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范可尼贫血 (FA) 是一种使人衰弱的遗传性疾病,具有多种严重症状,包括骨髓衰竭和癌症易感性。CRISPR-Cas 基因组编辑通过利用 DNA 修复来操纵基因型,并已被提议作为 FA 的潜在治疗方法。但 FA 是由 DNA 修复本身的缺陷引起的,从而阻止使用同源定向修复等编辑策略。最近开发的碱基编辑 (BE) 系统不依赖于双链 DNA 断裂,可能用于靶向 FA 基因中的突变,但这仍有待测试。在这里,我们开发了一种概念验证治疗性碱基编辑策略,以解决患者造血干细胞和祖细胞中最常见的两种 FANCA 突变。我们发现,优化腺嘌呤碱基编辑器构建体、载体类型、向导 RNA 格式和递送条件可在多种 FA 患者背景中产生非常有效的基因修饰。优化的碱基编辑恢复了 FANCA 表达、FA 通路的分子功能以及对交联剂的表型抗性。ABE8e 介导的编辑在 FA 患者的原代造血干细胞和祖细胞中既具有基因型有效性,又恢复了 FA 通路功能,表明碱基编辑策略在未来 FA 临床应用中具有潜力。
6.1黄素腺嘌呤二核苷酸的结构。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。39 6.2不同相互作用幅度的对数图。。。。。。。。。。42 6.3 FAD自由基对系统的单线产量。。。。。。。。。。。。。。。。。。45 6.4 FAD分子的开放和闭合构型。。。。。。。。。。。46 6.5腺嘌呤和异丙沙嗪环之间的距离。。。。。。47 6.6 FAD光化学反应方案。。。。。。。。。。。。。。。。。。48 6.7单线和三重状态的时间演变。。。。。。。。。。。。。。。。。51 6.8瞬态吸收∆ a的时间曲线(b = 20mt,t)。。。。。。。。。。。。。53 6.9计算的FAD和实验MFE。。。。。。。。。。。。。。。。。。54 S.1电子偶极 - 偶极耦合和其他相互作用的幅度。。。58 S.2不同HFCC的MFE曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。 。 。 。 。 59 S.4信号的时间曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 59 S.5单线收益。 。58 S.2不同HFCC的MFE曲线。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。 。 。 。 。 59 S.4信号的时间曲线。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 59 S.5单线收益。 。58 S.3 MFE曲线,用于不同的松弛和化学反应速率。。。。。59 S.4信号的时间曲线。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。59 S.5单线收益。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。60 S.6腺嘌呤和异丙沙嗪环质量中心之间的平均版本。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。60 S.7非对角线术语的时间演变。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。61
我们之前在一项横断面研究中发现胰岛素抵抗 (IR) 与血浆黄嘌呤氧化还原酶 (XOR) 活性相关。然而,IR 是否会诱导 XOR 活性增加尚未阐明。这项回顾性纵向观察研究包括 347 名参与者(173 名男性,174 名女性),他们每年接受健康检查并且未接受过药物治疗。在基线时确定了稳态模型评估 IR (HOMA-IR) 指数以及身体和实验室测量值。在基线和 12 个月的随访检查中,使用我们基于 [ 13 C 2 , 15 N 2 ] 黄嘌呤和液相色谱/三重四极杆质谱的新型检测方法测定血浆 XOR 活性。 IR 受试者(定义为 HOMA-IR 指数 ≥ 1.7(n = 92))的血浆 XOR 活性水平显著(p < 0.001)高于无 IR 的受试者(n = 255),12 个月后,180 人(51.9%)的血浆 XOR 活性增加。多变量线性和逻辑回归分析表明,基线时的 IR(而不是 BMI 或腰围)与血浆 XOR 活性显著相关(β = 0.094,p = 0.033),并且经过调整各种临床参数(包括基线时的血浆 XOR 活性)后,12 个月期间血浆 XOR 活性增加(比值比,1.986;95% 置信区间,1.048–3.761;p = 0.035)。这些结果表明,IR 以与肥胖无关的方式诱导血浆 XOR 活性增加。
