Jean Ching-Yi Tien, 1,2 Jie Luo, 1,2,14 Yu Chang, 1,2,14 Yuping Zhang, 1,2,14 Yunhui Cheng, 1,2,14 Xiaoju Wang, 1,2 Jianzhang Yang, 3,4 Rahul Mannan, 1,2 Somnath Mahapatra, 1,2 Palak Shah, 1,2 Xiao-Ming Wang, 1,2 Abigail J. Todd, 1,2 Sanjana Eyunni, 1,2 Caleb Cheng, 1 Ryan J. Rebernick, 1,2 Lanbo Xiao, 1,2 Yi Bao, 1,2 James Neiswender, 5 Rachel Brough, 5 Stephen J. Pettitt, 5 Xuhong Cao, 1,2 Stephanie J.), arul@med.umich.edu (A.M.C.)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101758
图3示意图(改编自Difrisco,Love and Wagner,2020)的“配对gnathostome附属物”。脊椎动物胚胎中肢体芽的发育先于配对附属物的发展(例如鳍和四肢)。双向箭头示意性地描述了组织类型之间的局部激素驱动的相互作用;肢体发育由四个肢体芽中的四个信号中心精心策划。此处包括两个最著名的信号中心,作为带有信号梯度的箭头。ZPA建立了肢体的前后组织组织,AER建立了近端组织。这些信号传导中心形成了一个复杂的,有因果关系的,共同决定肢体身份的必要机制。他们的活动是相互依存的,相互加强(Difrisco,Love and Wagner,2020)。CHIM的上游(其因果“输入”)是相对未分化的,宽松的中胚层胚胎组织; CHIM的下游(其因果“输出”)是具有可识别的组织类型和肢体组织的结构。然后通过进一步的过程来修改这种基本的肢体结构,以确定可能的肢体表型,例如上面讨论的五达乙酰基前肢表型。
1农业动物遗传学,育种和繁殖,教育部和猪遗传学和育种部关键实验室,农业和农村事务部,瓦兹洪农业大学,430070 Wuhan,P.R。R.中国。2 Yazhouwan国家实验室(YNL),Sanya Hainan 572025,P。R.China。 3瓦兹胡农业大学的可持续猪生产合作创新中心,430070 Wuhan,P。R.中国。 4 Hubei Hongshan实验室,Huazhong农业大学,Wuhan 430070,P。R.China。 5胰腺疾病实验室,吉安格大学医学院第一家附属医院,杭州310058,P。R.China。 这些作者也同样贡献:Dagang Tao,Bingrong Xu,Sheng Li和Hailong Liu。 *电子邮件:ssxie@mail.hzau.edu.cn; shzhao@mail.hzau.edu.cn; xyli@mail.hzau.edu.cn2 Yazhouwan国家实验室(YNL),Sanya Hainan 572025,P。R.China。3瓦兹胡农业大学的可持续猪生产合作创新中心,430070 Wuhan,P。R.中国。4 Hubei Hongshan实验室,Huazhong农业大学,Wuhan 430070,P。R.China。 5胰腺疾病实验室,吉安格大学医学院第一家附属医院,杭州310058,P。R.China。 这些作者也同样贡献:Dagang Tao,Bingrong Xu,Sheng Li和Hailong Liu。 *电子邮件:ssxie@mail.hzau.edu.cn; shzhao@mail.hzau.edu.cn; xyli@mail.hzau.edu.cn4 Hubei Hongshan实验室,Huazhong农业大学,Wuhan 430070,P。R.China。5胰腺疾病实验室,吉安格大学医学院第一家附属医院,杭州310058,P。R.China。这些作者也同样贡献:Dagang Tao,Bingrong Xu,Sheng Li和Hailong Liu。*电子邮件:ssxie@mail.hzau.edu.cn; shzhao@mail.hzau.edu.cn; xyli@mail.hzau.edu.cn
