSR1(外显子1-7)-BEND2(基因间)融合。病例3存在EWSR1(外显子1-7)-NUDT10(基因间)融合，病例4存在MN1(外显子1)-BEND2(外显子2)融合。EWSR1-NUDT10基因融合是星形母细胞瘤的一种新融合类型。患者的随访时间分别为76.5、17.6、33.7和61.3个月。3例在脊髓部位出现肿瘤复发，病例4出现多发性复发。
CD 138个单元格的动手研讨会，用于多个...
由班加罗尔萨尔贾普尔路的圣约翰医学院和医院分子生物学和遗传学部门组织 - 560 034 PH：080-22065947电子邮件：hod.genetics@stoick@stojohns.in亲爱的朋友，分子生物学和遗传学部门很乐意进行cdshop inson Fishshop On cd138 Miyshop forshop for cd1388888 Miyshop。圣约翰医学院在整个印度首位开始于1975年开始细胞遗传学。从那时起，该中心是一个公认的细胞遗传学和鱼类分析中心。该中心也是各种学生的学术平台，并为医学，辅助医学研究生进行了研讨会和培训。这个新年让我们从新的机会开始，首先在2025年3月14日至15日对CD138分类的CD138分类细胞进行鱼类的小细胞进行。多发性骨髓瘤（MM）鱼是一种异质性疾病，鱼板有助于将新诊断为多发性骨髓瘤的个体分类为预后和选择治疗的危险组。它也可用于跟进缓解或复发状态治疗决策和改善患者预后。The presence of t(4;14), t(14;16), or deletion 17p is classified as high- risk MM and t(14;20) and gain 1q are also regarded as high-risk cytogenetic features in the Stratification of Myeloma and Risk-Adapted Therapy (mSMART), which are delineated by cytogenetic testing with fluorescence in situ hybridization (FISH).组织C委员会：然而，通过荧光原位杂交（IFISH）测试进行精确的细胞遗传学测试并不取决于细胞的增殖，它需要对CD138阳性等离子体细胞进行预分类以检测细胞遗传学异常。
peña实验室普林斯顿神经科学研究所
peña实验室普林斯顿神经科学研究所凯特·詹森·佩尼亚（Cate JensenPeña），pi www.penalab.org研究专家I（技术人员）工作，开设此职位将于2024年1月开始或填补。我们的研究：我们的实验室主要研究脑发育的分子机制以及整个生命周期的压力的影响。我们使用早期和成人压力的小鼠模型，以研究控制压力过敏的神经生物学机制。职位：该职位将合作以支持实验室中的许多项目。我们专门寻找成为组织学技术专家（通过鱼或IHC进行的组织切片，RNA或蛋白质染色），共聚焦显微镜和定量。这是一个为期一年的任期职位，其可能性可能取决于成功的绩效。薪水将由经验确定。您：申请人应该/很快就会完成学士学位或同等学历，非常有条理，对细节有很高的关注，与他人合作，能够在训练后能够独立地独立工作，在必要时提出问题，并有兴趣了解大脑。将偏爱具有组织切片，免疫组织化学，原位杂交（FISH，HRC，RNASCOPE）和/或共共聚焦显微镜的候选人。学习的热情是必不可少的，具体的先前实验室经验不是。womxn和历史上排除的群体的人们被专门申请。即将发布的正式职位发布，将在www.princeton.edu/acad-positions上找到。同时，有兴趣的候选人应与Princeton.edu的CPENA联系，并提供简短的求职信，说明经验和专业兴趣和简历。申请的审查将持续到该职位填补为止。该职位遵守大学的背景调查政策。
豌豆蚜虫生殖模式转换过程中的多巴胺通路表征
蚜虫是全球大多数农作物的主要害虫。它们如此成功很大程度上是由于它们生殖方式的可塑性。它们在春季和夏季通过胎生孤雌生殖有效地繁殖，对农作物造成严重损害。夏末，胎生孤雌生殖雌性感知到光周期的缩短，并将此信号传递给胚胎，从而改变其生殖命运，产生有性个体：卵生雌性和雄性。交配后，这些雌性会产下抗寒的卵。早期研究表明，一些编码多巴胺通路关键成分的转录本在长日照和短日照条件下受到调控，这表明多巴胺可能参与了生殖模式转换之前季节性信号的传导。在本研究中，我们旨在更深入地表征该通路的表达动力学，并分析其在豌豆蚜虫 Acyrthosiphon pisum 中的功能作用。我们首先分析了在长日照（无性生殖）或短日照（有性生殖）条件下饲养的蚜虫胚胎和幼虫头中该通路的十个基因的表达水平。然后，我们进行了原位杂交实验，以在胚胎中定位编码多巴胺合成中两种关键酶的 ddc 和 pale 转录本。最后，在有性个体交配后产生的卵子中使用 CRISPR-Cas9 诱变，我们针对 ddc 基因进行了诱变。我们可以在 ddc 突变卵子中观察到强烈的黑色素化默认值，这些卵子可靠地模仿了果蝇 ddc 表型。然而，这种致命的表型使我们无法验证多巴胺作为触发胚胎生殖模式转换所必需的信号通路的参与。
鉴定新型 SLC8A1-ALK 融合和非...
