1 Respucation of ResjudmentBioMédicen Red de Enfermedes Raras(Ciberer),西班牙巴塞罗那; 2大学庞贝·法布拉大学(UPF),西班牙巴塞罗那; 3西班牙巴塞罗那科学技术研究所(Bisti)基因组调节中心(CNAG-CRG)的Centro NacionaldeAnálisisGenómica(CNAG-CRG); 4 Isglobal,西班牙巴塞罗那; 5西班牙巴塞罗那巴塞罗那科学技术学院基因组监管中心(CRG); 6 CiberEpidemiologíay SaludPública(Ciberesp),西班牙巴塞罗那; 7医学基因组学集团,圣地亚哥大学,西班牙圣地亚哥·德·孔波斯特拉; 8英国布拉德福德的布拉德福德教学医院NHS基金会信托基金Bradford健康研究所; 9大学格勒诺布尔(Grenoble Alpes),Inserm,CNRS,环境流行病学团队,用于繁殖和呼吸遗产,法国格勒诺布尔; 10日环境科学系,立陶宛Kaunas Vytautas Magnus University; 11挪威挪威公共卫生学院环境卫生部;挪威; 12社会医学系,克里特岛克里特大学,希腊克里特岛; 13美国南加州大学凯克医学院预防医学系,美国洛杉矶,美国; 14 Medicine Genomics Group,Ciberer,Santiago de Compostela大学,西班牙圣地亚哥De Costela; 15加利西亚州基因组医学基金会,西班牙圣地亚哥·德·波多拉(Santiago de Costela); 16定量基因组医学实验室(QGENOMICS),西班牙巴塞罗那的埃斯普尔·德尔·洛布雷加; 17 Departoment de Biomedicine,DeNeurociències,巴塞罗那大学,巴塞罗那大学,西班牙
这项研究的主要目的是评估失眠症 - 焦虑合并症与大型前瞻性队列中2型糖尿病(T2D)的关联。我们从法国Nutrinet-Santé同类中选择了没有糖尿病的成年人,他们完成了Spielberger州特征焦虑量表的特质焦虑量表(STAI-T,2013–2016)和睡眠问卷(2014年);失眠是根据既定标准定义的。使用多变量COX模型,我们比较了4组的T2D风险:没有失眠或焦虑(参考),单独失眠,单独焦虑(STAI-T≥40)以及合并症的焦虑和失眠。在35,014名参与者中(平均基线年龄:52.4±14.0岁; 76%的女性),378(1.1%)在平均5.9±2.1岁的平均随访中发展了T2D。总体而言,28.5%的样本单独患有焦虑症,仅7.5% - 单独使用症状,而12.5%则是疾病。在完全调整的模型中,较高的T2D风险与焦虑 - 刺激性合并症有关(HR = 1.40; 95%CI 1.01,1.94),但与没有失眠或焦虑的组相比,每种疾病分别与每个疾病相比。这些发现支持了成年人群的合并症与入射T2D之间的正相关。使用精神障碍临床诊断的未来研究可以证实发现的结果,并指导糖尿病预防计划。
图1:我们方法的示意图描述。要描述平衡f,我们需要以下步骤:(1)确定缩放参数ε并重新分发分布f满足的方程; (2)将分布F转换为U.转化的分布u是密度F的对数,在无性繁殖情况下按比率ε归一化,在无穷小的性繁殖案例中由ε2归一化; (3)将U的极限方程式确定为ε→0(橙色框),并推断出宏观特性(绿色框),例如平均适应度λ0,种群中的平均相对表型z ∗ 0,进化滞后| z ∗ 0 |或平衡VAR(F)处的表型方差。
