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World File Search System变异
范围范围的定量转录组和蛋白质组揭示了酵母中基因表达变异的明显遗传控制
基因表达的调节对应于基因组中编码的信息转化为表型的过程中的关键步骤。尽管已经对转录水平变化的遗传起源进行了广泛的分析，但我们的知识仍然非常有限，因为人群水平上蛋白质丰度变异的遗传起源。在这里，我们生成了近一千个天然酵母菌株的定量蛋白质组。通过与其转录组相比，我们的分析共同表明，转录组和蛋白质组显然是两种不同的调节水平，受自然种群中不同遗传基础的控制。在一起，我们的结果突出了访问这两个级别的基因表达以更好地理解基因型 - 表型关系的相关性。
心率变异性有助于对系统性硬化症中的表型进行分类
我们旨在开发系统性硬化症（SSC）子类型分类器工具，以在患者的床边使用。我们比较了静止（5分钟）的心率变异性（HRV），并响应于具有弥漫性（n = 16，DCSSC）和有限（n = 38，LCSSC）的患者（n = 58）的正抑制（5分钟）（n = 58）。在时间，频率和非线性域中从Beat-Beat RR间隔中评估HRV。DCSSC组与LCSSC组不同，主要是较高的心率（HR）和较低的HRV，在depubitus和正稳态条件下。站立机动降低了HR标准偏差（SD_HR），Poincaré拟合椭圆的RR间隔图（SD2）的主要轴长以及DCSSC组中的相关维度（CORDIM），而LCSSC组中这些HRV索引增加了（P = 0.004，P = 0.004，p = 0.002，以及增加了这些HRV指数。我们确定了5个最有用和判别的HRV变量。We then compared 341 classifying models (1 to 5 variables combinations × 11 classifier algorithms) according to mean squared error, logloss, sensitivity, specificity, precision, accuracy, area under curve of the ROC-curves and F1-score.f1得分范围从最佳1-可添加模型的0.823到4个变量最佳模型的最大0.947。最具体和精确的模型包括SD_HR，SD2和Cordim。总而言之，我们提供了高性能分类模型，能够从ECG记录中区分易于在床边执行的有限皮肤SSC子类型。模型基于1至5 HRV索引用作自主综合影响心脏活动的非线性标记。
深度学习揭示了成人人类肠道微生物组的功能原型，这是个体间变异性和混淆疾病信号的基础
了解肠道微生物组的功能多样性对于解码其在健康和疾病中的作用至关重要。使用深入学习框架，我们确定了三种定义成年肠道微生物组的功能原型，每个原型都以特定的代谢潜力为特征：带有分支链氨基酸和细胞壁合成（原型1）的糖代谢，脂肪酸酸和TCA循环循环代谢（Artype型2）和Armino Acid Acid Acid and nIristy（Armogen nitrisp）（Armogen Mentiast）（Armogen Mentiast）（Armogen Mentiast）。原型接近度与稳定性有关，原型2代表最弹性的状态，这可能是由于其代谢灵活性所致。功能多样性在与疾病相关的微生物特征中成为混杂因素。在炎症性肠病中，我们观察到原型特异性的转移，包括在原型1-主导样本中增加碳水化合物代谢和3种样品原型中的炎症途径，这表明了微生物组靶向的干预措施的不同机会。该框架解决了微生物组研究中的关键挑战，包括个人间
GSVA：微阵列和RNA-seq数据的基因集变异分析
ComputeGenesetSoverlap。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。3个reduplicateGenesets。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4个过滤器。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5基因史上术。。。。。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>6个基因。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 7 GSVA。