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World File Search System四倍体
全基因组鉴定和生物信息学分析高蓝莓
摘要：生长素反应因子（ARFS）是调节生长素期反应基因表达的转录因子家族。在这里，我们对四倍体蓝莓（vocinium corymbosum cv。“ draper”）基因组序列。物理和化学特性，系统发育进化，基因结构，保守基序，染色体位置以及蓝莓ARF基因的顺式作用元素。在其基因组中发现了总共70个蓝莓ARF基因（VCARF），可以分为六个亚家族。VCARF基因在40个染色体上分布不均匀，并观察到编码长度从162到1117氨基酸的蛋白质序列。其外显子数量从2到22。VCARF启动子区域包含与光信号传导，有氧代谢，植物激素，压力和细胞周期调节相关的多个功能域。在蓝莓中发现的VCARF基因的家庭成员多于以前研究的植物，这可能是由于全基因组复制和/或串联复制的发生。vCARF表达模式，并观察到VCARF3，VCARF4，VCARF14，VCARF37和VCARF52都起着重要作用。vcarf3和vcarf4似乎充当阻遏物，而VCARF14则是公司和软质量品种之间果实差异的重要因素。
地球空间生物多样性评估拉加林...
对生态旅游的红树林的可持续管理需要了解地理空间生物多样性的知识，以确保康复和保护干预措施适合其生态状况。本研究旨在评估Lagadlarin红树林，Lobo，Batangas，Philippines物种的植物多样性，并使用地理信息系统作为对生态旅游的可持续保护和管理的基础来整合地理空间分析。通过建立20个尺寸10 x 10 m的四倍体，通过系统的嵌套四边形采样技术进行评估。该地区的物种多样性基于香农 - 温纳指数（1.82）和玛格莱夫的丰富性指数（0.87）。就物种的分布和丰度而言，该面积高于Pielou的均匀度指数（0.61）和Simpson的优势指数（0.78）。该地区有16种真正的红树林物种，一种脆弱和两种近危。根据计算的重要性值，发现在该区域的物种是Avicennia Marina SSP。Rumphiana（89.20％），A。MarinaSSP。码头（32.85％），excoecaria agallocha（23.92％）和Acacia Farnesiana（21.86％），一种入侵物种。根据对红树林生态旅游可持续管理的物种多样性的分布进行地理空间分析，确定了富集和康复区。
llightle在2021年10月27日上午9:48
2021年9月2日，贝纳黛特·华雷斯·阿菲斯女士副管理人生物技术监管服务4700 River Rd，第98单元，MD 20737，亲爱的Bernadette Juarez女士：几个月前，我们已从生物技术监管服务（BRS）的确认过程（我们已经允许了一名基因（BRS），以便我们曾经有过一定的基因（BRS）。 20-324-01CR）。 但是，该请求被BRS拒绝，因为马铃薯是四倍体作物，我们的基因组编辑的马铃薯具有两个基因编辑，即使我们仅明确使用了一种类型的指导RNA（GRNA）。 由于我们的土豆不符合获得豁免状态的标准，尤其是单个基因编辑的存在，因此BRS建议我们应该提交我们要求进行监管状态审查（RSR）的请求。 因此，我们要求BRS评估使用基因组编辑技术开发的马铃薯线进行监管状态审查。 我们正在提供这封信中的信息，这可以帮助BRS对我们的基因组编辑的马铃薯线做出决定。 验证我们请求的基本信息包括以下内容：我们使用靶向单个GRNA（SGRNA）使用CAS9-核糖核蛋白（RNP）递送系统将马铃薯原生质体转染，以编辑STPPO2基因（编码多酚氧化酶，PPO），与含有糖果的棕色褐变相关联。 在获得的近110个独立的基因组编辑的土豆线中，我们根据PPO活性水平和褐变程度下降选择了2种褐变抑制的马铃薯（BSP）线（＃38和＃165）。 1。 2。 3。 4。贝纳黛特·华雷斯·阿菲斯女士副管理人生物技术监管服务4700 River Rd，第98单元，MD 20737，亲爱的Bernadette Juarez女士：几个月前，我们已从生物技术监管服务（BRS）的确认过程（我们已经允许了一名基因（BRS），以便我们曾经有过一定的基因（BRS）。 20-324-01CR）。但是，该请求被BRS拒绝，因为马铃薯是四倍体作物，我们的基因组编辑的马铃薯具有两个基因编辑，即使我们仅明确使用了一种类型的指导RNA（GRNA）。由于我们的土豆不符合获得豁免状态的标准，尤其是单个基因编辑的存在，因此BRS建议我们应该提交我们要求进行监管状态审查（RSR）的请求。因此，我们要求BRS评估使用基因组编辑技术开发的马铃薯线进行监管状态审查。