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回肠微生物群对克罗恩病外科现场感染的影响：全国前瞻性队列
a Department of Gastrointestinal Surgery, North Hospital, Public Assistance-Marseille Hospitals, Aix-Marseille Univ., Chemin des Bourrely, 13015 Marseille, France B Sorbonne University, UMR CNRS 8001, LPSM, 75005 Paris, France C Sorbonne University, Inserm, Saint-Antoine research center, CRSA, AP-HP, Hospital, Gastroenterology Department, F-75012巴黎，法国D胃肠病学系MICI和养分援助，法国E Univ。通讯作者：哈里·索科尔（Harry Sokol），医学博士，博士，胃肠病学服务，圣坦医院，184 Rue du Faubourg Saint-Antoine，75571 Paris Cedex，法国12。电话：+33 1 49 28 31 62;传真：+33 1 49 28 31 88;电子邮件：harry.sokol@aphp.frLille，Inserm，Chu Lille，U1286炎症转化研究，F-59000，法国F-59000，法国F-59000胃肠病学系，里昂SUD医院，Lyon Sud医院，Hospices de Lyon和Inserm U1111，Ciri，Ciri，Ciri，Lyon，法国Gastrolance gastroterologely deconcy法国艾米斯大学艾米斯大学医院，法国尼斯2号ARchet 2，法国J Digestive，肿瘤学和内分泌手术系Artoenterology系的肝胃肠病学系，巴黎大学，巴黎大学，巴黎大学，法国大学，法国大学，法国大学，法国大学，法国医院Huiez医院，里尔大学里尔市Chru，北法国，法国里尔，法国M手术部，里昂SUD医院，康复医院，康复医院，里昂，里昂，法国里昂。 （PACEMM）法国巴黎FHU，法国胃肠病学系，AP-HP，圣路易斯医院，法国Sorbonne Sorbonne University，AP-HP，AP-HP，AP-HP，SANT ANTOINE医院，F-75012，PARIS，SUDPARIS，SUDPARIS，PARIS，PARAS，PARAS，PARAS BBA UMICHANN的SUDPARIS，PARIS INDERIDE INDER IDER IDERACHIC（PARISE） Aix-Marseille Univ/University Gustave Eiffel, Boulevard Pierre Dramard, Marseille, France V Center for Surgical Teaching and Research (Cercle), Aix-Marseille Univ, Boulevard Pierre Dramard, Marseille, UMR1319 MICHALIS & AGROPARISTECH, JOUY EN JOSAS, FRANCE *THERE AUTHORS Contributed EQUALLY TO THIS Study.
回肠微生物群的组成是宿主基因组和磷利用和其他效率性状之间的介体（coturnix japonica）
抽象背景：磷是所有生物体中必不可少的营养素，目前，由于其全球稀缺，磷从排泄物产生的环境影响以及由于其以植物中的植物形式存储而引起的消化率较低。在家禽中，磷利用受到回肠菌群和宿主遗传学的组成的影响。在我们的研究中，我们分析了宿主遗传学对回肠菌群组成的影响，以及回肠细菌属的相对丰度与日本鹌鹑中磷的相对丰度与磷利用和相关定量性状的关系。用4K基因组的单核苷酸多态性（SNP）对758个鹌鹑的F2交叉进行了基因分型，并使用靶扩增子测序对回肠菌群的组成进行了表征。遗传性，并针对可遗传的属进行了宿主的定量性状基因座（QTL）链接映射。使用结构方程模型估算了细菌属和定量性状之间的表型和遗传相关性以及递归关系。采用基因组最佳线性无偏预测（GBLUP）和微生物（M）BLUP全息素选择方法，用于评估基于宿主基因组和基于ileum Microbobiota组成的可遗传的磷利用的繁殖可行性。结果：在检查的59个细菌属中，有24个显示出显着的遗传力（名义P≤0.05），范围从0.04到0.17。对于这些属，绘制了六个全基因组显着的QTL。发现了显着的递归效应，从而通过鹌鹑回肠中的微生物群组成来支持间接宿主遗传对宿主定量性状的影响。交叉验证的微生物和基因组预测准确性证实了微生物组成和宿主遗传学对宿主定量性状的强烈影响，因为基于基于传统的微生物介导的成分的GBLUP精确度与基于基于基因组范围Snps的常规GBLUP的精确度相似。结论：我们的结果表明，宿主遗传学对回肠微生物群的组成产生了显着影响，并证实了回肠微生物群的宿主遗传学和组成对宿主的定量性状有影响。这提供了基于宿主基因组和回肠菌群组成的可遗传部分改善磷利用的可能性。
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