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 8 GSVA解码。 div> 。 div>6个基因。 div>。 div>。 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div>。 div>11 GSVA-PKG弃用。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>11 gsvaantolation。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>11 gsvaenrichment。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>13 GSVOXPRATA类。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>14 GSVAGESETS类。 div>。 div>。 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方尖碑遗传变异性的生物信息学研究
在人类消化微生物组的链球菌的细菌群中，已经鉴定出了方尖碑RNA序列，尽管它们对微生物组或宿主生物体的生理影响仍然未知（Schmitt- Kremer等人，2024年）。在该菌株中发现了一个特定的方尖碑序列“方尖碑S.S”，长度为1,137个核苷酸，与Alpha和beta方尖碑的基因组相似，分别为41％和35％。尽管存在与Oblin-1的相似性，但没有发现与Oblin-2的基因组相似性。至少在上述菌株中，细菌种群中的方尖碑序列的存在表明它们可能存在于其他菌株甚至物种中。尚不清楚不同类型的上线孔是否表现出真核细胞的乳房（尽管它们在生态上与微生物群体及其宿主生物（Schmitt-Kremer等，2024））（2024）），是否为细菌提供了有益的功能（Maddamsotti等，2024），是否有与造成的效果。已经提出，通过包含小RNA的囊泡的细菌转运可能是一种通信策略，这可能是方尖碑传播的潜在机制的关键（Maddamsetti等，2024）。然而，细胞宿主中有方尖碑的存在似乎与蛋白质的产生有关，特别是至少两种类型（α和beta方尖碑）。作为潜在的新生物学实体，尚不清楚它们是否具有类似于噬菌体的翻译机制或类似于病毒的自动化机制，等待进一步研究是否真的生成了生物信息学工具预测的蛋白质结构。基于Zheludev等人，2024年提出的假设，可以推测，与细胞基因组进化一样，将外部序列纳入当前的细胞序列，方尖碑S.S.如生物信息学分析所建议的，可能有助于链球菌的转录组片段。
组级稳定性，但右额叶 - 突破性神经胶质瘤醒着切除后神经认知状况的个人变异性
低级神经胶质瘤的清醒手术被认为是改善切除程度并保证患者“有价值的生活”的最佳程序，这不仅避免运动，而且还避免了认知缺陷。然而，位于右半球，尤其是右额叶的肿瘤仍然很少在清醒状态下操作。原因之一可能是，文献中很少有信息描述右侧膜神经瘤切除后持久神经心理缺陷的速度和性质。在右侧IDH突变的神经胶质瘤中醒来手术后的长期认知缺陷。我们回顾性地分析了2012年至2020年之间连续的一系列清醒外科手术切除术，用于右额叶IDH突破性神经胶质瘤。我们研究了患者的主观投诉和手术前后的客观神经心理学评估。然后，我们的结果对文献进行了视角。该研究包括18例患者（中等年龄：42.5 [26-58]）的20例手术病例（包括5例重做手术）。中位术前体积为37 cc；谁的评分分别为70％，20％和10％的病例分级。术前，很少有患者患有相关的主观认知或行为障碍，而评估显示45％的病例中有轻微的缺陷，最常见于执行功能，注意力，工作记忆和速度处理。术后立即评估表明，在75％的病例中，执行功能严重缺陷，但注意力缺陷（65％），空间忽视（60％）和行为障碍（冷漠，阿顿疗法/ amimimia，情感敏感性，情感障碍，厌食症）。手术后四个月，尽管心理测量z得分在小组级别没有变化，但个人评估显示9/20病例的表现略有下降，至少一个领域之一：执行功能，速度处理，注意力，语义认知，社会认知。我们的结果通常与文献的结果一致，证实右额叶是一个高度雄辩的领域，并暗示在清醒条件下操作这些患者的重要性。
一个新的理论框架共同解释了执行灵活决策的受试者的行为和神经变异性