1 po´ s-Gradual in Shic and Sau o of Sau,Rio Grande Do Sul of of Sau of Sau和Sau学院里奥里奥·格兰德(Rio Grande Do)的宗座天主教大学,巴西Porto Alegre,4号药品和药物化学系,埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),图宾根(Tübingen),5个社会和生活学院po´ s-Gradual in Shic and Sau o of Sau,Rio Grande Do Sul of of Sau of Sau和Sau学院里奥里奥·格兰德(Rio Grande Do)的宗座天主教大学,巴西Porto Alegre,4号药品和药物化学系,埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),图宾根(Tübingen),5个社会和生活学院po´ s-Gradual in Shic and Sau o of Sau,Rio Grande Do Sul of of Sau of Sau和Sau学院里奥里奥·格兰德(Rio Grande Do)的宗座天主教大学,巴西Porto Alegre,4号药品和药物化学系,埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),图宾根(Tübingen),5个社会和生活学院po´ s-Gradual in Shic and Sau o of Sau,Rio Grande Do Sul of of Sau of Sau和Sau学院里奥里奥·格兰德(Rio Grande Do)的宗座天主教大学,巴西Porto Alegre,4号药品和药物化学系,埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),埃伯哈德·卡尔斯(Eberhard Karls),图宾根(Tübingen),5个社会和生活学院
血色素沉着症是白人种群中最常见的遗传代谢疾病之一,主要起源于HFE基因中的纯合C282Y突变。g>在基因的845位置的转变会导致HFE蛋白的折叠折叠,最终导致其在细胞膜上不存在。因此,与转素受体1和2缺乏相互作用导致系统性铁超载。我们在高度精确的细胞培养分析中筛选了潜在的GRNA,并应用了表达腺嘌呤基础编辑器ABE7.10的AAV8拆分矢量,并在129- HFE TM.1.1.1NCA小鼠中筛选了我们的候选GRNA。在这里,我们表明我们的治疗载体单次注射导致基因校正率> 10%,并且肝脏中铁代谢的改善。我们的研究提出了针对影响人类最常见的遗传疾病之一的靶向基因矫正疗法的概念验证。
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1个生物标志物早期发现癌症的生物标志物,日本东京国家癌症中心研究所,日本; onidanikaoru@tdc.ac.jp(k.o. ); namiura@ncc.go.jp(N.M.); yukio_watabe@tmhp.jp(Y.W. ); takakuya18@gmail.com(T.K.) 2日本东京牙科学院口腔和颌面外科系,日本东京牙科学院; sibahara@tdc.ac.jp 3日本东京大学医学院生物化学系160-8582; Yuki.sgi@keio.jp(Y.S. ); ykabe@keio.jp(y.k。 ); gasbiology@keio.jp(M.S.) 4美国国家生物医学创新研究所蛋白质组研究实验室,卫生与营养研究所,伊巴拉基,大阪567-0085,日本; y.abe@aichi-cc.jp(y.a。 ); jun_adachi@nibiohn.go.jp(J.A. ); tomonaga@nibiohn.go.jp(t.t。) 5日本东京国家癌症中心医院病理学和临床实验室的病理学和临床实验室; tamori@ncc.go.jp 6日本东京国家癌症中心医院的头颈外科部门和颈部手术系; seyoshim@ncc.go.jp 7日本科比650-0047的Carna Biosciences,Inc.研发; takao.kiyoi@carnabio.com 8日本医学研究与发展局:AMED-CREST,AMED,东京104-0004,日本9 9日本93-8602,日本Nippon Medical School研究生院,日本113-8602,日本 *通信 *通信:K-Honda@nms.ac.jp.jp;电话。 : +81-3-3822-21311个生物标志物早期发现癌症的生物标志物,日本东京国家癌症中心研究所,日本; onidanikaoru@tdc.ac.jp(k.o.); namiura@ncc.go.jp(N.M.); yukio_watabe@tmhp.jp(Y.W.); takakuya18@gmail.com(T.K.)2日本东京牙科学院口腔和颌面外科系,日本东京牙科学院; sibahara@tdc.ac.jp 3日本东京大学医学院生物化学系160-8582; Yuki.sgi@keio.jp(Y.S.); ykabe@keio.jp(y.k。); gasbiology@keio.jp(M.S.)4美国国家生物医学创新研究所蛋白质组研究实验室,卫生与营养研究所,伊巴拉基,大阪567-0085,日本; y.abe@aichi-cc.jp(y.a。); jun_adachi@nibiohn.go.jp(J.A.); tomonaga@nibiohn.go.jp(t.t。)5日本东京国家癌症中心医院病理学和临床实验室的病理学和临床实验室; tamori@ncc.go.jp 6日本东京国家癌症中心医院的头颈外科部门和颈部手术系; seyoshim@ncc.go.jp 7日本科比650-0047的Carna Biosciences,Inc.研发; takao.kiyoi@carnabio.com 8日本医学研究与发展局:AMED-CREST,AMED,东京104-0004,日本9 9日本93-8602,日本Nippon Medical School研究生院,日本113-8602,日本 *通信 *通信:K-Honda@nms.ac.jp.jp;电话。 : +81-3-3822-21315日本东京国家癌症中心医院病理学和临床实验室的病理学和临床实验室; tamori@ncc.go.jp 6日本东京国家癌症中心医院的头颈外科部门和颈部手术系; seyoshim@ncc.go.jp 7日本科比650-0047的Carna Biosciences,Inc.研发; takao.kiyoi@carnabio.com 8日本医学研究与发展局:AMED-CREST,AMED,东京104-0004,日本9 9日本93-8602,日本Nippon Medical School研究生院,日本113-8602,日本 *通信 *通信:K-Honda@nms.ac.jp.jp;电话。: +81-3-3822-2131
转化相关性鉴定对新辅助化学疗法的病理完全反应(PCR)预测性生物标志物将推进三阴性乳腺癌(TNBC)的精确治疗。为了补充标准的蛋白质组学分析,在分析图43个基线TNBC活检样品的分析中,在分析了多西他赛和甲状腺素新辅助素新辅助化学疗法之前,对激酶抑制剂下拉测定法(KIPA)的优化版本进行了分析。虽然没有基于激酶的显着PCR关联出现,但七个非激酶嘌呤结合蛋白与PCR具有正相关,包括GBP2,GBP5,RAC2,RAC2,ATP6V1B2,NEDD4L,LDHB和KPNA4。使用正交mRNA数据集进行验证表明,复合嘌呤结合蛋白的信号预测了化学疗法的反应性和有利的TNBC结果。也观察到与IFN反应途径,免疫评分和免疫检查点水平(PD-L1)的显着相关性。单细胞RNA测序将GBP5和RAC2鉴定为T细胞相关。因此,KIPA是一种新型的生物标志物发现工具,具有定义免疫反应性和化学疗法敏感肿瘤类型的潜力。
摘要 碱基编辑有可能改善农业中的重要经济性状,并且可以精确地将 DNA 或 RNA 序列中的单个核苷酸转换为最小的双链 DNA 断裂 (DSB)。腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 是最近出现的用于将目标 A:T 转换为 G:C 的碱基编辑工具,但尚未在绵羊身上使用。ABEmax 是 ABE 的最新版本之一,它由催化受损的核酸酶和实验室进化的 DNA 腺苷脱氨酶组成。骨形态发生蛋白受体 1B (BMPR1B) 基因中的 Booroola 繁殖力 (FecB B) 突变 (g.A746G, p.Q249R) 会影响许多绵羊品种的繁殖力。在本研究中,通过使用 ABEmax,我们成功获得了具有确定点突变的羔羊,这些突变导致氨基酸替换 (p.Gln249Arg)。在新生羔羊中,定义的点突变效率为 75%,因为六只羔羊在 FecB B 突变位点 (g.A746G, p.Q249R) 处为杂合子,两只羔羊为野生型。我们在八只经过编辑的羔羊中未检测到脱靶突变。在此,我们报告了由 ABE 生成的首只基因编辑绵羊的验证,并强调了其改善牲畜经济重要性状的潜力。