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了解修复染色体上双链DNA断裂的机制
（注2）核小体这是染色质的基本单位，是一种结构，其中大约150个DNA碱基对包裹在一个组蛋白八聚体周围，该组蛋白八聚体包含两个分子（H2A，H2B，H2B，H3，H4）中的四种分子。 （注3）冷冻电子显微镜A显微镜，其中包含蛋白质样品在极端低温的环境中冷冻，并用电子束观察到限制样品。通过拍摄大量图像，可以获得具有多种角度信息的粒子图像，并且可以从该信息中重建样品的三维结构。 （注4）氨基末端结构域（N末端结构域）在蛋白质末端的一个区域，该区域具有氨基群，最初是在蛋白质合成过程中合成的。 RAD51由两个球状结构域组成，其中一个球状结构域存在于氨基末端，一个与RECA同源的球状结构域。 （注5）L1回路区域该区域在与RECA同源的球状结构域中发现，对于与线性DNA结合很重要。联系（请联系演讲者以获取研究详细信息）Kurumizaka hitoshi教授，定量生命科学研究所，东京大学电话：03-5841-7826传真：03-5841-1468电子邮件：kurumizaka：kurumizaka [at] iqb.u-tokyo.ac.ac.jp procention nocation nocation jst Impaction jst Impact项目> Fumie Imabayashi电话：03-3512-3528传真：03-3222-2068电子邮件：Eratowww [at] jst.go..jp <与报告相关的询问>通用事务团队，定量生命科学研究所，东京大学电话：03-5841-781-781-781313 soumu [at] iqb.u-tokyo.ac.ac.jp日本科学技术局公共关系部电话：03-5214-8404传真：03-5214-8432电子邮件：
准确的更新的双链测序诱变测定法，可重复检测到低于一十分三百万的突变频率
条显示了用V2化学产生的每个小鼠文库的每样本突变频率，威尔逊二项式置信区间（95％）。条上方的数字代表总突变碱基。与未处理的对照相比，支架上方上方的数字代表每个治疗组的每种组织类型的倍数变化。MF平均为5.7 x 10 -8，小鼠肝对对照样品的MF平均为6.4 x 10 -8。p值是从比较两组的准散孔概括的线性模型中计算得出的，并根据错误的发现率进行了调整以考虑多个比较。（** p值<0.01，*** p值<0.001）仅用于研究使用。不适用于诊断程序。©2024 Twinstrand Biosciences，Inc。保留所有权利。所有商标都是Twinstrand Biosciences，Inc。或其各自所有者的财产。
双链DNA IgG抗体
局限性：对双链DNA（DSDNA）的IgG抗体的测量是半定量的。不应依靠这些抗体的反应性略有变化来预测全身性红斑狼疮患者（SLE）患者的临床变化。SLE患者疾病的临床耀斑可能不伴有DSDNA抗体反应性的变化。因此，仅抗DSDNA抗体结果就不足以指导疾病管理。
通过DNP增强固态NMR N-H键长度测量的双链DNA中的氢键
许多生物学过程和机制取决于DNA中碱基配对和氢键的细节。氢键由于难以可视化氢原子位置而通过X射线晶体学和冷冻EM进行量化，但可以通过溶液中的NMR光谱探测到位点特异性，而固态的固态，后者特别适合大型，缓慢滚动的DNA复合物。最近，我们表明低温动态核极化（DNP）增强的固态NMR是在本机样条件下在各种DNA系统中区分Hoogsteen碱基对（BPS）与规范的Watson-Crick BPS的有价值工具。在此使用12型摩尔DNA双工，在Watson-Crick或Hoogsteen确认中含有两个中央腺嘌呤 - 胸腺氨酸（A-T）BPS，我们证明了DNP固态NMR测量值，这些NMR的测量值是胸腺胺N3-H3键的长度，这些长度与N-H-H-H的详细信息敏感，并允许NH-H·n-H·的n-H·n-H·的水性键合敏感。相同的DNA序列上下文。对于此DNA双链体，对于Watson-Crick A-T和HOOGSTEEN A-T和HOOGSTEEN A（SYN）-T碱基对的有效相同的TN3-H3键长的长度为1.055±0.011Å和1.060±0.011Å，相对于参考磁键长度为1.015±0.010Å，分别为N-Acety-ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl，分别为watson-Crick a-t和hoogsteen a（syn）a（syn）-t碱基对。非常明显的是，在模型DNA双链体的背景下，这些结果表明，watson-Crick和Hoogsteen BP构型构象异构体之间N-H··N-t a-t氢键没有显着差异。考虑到零点运动的先前量子化学计算预测有效较长的肽n-h键长度为1.041Å，与溶液和环境温度下的肽和蛋白质的固态NMR研究一致，以促进这些早期的研究tn3-h3键长度的直接比较。 Watson-Crick A-T和Hoogsteen A（Syn）-t BPS相对于1.041Å参考肽N-H键长。更一般地，基于低温DNP固态NMR的方法对N-H键长度进行高精度测量有望促进对一系列DNA复合物和基本配对环境的氢键的详细比较分析。