能够根据上下文信息灵活切换对外部刺激的反应的能力对于与复杂世界的成功互动至关重要。在许多领域1-3中必须进行上下文依赖性计算，但它们的神经实现仍然很少理解。在这里，我们在大鼠中开发了一项新颖的行为任务，以研究上下文依赖性的选择和决策证据的积累4-6。在猴子和大鼠数据支持的假设下，我们首先从数学上显示网络可以通过三个定义组件的组合来解决此问题。可以通过实验数据直接识别和测试这些组件。我们进一步表明，现有的电生理和建模数据与这些组件的各种可能组合兼容，这表明不同的个体可以使用不同的组件组合。为了研究各个受试者的变异性，我们开发了自动化的高通量方法来培训大鼠的任务，并在其上训练了许多受试者。与理论预测，神经和行为分析一致，尽管任务表现均匀，但大鼠均显示了跨大鼠的实质异质性。我们的理论进一步预测了行为和神经信号之间的特定联系，该签名在数据中得到了强有力的支持。总而言之，我们的结果提供了一个新的实验支持的理论框架，以分析执行灵活决策任务的生物学和人工系统中的个体变异性，它们为较高认知的个体变异性研究打开了大门，并提供了对情境依赖性计算的神经机制的见解。
人类DNA变异性的重要性
Jobling M.，Hollox E.，Kivisild T.，Tyler-Smith C.，Hurles M.，人类进化遗传学，Taylor＆Francis Ltd. 2014 2。
映射土壤有机碳 - 土壤生物多样性的变异性，热带土壤的生态系统尼克萨斯
摘要不再是新闻，地球母亲的恶化在世界许多土地上造成了许多困难。研究统计数据表明，亚洲面临的环境问题中约有80％，尤其是森林砍伐导致土壤生物多样性的丧失。非洲因气候变化的危害以超过50％的速度受到严重影响，由于栖息地的改变和损失，近东和北非的生物多样性丧失了她在土壤中生物多样性的48％以上。此列表是不贫穷和心碎的，表达了一种观点，即如果不进行可持续的补救，那么我们将在未来几年内拥有更多的营养不良和病人，我们的环境将受到更严重的污染和有毒，我们的水系统将变得越来越困难，我们的水系统将变得越来越难以补救，而在其他不足以来，在其他不足的不足之处可能会增加，这可能会增加。为解决这个问题做出了一种方法，这项研究研究了土壤生态系统 - 尼克斯的当前土壤有机碳 - 土壤生物多样性的变异性。这项研究发生在阿布贾大学内部。在地球系统特性上收集了空间数据，进行了分析，并进行了模拟。该区域是模型的，并插值以找到具有严重威胁的热点。在研究中应用了探索性和描述性统计。结果表明，研究区域的土壤被压实，因此不适合支持土壤系统中生存实体的可持续生存，土壤散装密度值范围为2.1GCM -3 - 2.71GCM -3。该地区的有机碳较低。岩土技术和地貌评估和相互作用只显示了两个（2）点的earth长度为1 cm，这表明了土壤孢子太紧，无法在投资地点的地下生物多样性的地下生物多样性上实现可持续的繁荣。因此，建议对研究区域的再生和治愈土壤障碍进行生态工具。
2q35乳腺癌风险基因座的功能注释暗示了影响长期增强子元素活性的结构变异
约瑟夫·巴克斯特（Joseph S. Andrulis, 9, 10 Hoda Anton-Culver, 11 Natalia N. Antonenkova, 12 Volker Arndt, 13 Kristan J. Aronson, 14 Annelie Augustinsson, 15 Heiko Becher, 16 Matthias W. Beckmann, 17 Sabine Behrens, 18 Javier Benitez, 19, 20 Marina Bermisheva, 21 Natalia V. Bogdanova, 12, 22，23 Stig E. Bojsen，24，25，26 Hermann Brenner，13，27，27，28 Sara Y. Brucker，29 Qiuyin Cai，30 Daniele Campa，18，18，31 Federico Canzian，32 Jose E. Castelao，33 Tsun L. Chan，33 Tsun L. Chan，34，35 Jenny Chand Chan，36 J. Chan J. Chan，J。 Chenevix-Trench，37 Ji-Yeob Choi，38，39，40 Christine L. Clarke，41 NBCS合作者，42，43，44，44，45，46，46，47，47，48，48，50，50，50，51，51，51，51，51，52 Sarah Colonna，53 Don M. Conroy，4 Fergus J. Conroy，4 Fergus J. Couch，54 simne cross，55 s. cocoun cross，55 corm s。玛丽·戴利（Mary B.