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World File Search System大肠杆菌
大肠杆菌和其他从巴格马蒂河分离的大肠菌菌中的抗菌抗性
pipericilin tazobactam（pit，100/10μg），Ce Fimime（CPM，30μg），CE固定（CFM，5μg），Ceotaxime（CTX，30μg），Ceftazidime（CazIme）（CAZ，30μg，30μg），ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem），ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem））（imipnem（ipm，10μg）四环素（TE，3μg），cipro floproxatin（CIP，5μg），Nalidixic Acid（Na，30μg），氯霉素（C，30μg），红霉素（E，15μg），硝基氟烷素（Nitrofurantoin（Nit，300μG） （COT，25μg，1.25/23.75μg）。用于质量控制，使用了ATCC 25922培养。在正常盐水中制备了对生物体的接种，并与0.5 MAC FARLAND标准相比。接种物被擦在MHA板上，并在放置抗生素盘之前干燥5分钟。对于90毫米板，接种了五种不同的抗生素。将板孵育18小时，并用尺度测量抑制区。将抑制区与标准值进行比较。根据临床实验室标准指南（CLSI 2020）测试了抗生素。
建立合成的正交复制系统可以在大肠杆菌中加速进化
生物中新功能的发展是人群中连续基因组突变和选择的结果。这个过程很慢，进化速率从根本上受到临界突变率（1）的限制。divienced的进化通常通过体外产生遗传多样性来避开体内突变率的限制（2），但这并不能使生物体内基因的持续演变。细胞的突变率可以瞬时增加，但是高水平的未靶向突变会导致基因组上的灾难性突变负荷，并且是不可持续的。插入病毒基因组中的基因可以通过迭代感染新的诱变细胞来突变（3-6）。这种方法避免了增加细胞基因突变速率的挑战，并且可以扩展以选择某些表型（7）。然而，该策略仅限于不断发展的基因，这些基因足够小，可以包装到病毒中，并选择可以与感染性偶联的表型。此外，在复制应激条件下的细胞中进行选择，这可能会进一步限制可以探索的细胞表型。将突变直接引导到细胞内特定的，有针对性的DNA序列而没有实质上增加基因组突变率的策略提供了驱动靶序列加速，可持续，连续，连续的细胞演化的可能性（8-17）。通过将靶基因重组到酵母中现有的线性质粒系统开创性的工作利用了现有的天然线性质粒，该质粒在酵母菌溶胶中起作用，并由专用的，蛋白质的DNA聚合酶复制，该聚合酶不将酵母基因组复制为天然正交复制系统（12，13）。
在两阶段培养的基因工程大肠杆菌中生产苯乙烯
摘要：苯乙烯是一种重要的工业化学化学物质。尽管有几项研究报告了微生物苯乙烯的产生，但可以增加批量培养物中产生的苯乙烯量。在这项研究中，使用基因设计的大肠杆菌产生了苯乙烯。首先，我们评估了拟南芥（Atpal）（Atpal）和Brachypodium distachyon（BDPAL）的五种类型的苯丙氨酸氨裂解酶（PAL），以产生反式甲酸（CIN），一种苯乙烯前体。ATPAL2-表达大肠杆菌的CIN大约700 mg/L，我们发现BDPAL可以将CIN转换为苯乙烯。为评估苯乙烯的产生，我们构建了一个大肠杆菌菌株，该菌株从酿酒酵母中表达ATPAL2和阿魏酸脱羧酶。在含油醇的双相培养后，葡萄糖的苯乙烯产生和产量分别为3.1 g/L和26.7％（mol/mol），据我们所知，这是分批种植中获得的最高价值。因此，该菌株可以应用于苯乙烯的大型工业生产。
反刍生物过滤器的大肠杆菌中的合成甲烷植物