我们正在提供这封信中的信息，这可以帮助BRS对我们的基因组编辑的马铃薯线做出决定。验证我们请求的基本信息包括以下内容：我们使用靶向单个GRNA（SGRNA）使用CAS9-核糖核蛋白（RNP）递送系统将马铃薯原生质体转染，以编辑STPPO2基因（编码多酚氧化酶，PPO），与含有糖果的棕色褐变相关联。在获得的近110个独立的基因组编辑的土豆线中，我们根据PPO活性水平和褐变程度下降选择了2种褐变抑制的马铃薯（BSP）线（＃38和＃165）。1。2。3。4。用于开发BSP系的方法不包括将任何异物DNA序列引入植物基因组中。相反，遗传修饰是由靶向DNA断裂的自然细胞修复过程中基本对（BP）缺失产生的，而没有外部提供的DNA修复模板。我们提出了两条BSP线，＃38和＃165，它们都是四倍体，在目标位点的STPPO2基因的四个等位基因中具有某些删除，即第38行中的两个BP删除和第165行中的四个BP删除。我们设计了SGRNA以专门针对STPPO2基因。此后，我们进行了原生质体转染以验证SGRNA。尽管STPPO属于多基因家族，但基因编辑仅在STPPO2中发生。在目标序列中均未修改其他ISO基因。除了被抑制的褐变外，获得的BSP系与非编辑的土豆没有差异。我们没有找到任何证据表明BSP线比控制线更容易受到害虫攻击。我们提供了与我们的工作相关的所有信息，以支持我们的应用程序，以对基因组编辑的BSP线进行监管状态审查。但是，如果您需要任何其他信息来协助审核程序，请告诉我。
使用共轭同型检测的BB84量子键分布
光同源性检测已被广泛用于测量字段正交的连续变量（CV）量子信息处理。在本文中，我们探讨了在“光子计数”模式下操作共轭同型检测系统以实现离散变量（DV）量子密钥分布（QKD）的可能性。共轭同源检测系统由光束分离器组成，然后是两个光学同伴检测器，可以同时测量传入量子状态的一对共轭四倍体x和p。在经典电动力学中，x 2 + p 2与输入光的能量（光子数）成正比。在量子操作中，X和P不上交，因此上述光子数测量本质上是嘈杂的。这意味着QKD标准安全证明的盲目应用可能会导致模拟性能。我们通过利用拟议检测方案的两个特殊特征来克服这一障碍。首先，外部对手不能操纵与真空浮游相关的基本检测噪声。第二，重建接收器末端的光子数分布的能力可以对对手的可能攻击施加其他约束。为例，我们使用共轭同胞检测来研究BB84 QKD的安全性，并通过数值模拟评估其性能。这项研究可以基于基于单光子检测和基于相干检测的CV-QKD的良好DV-QKD的互补，为新的QKD方案开辟了大门。
原生质体转染进展促进 CRISPR 高效应用
摘要 植物原生质体是利用基因编辑对所需性状进行遗传操作的可靠实验系统。尽管如此，突变原生质体的选择和再生仍具有挑战性，而随后恢复成功编辑的植物是先进植物育种技术的一个重要瓶颈。为了缓解与原生质体转基因表达和原生质体再生相关的障碍，开发了一种新方法。结果表明，线性化 DNA 可以有效转染马铃薯原生质体，而来自各种植物的 UBIQUITIN10 启动子可以有效地指导转基因表达。此外，还对转染原生质体的卡那霉素抑制浓度进行了标准化，新霉素磷酸转移酶 2 ( NPT2 ) 基因可用作富集转染原生质体的有力选择标记。此外，BABYBOOM ( BBM ) 转录因子的瞬时表达促进了原生质体衍生愈伤组织的再生。总之，这些方法显著增加了对表现出高转基因表达的原生质体的筛选，从而显著提高了原生质体衍生愈伤组织中基因编辑事件的发生率，达到 95%。本研究开发的方法促进了四倍体马铃薯植物的基因编辑，并为多倍体生物中的复杂基因操作开辟了道路。
没有宿主基因组修饰的有效遗传代码扩展
补充非经典氨基酸（NCAA）可以产生具有新功能的蛋白质序列，但是现有的NCAA融合策略却遭受了低效率和上下文依赖性的影响。我们将密码子的用法视为先前未经认可的使用非本地密码子扩展有效遗传代码的贡献者。仅依靠具有天然核糖体的常规大肠杆菌菌株，我们开发了一种新型的基于质粒的密码子压缩策略，该策略可最大程度地降低上下文依赖性并改善四倍体密码子的NCAA掺入。我们确认该策略与所有已知的遗传密码扩展资源兼容，这使我们能够识别12个相互正交的tRNA – SYNTHENTAPES PAIRS。通过这些发现启用，我们进化并优化了五个tRNA – Synthetase Pairs，以在正交四曲板密码子处融合了NCAA的广泛曲目。最后，我们将这些资源扩展到一个体内生物合成平台，该平台可以很容易地创建> 100个新的肽大环，最多可达三个独特的NCAA。鉴于我们的方法和简化资源的一般性，我们的发现将加速多重遗传代码扩展，并能够发现化学多样的生物分子以用于研究人员定义的应用。
秋葵：育种和基因组学