背景：约 2-7% 的非小细胞肺癌患者发生间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 重排事件。值得注意的是，典型的 ALK 可操作重排对酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 治疗敏感。然而，不同类型的 ALK 融合会影响这种治疗方法的临床结果。约 10-40% 的 ALK 融合阳性非小细胞肺癌患者对 ALK-TKI 治疗无反应。因此，准确识别 ALK 重排类型对于选择合适的临床治疗方法非常重要。病例报告：使用 DNA 靶向下一代测序技术，我们在一名肺腺癌患者中发现了一种新的溶质载体家族 8 成员 A1 (SLC8A1)-ALK 融合类型。进一步的逆转录聚合酶链反应和桑格测序证实，在转录水平上，重排为 B 细胞 CLL/淋巴瘤 11A (BCL11A)-ALK 融合。患者对克唑替尼治疗表现出快速而强烈的反应，持续 9 个月。患者在对克唑替尼产生耐药性后，对阿来替尼治疗也反应良好。结论：DNA 靶向下一代测序与 RNA 逆转录聚合酶链反应和测序相结合的策略，加上荧光原位杂交和免疫组织化学，可为正确识别伴侣基因和融合结构提供有效且实用的解决方案，用于诊断 ALK 重排，特别是对于 ALK 融合事件的非规范表达模式。联合方法可能为患者带来更多益处。关键词：肺腺癌、间变性淋巴瘤激酶重排、酪氨酸激酶抑制剂、治疗、病例
精准癌症医学在转移性胆道癌中的应用
摘要 简介 晚期治疗难治性胆道癌 (BTC) 预后不良，对适当的治疗策略构成了重大挑战。通过绘制晚期 BTC 患者的分子图谱，精准癌症医学可以为这些患者提供有针对性的治疗。目的 在本分析中，我们旨在展示 PCM 在转移性 BTC 中的潜力。方法 在我们的 PCM 平台的单中心、真实世界回顾性分析中，我们描述了 30 名被诊断为不同类型转移性 BTC 的患者的分子图谱。使用 161 基因下一代测序面板、免疫组织化学 (IHC) 和荧光原位杂交检查患者的肿瘤样本以检测染色体易位。结果 我们总共在 30 名患者中发现了 35 种分子畸变。主要突变为 KRAS ( n = 8)、TP53 ( n = 7)、IDH2 ( n = 4) 和 IDH1 ( n = 3)，这些突变占所有分子改变的大部分 (62.86%)。在两例患者中观察到 BRAF 突变。在 ARID1A 、 CTNNB1 、ESR1 、FBXW7 、FGFR2 、MET 、NOTCH2 、PIK3CA 、PTCH1 、SMAD4 和 SRC1 中观察到较少见的改变，各见一例。在一名患者中检测到 FGFR 融合基因。在八名患者中未检测到突变。IHC 显示 28 名患者有 EGFR 和 p-mTOR 表达。将这些结果应用于我们的患者，建议对 60% 的患者 ( n = 18 ) 进行靶向治疗。一名患者的病情稳定。结论 PCM 是一种可行的治疗方法，可以为转移性 BTC 提供分子引导治疗建议。
染色体不稳定性和克隆异质性的作用...