反刍动物的排放量负责导致全球变暖的人为温室气体的很大一部分。牛的甲烷排放量是弥漫性的，难以治疗，但是，已经提出了几种溶液，可以降低从牛发出的低（v/v）甲烷流，最高约30％。Wageningen大学和研究国际基因工程机竞赛提出的新型Cattlelyst生物滤器旨在通过引擎盖系统和两个在三层安全机制下收集和转化从牛发出的甲烷和氨和氨。目标是将大肠杆菌施加到合适的合成甲烷肉芽菌中。在本文中，试图在合适的甲肉营养菌株SM1或C1SAUX中表达合成甲烷营养。所得的产物是一个PSEVA2610-SMMO质粒，其中包含SMMO的亚基，并在MMOX基因中复制。无法实现其他伴侣的质粒，并且未显示SM1和C1SAUX菌株的甲基营养生长。最后，该假设既没有得到证实或拒绝。生物过滤器的合成甲烷植物正在成为一种越来越相关的技术来解决低浓度的甲烷，因为本文中探讨了多种技术进步。预计生物滤器设计的改进，例如在引擎盖中浓缩甲烷，多孔填料材料以及具有工程性的特定培养物，可以使生物过滤器成为实现全球甲烷承诺的有用工具。
从大肠杆菌中紫罗兰菌的紫罗兰生物合成途径重建
简介：紫皮蛋白是一种由各种细菌产生的双座，众所周知，可以显示出广泛的药物特性。不幸的是，天然紫饼蛋白生产商的生产力低，导致了不一致的紫cile蛋白供应，从而限制了其作为未来治疗剂的应用。异源表达系统，例如大肠杆菌和Pichia Pastoris，提供了一种产生这些高价值的次级代谢物的替代方法。这项工作描述了大肠杆菌中紫质蛋白异源生产的遗传体系的发展。方法：紫c。violaceum，mth01的生产者是从马来西亚马来西亚大学的林理学基础上分离出来的。使用基因特异性底漆，整个7.3 Kb紫out基因簇从C. volaceum mth01 DNA成功扩增，克隆到PUC19矢量（PVIO19）中，然后分别为PET-3A和PET-3A和PET-11B，分为PVIO3A和PVIO3A和PVIO11B，分别为PET-3A和PET-11B。为异源表达，优化了碳源，温度，诱导剂（IPTG）和L-色氨酸的参数。使用TLC和FTIR分析了从紫色的大肠杆菌转化体中提取的violacein。结果：几天后，含有PVIO3A或PVIO11B的大肠杆菌转化体开发了紫色菌落，表明紫co菌菌素在大肠杆菌中成功表达。TLC分析显示，RF值可与脱氧维奥莱辛（紫氧化紫葡萄丝（Deoxyviolacein）（一种中介代谢物）中的脱氧葡萄蛋白相媲美，而FTIR光谱揭示了胺和羰基的存在，这两个都是吲哚的特征。结论：此处描述的大肠杆菌异源系统可以利用葡萄糖或甘油作为碳源。将L-色氨酸添加到生长培养基中对于成功表达紫col途径是必要的。
大肠杆菌 K12 长时间暴露于模拟微重力后的表型变化
在过去的几十年中，人们对太空环境在微生物遗传和表型变化中的作用的研究兴趣日益浓厚。更具体地说，人们担心宇航员在执行月球及更远太空任务期间的健康会因许多条件的变化而受到损害。这些变化包括细菌生理学变化，这些变化会导致与人类健康直接相关的变化，例如毒性和抗生素耐药性，或生命支持系统的功能变化，例如供水或处理组件中生物膜形成的增加。十多年来，人们一直在研究太空条件对微生物的影响；然而，仍然需要确定微重力的生理效应不仅对细菌生长的影响，而且对可能有助于表型可塑性和微生物适应的不同毒力相关表型的影响。本研究重点是利用 2D 微重力模拟物来解释共生菌大肠杆菌 K12 在模拟微重力条件下生长后的表型变化。利用 2D 回转器，大肠杆菌生长长达 22 天，并用于测量通常与毒力相关的表型变化。测量的表型包括细胞群生长、生物膜发育以及对酸性 pH 和氧化应激的反应。我们的研究结果表明，在酸性条件下，生物膜形成有增强趋势，对氧化应激的抵抗力下降，并且更容易生长。这些结果表明，微重力调节大肠杆菌的适应性和表型可塑性，从而导致毒力发生变化。
大肠杆菌和志贺氏菌的抗生素敏感性测试...
