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World File Search System抗原
检测流离失所的幽门螺杆菌抗原...
引言幽门螺杆菌是一种革兰氏阴性细菌，可定植人胃，并与许多胃肠道疾病有关（1）。这是全世界经常感染的；发达国家和发展中国家的一半以上人口都感染了这种微生物（2）。大多数人在童年时期都会收到幽门螺杆菌感染（3）。H.幽门螺杆菌感染会引起消化性溃疡病和胃癌，并影响世界几乎一半的人口（4，5）。许多不同的胃肠道疾病已归因于幽门螺杆菌的有毒菌株和宿主的基因组成。幽门螺杆菌的毒力基因编码对胃上皮造成伤害的蛋白质。幽门螺杆菌致病岛（PAI）最初称为细胞毒素相关基因（CAG），因为假定它与真空毒素（vaca）的表达有关。但是，之后是
海湾战争疾病中的持续有毒炭疽疫苗抗原
…我们发现，当在N2A培养物中添加时，PA63毒素会导致细胞扩散和细胞聚集减少，从而导致凋亡。PA63诱导的细胞损伤的机制包括通过增强碘化丙啶在细胞中的访问来指示的受损细胞膜渗透性。此外，由于肌动蛋白和微管网络均受到损害，导致N2A细胞骨架组织的信号通路受到负面影响。最后，在特定测定中损害了线粒体膜电位。完全，这些改变导致凋亡是PA63的集体毒性作用…
T细胞中的基因工程糖酵解增加了其抗肿瘤功能 途径驱动的稀有种系变体与移植相关的血栓形成微型病变（TA-TMA） 肾脏综合征研究网络（Neptune）匹配肾小球疾病中的基本原理和设计：为合适的患者设计正确的试验，今天 环境氧气水平调节同种异体干细胞移植后肠道营养不良和GVHD严重程度 短期尼古丁剥夺对延迟的影响... 合成阳离子多肽，用于刺激抗原呈递细胞中抗肿瘤先天免疫途径 纤维肌痛的管理：更新 gram- ... 功能多样性的遗传证据 TET2调节异染色质在老年造血干和祖细胞中的空间重新定位 在非洲血统男性中，前列腺癌的新敏感性变异和与侵略性疾病相关的多基因多基因风险评分 在阿尔茨海默氏病进展的氧化应激的背景下，肠道微生物群和炎症之间的链接 在中间... 中的口服微生物群的表征
抽象背景T细胞在抗肿瘤反应中起着核心作用。然而，它们通常在肿瘤微环境中面临许多障碍，包括缺乏可用的必需代谢物，例如葡萄糖和氨基酸。此外，癌细胞可以通过上调代谢物转运蛋白并维持高代谢率来垄断这些资源，从而繁殖和增殖，从而胜过T细胞。方法中，我们试图通过增强其与肿瘤细胞竞争的糖酵解能力来提高肿瘤附近的T细胞抗肿瘤功能。为了实现这一目标，我们设计了人类T细胞，以表达一种关键的糖酵解酶，磷酸果糖激酶与葡萄糖转运蛋白3（一种葡萄糖转运蛋白）结合使用。我们将它们与肿瘤特异性的嵌合抗原或T细胞受体共表达。与对照细胞相比，的结果工程细胞表明，T细胞激活标记物的细胞因子分泌增加和T细胞激活标记的上调。 此外，它们显示出上糖溶解的能力，在人类肿瘤的异种移植模型中转化为改善的体内治疗潜力。 总结，这些发现支持实施T细胞代谢工程，以增强细胞免疫疗法对癌症的疗效。的结果工程细胞表明，T细胞激活标记物的细胞因子分泌增加和T细胞激活标记的上调。此外，它们显示出上糖溶解的能力，在人类肿瘤的异种移植模型中转化为改善的体内治疗潜力。总结，这些发现支持实施T细胞代谢工程，以增强细胞免疫疗法对癌症的疗效。
通过无细胞 DNA 分析确定同种免疫妊娠个体的胎儿红细胞抗原基因型
Shannon Rego，理科硕士，Olaide Ashimi Balogun，医学博士，Kirsten Emanuel，理科硕士，家庭执业护士，Rachael Overcash，医学博士，Juan M. Gonzalez，医学博士，哲学博士，Gregory A. Denomme，哲学博士，Jennifer Hoskovec，理科硕士，Haley King，理科硕士，Ashley Wilson，理科硕士，Julia Wynn，理科硕士，理科硕士，以及 Kenneth J. Moise Jr，医学博士
嵌合抗原受体T细胞T细胞治疗多发性骨髓瘤