抽象目的：染色体不稳定性（CIN）是癌症的标志，其特征是染色体的细胞对细胞变异性，在癌细胞群体中经常观察到，并且与预后不良，转移和治疗耐药性不佳有关。乳腺癌（BC）的特征是不稳定的核型，最近的报道表明CIN可能会影响BC对化疗方案的反应。然而，已经观察到极端CIN与改善结果之间的矛盾关联。Methods: This study aimed to 1) evaluate CIN levels and clonal heterogeneity (CH) in MCF7, ZR-751, MDA-MB468, BT474, and KPL4 BC cells treated with low doses of tamoxifen (TAM), docetaxel (DOC), doxorubicin (DOX), Herceptin (HT), and combined treatments (TAM/DOC,通过使用荧光原位杂交（FISH），TAM/DOX，TAM/HT，HT/DOC和HT/DOX）通过将鱼类的结果与细胞增殖进行比较，检查与治疗的响应相关性。结果：根据三个特征，中间CIN与药物敏感性有关：雌激素受体α（ERα）和HER2状态，癌细胞中的CIN水平以及治疗诱导的CIN。ERα +/HER2-具有中间CIN的细胞对紫杉烷（DOC）和蒽环类动物（DOX）的治疗敏感，而ERα - /HER2-，ERα +/HER2 +，ERα +/HER2 +，ERα-/HER2 +细胞具有中间型的抗性。结论：对BC中CIN和CH的更深入的了解可以帮助优化现有的治疗方案和/或支持改善癌症结局的新策略。关键词乳腺癌；染色体不稳定性；耐药性；鱼;克隆异质性
气管癌
气管腺样囊性癌最常见于 40 至 50 岁年龄段 [5–7]。男性发病率是女性的 2 至 4 倍，主要发病于 60 至 70 岁年龄段 [2, 5–7]。该肿瘤的病因不明，与鳞状细胞癌不同，它与吸烟无关 [5, 6, 8]。该肿瘤起源于气管黏膜下膜的小涎腺和浆液腺，ACC 的形态学特征与原发性涎腺肿瘤相符 [9]。从宏观上看，ACC 常常生长为外生性肿瘤，导致气管管腔变窄 [2]。形态学表现为特征性，有两种类型的细胞：导管细胞，胞浆稀少，角核深染，细胞角蛋白 (CK7) 染色阳性；扁平肌上皮细胞，肌上皮标志物 (p63、SMA、钙调蛋白) 染色阳性。免疫组织化学突出的双相外观对于鉴别诊断至关重要。细胞形成筛状、管状和实体图案 [10]。实体区域的百分比决定了组织学分化程度。在不确定的情况下，可以使用 MYB 抗体进行免疫组织化学染色 - 阳性结果表明 ACC 特有的 MYB 基因易位，可通过荧光原位杂交 (FISH) 确认 [11, 12]。ACC 的特征是黏膜下和神经周围扩散 [13]。在诊断时，仅约 10% 的患者出现区域淋巴结转移或远处转移 [2]。尽管ACC的生长速度通常较慢，但在某些情况下，其病程可能更具侵袭性，具有局部侵袭和转移的趋势。此外，即使经过很长的无病期，也可能出现局部或全身复发[2，5]。
多巴胺感染细胞的神经化学表征
抽象的高度敏感的原位杂交程序（RNASCOPE）用于量化两种歌曲控制核（HVC和基底神经节的X区域X）中三种多巴胺受体（DRD1，DRD2和DRD3）的表达，已知这些核的表达已知，这些核的表达是众所周知，这些核的表达是接受多巴胺剂输入的男性和女性的灰色和PeriaqueDuctal and Peria cag and Peria cag and pag and pag and pag and pag）。两性都用睾丸激素治疗，以确保他们会积极唱歌。我们还确定了表达这些受体的细胞的兴奋性与抑制表型，以及它们在一段时间产生歌曲后的激活。在每个大脑区域中都鉴定了三种受体类型，但X区域drd3除外。表达每个受体的细胞密度随受到受体类型和脑面积的函数而变化。令人惊讶的是，很少发现性别差异；他们似乎无法解释睾丸激素引起的歌曲的性别差异。总体而言，PAG中DRD阳性细胞的密度比两个歌曲控制核低得多。在HVC中，大多数表达三种受体亚型的细胞均为vglut2阳性，而与vglut2的共定位发生在X区域的几个细胞中，并且PAG中的细胞中等比例。表达多巴胺受体的抑制细胞的数量受到限制。X区域中的大多数多巴胺感染细胞都没有表达兴奋性或抑制标记。最后，在表达三种多巴胺受体亚型中每一个的细胞中观察到了通过EGR1表达测量的唱歌过程中的细胞激活，除了PAG中的DRD3。