抗生素敏感性测试是一种测试细菌对抗生素反应的方法。这项研究旨在确定抗生素针对微生物活性的有效性。使用两种方法，即扩散方法和稀释方法进行灵敏度测试。使用纸盘（Kirby-bauer）对大肠杆菌和Shigella Sonnei细菌与阿莫西林，新霉素和磺酰胺抗生素进行扩散法进行了扩散法。所需的数据是抑制区的直径。结果表明，大肠杆菌对阿莫西林敏感，但对磺酰胺和新霉素有抵抗力。同时，Shigella Sonnei对阿莫西林，新霉素和磺胺酰胺具有抵抗力。此外，使用液体稀释法测试了稀释法以测试阿莫西林对大肠杆菌细菌的效力。所需的数据是带有液体培养基的测试管，没有显示浊度。结果表明，阿莫西林对大肠杆菌的最小抑制浓度为0.25％。基于使用扩散和稀释方法的抗生素敏感性测试的结果，可以得出结论，阿莫西林对大肠杆菌细菌具有很高的有效性，最小抑制浓度为0.25％，而志贺氏菌对抗生素的耐药性具有抗性。
在鉴定弯曲的大肠杆菌 - 阿莫西林 - 克拉维烷基抗抗性机制
弯曲杆菌的空肠和弯曲杆菌是全球细菌性胃炎的最常见原因（Chlebicz和Śliëewska，2018年）。它们是通过消费受污染的产品（尤其是肉类，主要是鸡肉，牛肉和猪肉）传播的食源性病原体。在2021年的欧洲，弯曲杆菌病占疾病的12万例（欧盟一人健康，2021年），而在美国，弯曲杆菌感染的数量估计为每年150万次疾病（Delahoy等人，2023年）。弯曲杆菌病可引起诸如腹部疼痛，发烧和腹泻等症状，这是生命极年龄的显着风险（Fernández-Cruz等，2010）。抗菌治疗，但是对常用的抗菌药物的耐药性是令人关注的。
食源性疾病来源归因于沙门氏菌，大肠杆菌O157和李斯特菌单核细胞增生植物 - 美国，2021年
IFSAC使用用于先前估计的相同方法得出了2021的估计值，并进行了一些修改。 原始方法可以追溯到2012年的估计值，在一份报告，同行审查的期刊文章和公开会议上描述了。 今年报告中的数据来自1998年至2021年发生的1,322次疾病，与1,322次饮食疾病暴发有关，每种疾病都被确认或怀疑涉及的食物被分配给单一食物类别。 该方法最依赖于爆发数据的最后五年（2017 - 2021年）。 食品是使用IFSAC计划对食品进行分类的，该计划将食品分为17个类别，与美国食品监管机构的分类需求紧密一致。 可以在附录中找到每个食物类别中包含的食物的例子。IFSAC使用用于先前估计的相同方法得出了2021的估计值，并进行了一些修改。原始方法可以追溯到2012年的估计值，在一份报告，同行审查的期刊文章和公开会议上描述了。今年报告中的数据来自1998年至2021年发生的1,322次疾病，与1,322次饮食疾病暴发有关，每种疾病都被确认或怀疑涉及的食物被分配给单一食物类别。该方法最依赖于爆发数据的最后五年（2017 - 2021年）。食品是使用IFSAC计划对食品进行分类的，该计划将食品分为17个类别，与美国食品监管机构的分类需求紧密一致。可以在附录中找到每个食物类别中包含的食物的例子。
通过添加蛋白酶-K和RNase的煮沸法分离大肠杆菌DNA进行纯度和浓度分析
摘要 大肠杆菌是印度尼西亚尿路感染 (UTI) 的主要原因，每年约有 180,000 例报告。UTI 病例越多，越需要使用准确、快速、简单且经济的 DNA 分离方法进行 PCR 诊断。然而，目前煮沸 DNA 分离法中没有从蛋白质和 RNA 污染物中纯化 DNA 的阶段。本研究旨在调查将蛋白酶 K 和 RNase 纳入煮沸 DNA 分离法对分离过程中大肠杆菌 DNA 纯度和浓度的影响。煮沸法涉及加热至 95 C – 100 C 导致细胞裂解并释放细胞成分，包括 DNA。尿液样本以不同的麦克法兰标准（0.25、0.5 和 1）人工污染大肠杆菌。然后进行煮沸 DNA 分离法，然后使用 NanoDrop 分光光度计分析纯度和浓度。本研究表明，煮沸 DNA 分离法中使用的蛋白酶 K 和 RNase 浓度与随后的 DNA 纯度和浓度增加之间存在正相关性。尽管与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，DNA 纯度和浓度有所增加，但与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，其统计学意义并不显著，DNA 纯度的 p 值为 0.245，DNA 浓度的 p 值为 0.353。建议进一步研究在煮沸 DNA 分离法中使用更高的蛋白酶 K 和 RNase 浓度，以提高大肠杆菌 DNA 的纯度和浓度。这种增强可以改善 PCR 扩增并有助于诊断大肠杆菌相关的尿路感染。关键词煮沸法、DNA 纯度、DNA 浓度、蛋白酶 K、RNase。