预测人口适应不断变化的环境对于评估人类活动对生物多样性的影响至关重要。许多理论研究通过对围绕最佳表型稳定选择的定量性状的演变进行建模,从而解决了这个问题,该定量性状的进化是在最佳表型周围稳定选择的,该表型的价值随着时间的流逝而连续地转移。在这种情况下,人口命运是由于性状的平衡分布而引起的,相对于移动最佳效果。这样的分布可能随选择形状,繁殖系统,基因座数量,突变内核或其相互作用而变化。在这里,我们开发了一种方法,该方法可以直接从表型分布的整个概况直接从表型分布的整个概况中进行定量测量,而没有任何先验的形状。我们研究了两个不同的繁殖系统(无性和无穷小的性模型),具有各种形式的选择。
摘要:量子机学习提供了新颖的范式来解决传统自然语言过程中的局限性,例如固定上下文长度和计算效率低下。在这项工作中,我们提出了Qmamba,这是Mamba体系结构的第一个量子适应,将选择性状态空间模型与量子计算集成在一起,以实现有效且可扩展的文本生成。Qmamba利用量子和纠缠等量子原理来实现无界的上下文大小,并减少了计算复合物。我们的贡献包括开发针对硬件结合的量子生成模型,编码,嵌入和测量技术方面的进步,以及其在模式复制和上下文挑战任务上的表现,例如“ Haystack中的针刺”。实验结果证实了Qmamba在不同序列长度上保持高效率和性能的潜力,为未来量子增强自然语言处理的探索奠定了基础。
摘要:蛋白质和糖含量在大豆中是重要的种子质量特征,因为它们可以提高大豆食品和饲料产品的价值和可持续性。因此,通过通过标记辅助选择来加速育种过程,鉴定大豆种子蛋白和糖含量的定量性状基因座(QTL)可以使植物育种者和大豆市场受益。在这项研究中,从R08-3221(高蛋白质和低蔗糖)和R07-2000(高蔗糖和低蛋白质)之间的十字架开发了重组近交系(RIL)。蛋白质含量的表型数据取自F2:4和F2:5代。DA7250 NIR分析仪和HPLC仪器用于分析总种子蛋白和蔗糖含量。基因型数据是使用Soysnp6k芯片分析生成的。在这项研究中总共确定了四个QTL。蛋白质含量的两个QTL位于11和20染色体上,两个与蔗糖含量相关的QTL位于染色体14和。11,后者与检测到的蛋白质QTL共定位,解释了研究人群中大豆种子中蛋白质和蔗糖含量的10%的表型变异。大豆育种计划可以使用结果来提高大豆种子质量。
注意力/多动症(ADHD)是一种异性神经发育状况,同时发生条件的流行率很高,导致长期管理中的困难增加。全基因组关联研究已经鉴定了多动症和同时发生的psy-哲学疾病之间共享的变体。但是,遗传机制尚未完全理解。我们将基因表达和空间组织数据整合到了胎儿和成人皮质组织中推定的因果ADHD基因的两样本的孟德尔随机研究中。我们在皮质组织中鉴定了多动症的四个基因(胎儿:ST3GAL3,PTPRF,PIDD1;成人:ST3GAL3,TIE1)。蛋白质 - 与因果ADHD基因所鉴定的生物学途径相结合的蛋白质相互作用数据库,这些途径将这些基因与条件(例如类风湿关节炎)和生物标志物(例如淋巴细胞计数)联系起来,但已知与ADHD相关,但没有先前显示的遗传关系。在成年肝组织上重复进行分析,在成年肝组织中,假定的因果ADHD基因ST3GAL3与胆固醇特征有关。此分析提供了对组织依赖性的时间关系,同时存在性状和生物标志物之间的依赖性时间关系。重要的是,它提供了先前研究和未研究的同时存在条件之间的遗传相互作用的证据。