粘蛋白复合物寡聚在DNA双链断裂
DNA双链断裂（DSB），以确保基因组稳定性。至关重要的是，必须将DSB末端保持在一起才能及时修复。在酿酒酵母中，两种知之甚少的途径介导了DSB的终端。使用MRE11-RAD50-XRS2（MRX）复合物在物理上桥接DSB末端。另一个要求DSB通过EXO1转换为单链DNA（ssDNA），但桥接蛋白是未知的。我们发现该粘着蛋白，其加载器和SMC5/6用EXO1作用于Tether DSB末端。非常明显的是，寡聚中特异性受损的粘着蛋白未能束缚DSB，从而揭示了粘着蛋白寡聚的新功能。除了姐妹染色单体内聚力的已知重要性外，基于显微镜的微流体实验通过确保DSB终端连接来揭示凝聚蛋白在修复中的新作用。总的来说，我们的发现表明，粘着蛋白的低聚可防止DSB的末端分离并促进DSB修复，从而揭示了粘连在保护基因组完整性中的新型作用和作用。
DNA解旋酶FANCJ（BRIP1）在双链破裂修复过程中的功能，但在雄性小鼠的减数分裂预言I期间不形成跨界
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年10月8日。 https://doi.org/10.1101/2023.10.06.561296 doi：Biorxiv Preprint
DNA双链断裂修复的新方面
摘要：放射治疗是当今癌症管理的重要组成部分，利用不同方式的电离辐射（IR）来减轻癌症的进展。ir功能。其中最有害的是DNA双链断裂（DSB）。在进化过程中，较高的真核生物的细胞已经发展出四个主要的DSB修复途径：经典的非同源末端连接（C-NHEJ），同源重组（HR），替代性最终连接（ALT-EJ）（ALT-EJ）和单链退火（SSA）。这些机械上不同的修复途径具有不同的细胞周期和同源性依赖性，但令人惊讶的是，它们具有截然不同的效果和动力学的作用，因此对细胞存活和基因组维持无效。因此，在这些DSB修复途径的参与中预期进行严格的调节和协调是合理的，以实现最大可能的基因组稳定性。在这里，我们提供了有关这些修复途径支撑的分子机制的累积知识的最新综述，重点是C-NHEJ和HR。我们讨论了最近出现的因素和过程。我们概述了整个细胞周期中DSB修复途径选择的机制，并突出了DNA终端切除在此过程中的关键作用。然而，最重要的是，我们指出在低DSB载荷下对HR的强烈偏好，因此对于在细胞周期的G 2期中受辐照的细胞而言，IR剂量较低。我们进一步探讨了从高层到低限制误差的修复途径的过渡的分子基础，并分析了这种过渡对细胞生存能力和基因组稳定性的协调和后果。最后，我们详细阐述了这些进步如何有助于制定放射治疗中的癌症治疗方案。
DNA双链断裂修复中的液态液相分离
DNA修复因子通过时空的隔离和DNA双链断裂（DSB）的溶解作用。最近的进步表明，某些DSB修复因子经历了液 - 液相分离（LLP），并显示出类似液滴的特性以及动态材料交换。重要的是，LLP调节了各种生物学过程，异常LLP参与了农业疾病的病理发展。此外，DSB修复过程中DNA修复因子的动态冷凝和溶解的表型呈现了LLP的特性。显着，RNA，聚（ADP-核糖）[PAR]和转录后修饰（PTM），例如磷酸化，泛素化和甲基化，被认为有助于DSB修复因子的LLP。从DSB期间LLP的功能的观点中，DNA修复因子可能会在DSB传感和DNA损伤修复信号转导中作用，参与同源推荐（HR）（HR）和非同源性端始终连接（NHEJ） - 介导的DSB介导的DSB修复，并调节下游径流的途径。基于这些发现，研究人员专注于
DNA寡核苷酸/双链形成的退火
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DNA双链断裂的修复使基因组功能遗传障碍
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年9月6日发布的此版本中显示此版本的版权所有。 https://doi.org/10.1101/2023.08.29.555258 doi：Biorxiv Preprint