一个联合研究小组,由治疗药物和疫苗开发中心的KIGA TSUNETARO组成(吉吉医学院医学院传染病学系的访问教授,访问教授,吉吉医学院医学院)等,已经巧妙地阐明了一种新的机制,可以巧妙地利用TRNA来促进细菌效应。这一发现可以鼓励进一步发展噬菌体疗法,并导致实现创新疗法的多药抗性细菌,这些疗法不太可能对传统的抗生素有效。
170 171图1。临时性靶标基因组靶标基因组进行连续编辑a。 ICOMBIBRON示意图:A 172修饰的反龙生成ssDNA,该ssDNA包含供体序列,其与173个噬菌体基因组具有同源性的编辑序列,该基因组在SSB和SSAP复制过程中整合到噬菌体基因组中。RERON 174盒子是从包含逆转录酶(RT)和NCRNA的操纵子表达的。NCRNA的反向175个抄录区域以紫色显示为浅蓝色的供体序列,176编辑位点以橙色显示。第二个操纵子表示Csprect和mutl E32K。b。左:跨lambda噬菌体编辑的噬菌体177基因组(作为所有基因组的百分比)。用正向RT-DNA进行编辑以蓝色显示,紫色为178。在每个点的空心圆中显示三个单独的重复。右:使用179的编辑位点14,126(±SD)的重稳定物明显大于DRT对照的编辑(t检验,180 P = 0.0018)。c。左:在噬菌体T7上编辑的噬菌体基因组在每个位置进行了三个重复,在b中显示181。右:用现场22,872(±SD)的重稳定子进行编辑明显大于使用182 DRT对照的编辑(t检验,p = 0.0094)。d。左:在噬菌体T5上编辑的噬菌体基因组在每个183个位置上进行了三个重复,如b所示。右:用现场27,182(±SD)的重稳定子进行编辑显着高于使用DRT对照的编辑(t检验,p <0.0001)。e。位点30,840(f)(±SD)的Lambda的编辑与185张(±SD)与大肠杆菌SSB或T7 SSB的补充表达进行了比较。SSB 186表达(单向方差分析,p <0.0001,n = 3),大肠杆菌(p = 0.005)和T7(p = <0.0001)187均显着不同,与NO NO SSB条件显着不同(Dunnett's,校正)。f。与大肠杆菌SSB或T7 SSB的补充表达相比,位点11,160(R)188(±SD)的T7编辑。SSB表达(单向方差分析,p <0.0001,n = 3)具有显着的效应,大肠杆菌(P = 0.0002)和T7 190(p = 0.0127)均显着不同,与NO SSB条件显着不同(Dunnett's,更正)。g。示意图说明191编辑噬菌体的积累,并进行了多轮编辑。h。编辑的Lambda Phage的比例192
。CC-BY-ND 4.0 国际许可下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 3 月 26 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.03.25.485874 doi:bioRxiv 预印本
摘要:嗜热链球菌 - 感染噬菌体是乳制品工业中的一个主要问题,尤其是与嗜热生产系统有关的问题。因此,已经进行了许多与全球乳制品行动中这种噬菌体的生物多样性有关的研究。在当前的综述中,我们概述了这些噬菌体的遗传和形态多样性,并通过比较蛋白质组的比较蛋白质组分析复制噬菌体的复制和形态发生模块来强调噬菌体中遗传镶嵌物的来源和程度。评估了选定的噬菌体编码受体结合蛋白(RBP)的系统发育,表明在某些情况下,RBP编码基因已分别获取到形态发生模块,从而突出了这些噬菌体的适应性。这篇综述进一步强调了这些噬菌体的遗传多样性群体所取得的显着进步,同时还总结了该研究领域的剩余知识差距。
未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本的版权持有人(本版本发布于5月29日,2021年。; https://doi.org/10.1101/2021.05.27.4446060 doi:biorxiv Preprint
a Department of Allied and Public Health, School of Health, Sport and Bioscience, University of East London, London, United Kingdom b Department of Research and Innovation, Medway NHS Foundation Trust, Gillingham, ME7 5NY, United Kingdom c Department of Public Health, York St John University, London, United Kingdom d Department of Chemistry and Biochemistry, University of Arizona, USA e Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine, Faculty of Life Science工程,FH Technikum,维也纳,奥地利,f生物科学系,卫生与生命科学学院,Teesside大学,米德尔斯堡,英国G,美国亚利桑那大学系统与工业工程系,美国尼日利亚尼日利亚大学,尼日利亚纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市校园和米德尔斯大学,米德尔斯大学,纽约市,
近年来,由对抗生素产生耐药性的细菌所导致的死亡人数不断增加,已成为全球性问题。预计到2050年,耐药细菌导致的死亡人数将达到每年1000万人(图1)。使用新抗生素治疗很困难,有必要开发抗生素疗法以外的治疗方法。作为抗生素治疗的替代方案,人们尝试开发噬菌体疗法,该疗法利用噬菌体(噬菌体),即专门杀死细菌的病毒。然而,以目前的噬菌体治疗技术,很难可靠地选择能够杀死感染患者细菌的噬菌体并用于治疗,而噬菌体治疗的最大障碍是施用噬菌体的治疗效果的不确定性。因此,本研究尝试构建一种具有增强杀菌活性的改良噬菌体,以提高噬菌体治疗的治疗效果。噬菌体基因组中,除了形成噬菌体衣壳、尾巴等外骨骼的基因、将噬菌体复制基因组包装到衣壳中的终止酶等已知基因外,还含有许多功能未知的基因。申请人假设,在这些功能未知的基因中,可能存在一些基因,其缺失可以提高细菌感染的效率。基于这个理念,我们产生了通过突变或删除噬菌体基因来寻找突变噬菌体以提高杀菌活性的想法。 2.研究目标 本研究通过修饰噬菌体基因组,寻找通过突变或缺失增强杀菌活性的噬菌体基因,以提高噬菌体的杀菌活性,从而影响噬菌体治疗的治疗效果。 3.研究方法 1)噬菌体随机突变
噬菌体,也称为噬菌体,是在细菌和古细菌中复制的病毒。噬菌体最初被发现为抗菌剂,并且在称为“噬菌体疗法的过程中,它们都被用作细菌感染的治疗剂。”最近,已经研究了噬菌体在各个领域的功能性纳米材料,因为它们不仅可以作为治疗剂,而且可以作为生物传感器和组织再生材料的功能。噬菌体对人是无毒的,它们具有自组装的纳米结构和功能特性。此外,可以很容易地对遗传修饰进行噬菌体以显示特定的肽或通过噬菌体显示筛选功能性肽。在这里,我们证明了噬菌体纳米材料在组织工程,传感和探测的背景下的应用。
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