抽象的秋葵是一种重要的蔬菜作物，在世界的热带和亚热带地区以及温带地区的温暖地区种植。其商业种植专门分布在亚洲和非洲的各个发展中国家。通常，通常培养的秋葵被报告给四倍体物种，并具有非常大而复杂的基因组，它利用现代的OMICS技术阻碍了其快速的遗传改善。繁殖方法适用于自授粉作物，经常用于秋葵的遗传改善，例如植物引入，纯线选择，杂交，然后选择，突变育种和异性疾病育种。血统的选择和杂种育种，这导致了印度许多品种和杂种的发展。在现代的秋葵繁殖中，对YVMV，oelcv，吮吸害虫和鲍鱼的多种耐受性，易于收获，深绿色水果颜色和理想的植物类型是主要目标特征。在过去的几十年中，不同的公共部门机构已开发并发布了33种改进的品种/混合动力车，以使全国农业社区受益。这些品种/混合动力车中很少有人对印度的秋葵产量产生了值得注意的影响。本文回顾了秋葵育种的当前状态，包括遗传资源，细胞遗传学关系，育种目标，品种发展，抗性育种，生物技术干预及其未来的改善策略。关键词：秋葵，遗传学，育种，遗传资源，生物技术。
利用 CRISPR/Cas 基因组编辑技术改良马铃薯的最新进展与挑战
摘要 马铃薯 ( Solanum tuberosum L.) 在确保全球粮食和营养安全方面发挥着重要作用。生物和非生物胁迫都会对块茎产量产生负面影响，而酶促褐变和冷诱导甜化则会严重导致收获后品质损失。面对人口增长和气候变化的双重挑战，马铃薯改良对其可持续生产至关重要。然而，由于马铃薯具有多种特性，包括高杂合性、四体遗传、近交衰退和二倍体马铃薯的自交不亲和性，常规育种方法不足以在相对较短的时间内实现四倍体马铃薯品种的显著性状改良。CRISPR/Cas 介导的基因组编辑为开发具有高商业化潜力的新型马铃薯品种开辟了新的可能性。在这篇综述中，我们总结了优化基于 CRISPR/Cas 的马铃薯基因组编辑方法的最新进展，重点介绍了解决该物种具有挑战性的生物学问题的方法。我们还讨论了获得无转基因基因组编辑马铃薯品种的可行性，并探索了提高马铃薯抗逆性、营养价值、淀粉组成以及储存和加工特性的不同策略。总之，本综述深入了解了使用 CRISPR/Cas 技术进行马铃薯基因组编辑的最新进展、可能的瓶颈以及未来的研究方向。
连续变量量子算法：简介
离散性的美感全能量子量，而忘记了连续的量子。将量子力学的课程转换为离散的量子计算偏置的趋势，其中强调了限定的希尔伯特空间中的离散量子和计算。基于坐标表示波函数，de broglie波，傅立叶变换等的“较旧”教学方式。似乎正在消失，但是，这种知识对于连续可变量子计算（CVQC）至关重要。在此教学介绍中，我们旨在弥合这一差距。在这里，我们介绍了处理量子力学中连续数量时使用的基本数学概念和工具，并解释了如何将它们用于CVQC算法开发。许多物理量，例如位置和术语或电磁场的四倍体，可以接受量子力学中连续光谱的值。由于量子力学的性质和海森堡的不确定性关系，对连续量子进行的精确操纵从根本上是不可能的。此外，量子系统中噪声的质量进一步加剧了这种情况，似乎在使用连续量子数量进行计算时似乎没有观点。然而，相关的实现实现和量子误差校正代码的发展促使CVQC作为独立的计算范式的研究。CVQC普遍性的问题是一个微妙的，但是在多个元素汉密尔顿人的限制案例中已经解决了它[1]。从那时起，已经为CVQC开发了许多算法。除了
开发四链体实时定量RT- ...
猪血凝性脑脊髓炎病毒（PHEV），猪假拟南芥病毒（PRV），经典猪发烧病毒（CSFV）和日本的脑炎病毒（JEV）导致感染猪的神经学症状相似，及其对实验性诊断的差异性诊断。设计了四对特定引物和探针，分别针对PHEV N基因，PRV GB基因，CSFV 5'非翻译区域（5'UTR）和JEV NS1基因，并且开发了四倍的实时定量RT-PCR（QRT-PCR（QRT-PCR），以检测和分化的PHEV，pRV，pRV，pRV，pRV，pRV，＆JEV。该测定显示高灵敏度，每种病原体的检测极限（LOD）为1.5×10 1拷贝/μL。该测定法仅检测到PHEV，PRV，CSFV和JEV，而没有与其他猪病毒交叉反应。测定内和测定间的变异系数（CVS）小于1.84％，可重复性很高。通过已发达的四倍体QRT-PCR测试了总共1,977个临床样本，包括组织样本和从中国广西省收集的全血样本，以及PHEV，PRV，PRV，CSFV和JEV的阳性率为1.57％（31/1,977），0.355％（7/1,1,97）， （21/1,977）和0.10％（2/1,977）。也通过先前报道的QRT-PCR分析测试了这1,977个样品，这些方法的巧合率超过99.90％。发达的测定法被证明是快速，敏感和准确的，用于检测和分化PHEV，PRV，CSFV和JEV。