GSK，Janssen，Karyopharm，Pfizer，Ra Capital，Regeneron，Sanofi；科学顾问委员会：Caris Life Sciences；董事会：Antengene；毫米中某些鱼类测试的专利。 C. F.报告咨询：Janssen；研究：Regeneron，Janssen；股票所有权：辅助。 P.M.V. 报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。 S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。GSK，Janssen，Karyopharm，Pfizer，Ra Capital，Regeneron，Sanofi；科学顾问委员会：Caris Life Sciences；董事会：Antengene；毫米中某些鱼类测试的专利。C. F.报告咨询：Janssen；研究：Regeneron，Janssen；股票所有权：辅助。P.M.V. 报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。 S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。P.M.V.报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。S.D.R.报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。J.Y.S.报告咨询：风筝，Immpact Bio。L.L.报告咨询：萨诺菲异元。S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。S.F.P.报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。A.J.C.报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。D.W.S.报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。D.K.H.报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。其余的作者没有兴趣披露。
DNA损伤通过锥虫瘤的镶嵌变体表面糖蛋白（VSG）驱动抗原多样化。
图2。DNA双链破裂时，当同源性可用时触发镶嵌VSG形成a）沿Antat1.1转录本鉴定出的独特重组事件的直方图。Cas9 DNA断裂位点由垂直线表示。相对于VSG转录本的5'端的剪切位置为：243、369、694、894、978和1459。截面有色，以指示已确定的供体VSG。r表示与反向链结合的指南。绘制了ANTAT1.1与供体VSG之间的完美同源性的中点。如果镶嵌序列匹配> 1个潜在的供体VSG，则绘制平均重组位置。b）定量由DNA断裂引起的镶嵌重组事件。与从该区域的未经常规读数计数相比，该区域内检测到的250bp或下游中检测到的重组事件的数量被归一化，并具有最小的覆盖范围，以控制测序深度。（n = 2，两个独立的克隆）统计显着性是用带有事后Tukey HSD（** p <0.01）平均值的单向方差分析确定的。c）在ANTAT1.1内断裂后分离出的寄生虫克隆的镶嵌VSG示意图。显示的代表序列。d）在所有分离的镶嵌表达克隆中鉴定出的供体VSG插入长度的直方图。插入长度仅包括新插入的序列，不包括重组位点。e）atat1.1家族的示意图与antat1.1转录本排列。灰色序列与atat1.1的完美匹配。f）在每个重组位点，ANTAT1.1和供体VSG之间共享身份长度的直方图。g）量化Eatro1125和Lister427寄生虫的VSGNOM中VSG类型。lister427 vsgnome具有5个vsgs，可以完全复制，没有任何其他家庭成员。sl = 5'剪接领导者序列，14-mer = 3'序列在所有VSG转录本中保守