热应激是影响全球小麦产生和生产力的关键因素。在这项研究中,在500种研究的种质系中,分析了126种小麦基因型在十二个不同的环境条件下生长的小麦基因型。使用五个生化参数,包括谷物蛋白含量(GPC),谷物淀粉糖含量(GAC),谷物总溶解糖(TSS),晶粒铁(FE)和六含锌(Zn)含量分析(六)多型GWAS(M),使用35 K单核苷酸多态性(SNP)基因分型测定和性状数据(包括谷物蛋白含量(GPC),谷物淀粉糖含量(GAC),谷物总糖(TSS),六个多型GWAS(M)含量GWAS(M),这揭示了与晶粒质量参数相关的67个稳定的定量性状核苷酸(QTN),解释了在热应激条件下的3%至44.5%的表型变化。通过考虑至少三个GWAS模型和三个位置的共识结果,最终的QTN被降低至16个,其中12个是新的发现。值得注意的是,分别通过高素质等位基因聚合酶链反应(KASP)方法验证了两个分别与晶粒Fe和Zn相关的新标记,即AX-94461119(AX-94461119(染色体2A)和AX-95220192(染色体7D)。候选基因,包括含P环的核苷三磷酸水解酶(NTPases),Bowman-Birk型蛋白酶抑制剂(BBI)和NPSN13蛋白。这些基因可以作为增强质量特征和未来小麦改善计划中耐热性的潜在目标。
抽象背景:磷是所有生物体中必不可少的营养素,目前,由于其全球稀缺,磷从排泄物产生的环境影响以及由于其以植物中的植物形式存储而引起的消化率较低。在家禽中,磷利用受到回肠菌群和宿主遗传学的组成的影响。在我们的研究中,我们分析了宿主遗传学对回肠菌群组成的影响,以及回肠细菌属的相对丰度与日本鹌鹑中磷的相对丰度与磷利用和相关定量性状的关系。用4K基因组的单核苷酸多态性(SNP)对758个鹌鹑的F2交叉进行了基因分型,并使用靶扩增子测序对回肠菌群的组成进行了表征。遗传性,并针对可遗传的属进行了宿主的定量性状基因座(QTL)链接映射。使用结构方程模型估算了细菌属和定量性状之间的表型和遗传相关性以及递归关系。采用基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)和微生物(M)BLUP全息素选择方法,用于评估基于宿主基因组和基于ileum Microbobiota组成的可遗传的磷利用的繁殖可行性。结果:在检查的59个细菌属中,有24个显示出显着的遗传力(名义P≤0.05),范围从0.04到0.17。对于这些属,绘制了六个全基因组显着的QTL。发现了显着的递归效应,从而通过鹌鹑回肠中的微生物群组成来支持间接宿主遗传对宿主定量性状的影响。交叉验证的微生物和基因组预测准确性证实了微生物组成和宿主遗传学对宿主定量性状的强烈影响,因为基于基于传统的微生物介导的成分的GBLUP精确度与基于基于基因组范围Snps的常规GBLUP的精确度相似。结论:我们的结果表明,宿主遗传学对回肠微生物群的组成产生了显着影响,并证实了回肠微生物群的宿主遗传学和组成对宿主的定量性状有影响。这提供了基于宿主基因组和回肠菌群组成的可遗传部分改善磷利用的可能性。
摘要对瓦罗阿击蛋白的饲养源细胞的摘要是一种特征,最近吸引了对蜜蜂育种的兴趣,以选择耐螨的Apis mellifera菌落。为了研究该性状的遗传结构,我们评估了一个样本。Mellifera Mellifera菌落(n = 155)来自瑞士和法国,并进行了全基因组关联研究,使用每个菌落500名工人进行下一代测序。结果表明,两个QTL显着(p <0.05),与destructor -destructor摄取的育雏细胞的回旋相关。最佳相关的QTL位于以前发现与修饰行为相关的区域的5号染色体上,这是对V. destructor的抗性性状,在a中。Mellifera和Apis Cerana。第二最佳相关的QTL位于DSCAM基因内含子中的4号染色体上,该基因与神经元接线有关。先前的研究表明,与神经元接线有关的基因与回顾和Varroa敏感卫生有关。因此,我们的研究证实了基因区域对5染色体在社会免疫中的作用,并同时提供了对蜂蜜蜜蜂常见螨抗性性状之间遗传相互作用的新见解。