(A) 果蝇 (Drosophila melanogaster) 和果蝇 (D. miranda) 中 Pten 基因组邻域的同源性比较。细箭头表示果蝇 (D. melanogaster) (上) 和果蝇 (D. miranda) (下) 中目标基因 Pten 所在的 DNA 链。指向右侧的细箭头表示 Pten 在果蝇 (D. miranda) 中位于正 (+) 链上,指向左侧的细箭头表示 Pten 在果蝇 (D. melanogaster) 中位于负 (-) 链上。指向与 Pten 相同方向的宽基因箭头相对于细箭头位于同一链上,而指向 Pten 反方向的宽基因箭头相对于细箭头位于反链上。果蝇 (D. miranda) 中的白色基因箭头表示与果蝇 (D. melanogaster) 中相应基因直系同源,而黑色基因箭头表示非直系同源。灰色箭头表示在两个基因组邻域中都存在但不是同源的基因(在本例中为 Ror),在 D. miranda 中位于 Pten 的上游,但在 D. melanogaster 中位于 Pten 的下游。D. miranda 基因箭头中给出的基因符号表示 D. melanogaster 中的直系同源基因,而基因座标识符是 D. miranda 特有的。(B)GEP UCSC Track Data Hub 中的基因模型(Raney 等人,2014)。D. miranda 中 Pten 的编码区显示在用户提供的轨道(黑色)中;CDS 用粗矩形表示,内含子用细线表示,箭头表示转录方向。后续证据轨迹包括果蝇 (D. melanogaster) 蛋白质的 Spaln(紫色,果蝇 (D. melanogaster) 的 Ref-Seq 蛋白质比对)、NCBI RefSeq 基因的 BLAT 比对(深蓝色,果蝇 (D. miranda) 的 Ref-Seq 基因比对)、TransDecoder 预测的转录本和编码区(深绿色)、成年雌性和成年雄性的 RNA-Seq(分别为红色和浅蓝色;果蝇 (D. miranda) 的 Illumina RNA-Seq 读段比对)以及使用果蝇 (D. miranda) RNA-Seq (SRP009365) 由 regtools 预测的剪接点。所示的剪接点具有最小读取深度 10,其中 10-49、50-99 和 100-499 支持读取分别以蓝色、绿色和粉色表示。 (C) 果蝇 Pten-PB(x 轴)与果蝇直系同源肽(y 轴)的点图。左侧和底部标明氨基酸编号;顶部和右侧标明 CDS 编号,CDS 也以交替颜色突出显示。点图中的间隙表示序列相似性较低的区域。
遗传信息的保真度对于细胞功能和生存力至关重要。DNA 双链断裂 (DSB) 对基因组完整性构成重大威胁,需要有效的修复机制。虽然主要的修复策略通常是准确的,但矛盾的是,也存在容易出错的途径。本综述探讨了微同源介导的末端连接 (MMEJ) 的最新进展和我们对它的理解,MMEJ 是一种在生物体中保守的内在致突变 DSB 修复途径。MMEJ 的核心是 DNA 聚合酶 theta (Pol θ ) 的活性,它是一种促进 MMEJ 致突变性的专门聚合酶。我们研究了 MMEJ 活性背后的分子复杂性,并讨论了其在有丝分裂过程中的功能,其中 Pol θ 的活性作为解决持久性 DSB 的最后一搏而出现,尤其是当同源重组受到损害时。我们探索了针对 Pol θ 在癌症治疗和基因组编辑中的有希望的治疗应用。最后,我们讨论了 MMEJ 的进化后果,强调了它在保护基因组完整性和驱动基因组多样性之间的微妙平衡。
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FDA建议公司为人类细胞材料的收集,存储和运输实施标准程序,尤其是如果在多个地点发生收集的情况下,FDA建议公司实施公司来收集,存储和运输人类细胞材料的标准程序,尤其是在多个地点发生的情况下,在多个地点在符合GMP标准的情况下,没有得出结论。
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