个性化的新抗原疫苗作为未经治疗的淋巴浆淋巴瘤患者的早期干预：一项非随机1期试验
淋巴浆淋巴瘤（LPL）是一种无法治愈的低度淋巴瘤，没有标准治疗。用第一个人类，新抗原DNA疫苗治疗的九名无症状患者没有剂量限制毒性（Primary Endpoint，NCT01209871）。所有患者都达到稳定的疾病或更好的疾病，其中一个较小的反应，中位时间为72个月以上。疫苗后单细胞转录组学显示二分法抗肿瘤反应，肿瘤B细胞降低（由独特的B细胞受体跟踪）及其表面途径，但克隆等离子体细胞没有变化。通过后一种人类白细胞抗原（HLA）II类分子和胰岛素样生长因子（IGF）的矛盾上调的下调，这表明抗性机制。疫苗疗法激活并扩展骨髓T细胞插入型，功能性新抗原特异性反应（次要终点），但不能降低髓样细胞的原始信号传导，提出了有利的tumor tumor themor himeRune Microenvironment。未来的策略可能需要将疫苗与靶向浆细胞亚群或IGF-1 signaLing或髓样细胞检查点的阻滞剂组合。
个性化的基于树突状的疫苗，靶向癌症新抗原
摘要。癌症免疫疗法激活了针对肿瘤细胞的宿主免疫系统，并有可能导致开发癌症治疗的创新策略。新抗原是由肿瘤细胞中的基因突变产生的非自身抗原，可诱导没有中央免疫耐受性的肿瘤细胞的强烈免疫反应。随着新抗原分析技术的进步，重点是新抗原的疫苗的开发正在加速。虽然有各种新抗原疫苗的平台，但共同开发了合成长肽，mRNA和基于树突状疫苗（DC）的疫苗的临床应用。个性化的基于DC的疫苗不仅可以加载包括新抗原在内的各种抗原，而且有可能引起T细胞中作为抗原呈递细胞的强烈免疫反应。在这篇综述中，我们描述了新抗原的特性和DC的基本特征。我们还讨论了新抗原疫苗的临床应用，重点是基于DC的个性化疫苗，以及未来的研发方向和挑战。近年来，免疫疗法引起了人们的注意，作为消除恶性肿瘤的新方法。T细胞表面上的免疫检查点在
嵌合抗原受体T细胞疗法受体中的巨细胞病毒感染：一项观察性研究，重点是肿瘤学结局
CAR-T治疗通常与细胞因子释放Syn Drome（CRS）或免疫效应细胞相关的神经毒性综合征（ICANS）有关；患者通常需要用Toci lizumab，类固醇或Anakinra治疗来减轻这些并发症[7]。此外，CAR-T疗法可能导致由于B细胞发育不全引起的低血糖双血症，随后感染率更高[6-9]。感染是CAR-T治疗后最常见的直接直接原因之一[10]。使用Tocilizumab或类固醇治疗CRS和/或ICAN后，这种风险增加，在CAR-T治疗时年龄高龄，并且在CAR-T治疗之前进行了多种治疗方法[7，9，11]。降低CAR-T治疗的大多数病毒感染来自呼吸道病毒和甲状腺病毒（CMV）[9]。
多种抗原表位的计算预测
摘要。由于密码子字母的高变性，从密码子到氨基酸的映射是溢出的，这表明密码子空间可能具有更高的信息含量。嵌入密码子语言模型最近在各种下游任务中表现出成功。然而，磷酸化位点的预测模型，可以说是研究最多的翻译后修饰（PTM）和PTM位点，主要依赖于氨基酸级表示。这项工作引入了一种新的方法，通过通过近来开发的密码子语言模型的嵌入来预测磷酸化位点，该方法专门培训了蛋白质编码DNA序列。蛋白质序列首先精心映射到可靠的编码序列，并使用此编码器编码以生成密码子感知的嵌入。然后将这些嵌入与通过早期融合策略从蛋白质语言模型获得的氨基酸感知的嵌入整合。随后，从定义的窗框内的融合嵌入式形成了感兴趣的位点的窗口级表示。Convbigru网络提取物具有捕获窗口内近端残基之间的时空相关性，然后是基于高斯（Dog）小波范围函数的衍生物的Kolmogorov-Arnold网络（KAN），以产生该站点的预测推断。我们将整体模型配音为Calmphoskan。在独立测试中使用丝氨酸 - 硫代氨酸（合并）和酪氨酸测试集，Calmphoskan优于现有方法。此外，我们证明了该模型在预测蛋白质内在无序区域内的位点的有效性。总体而言，Calmphoskan成为蛋白质中一般磷酸材料的强大预测指标。Calmphoskan将很快公开发布。