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World File Search System探针
探针接口
使用穿透式细胞外多通道电极阵列（通常称为神经探针）记录神经元活动是探测神经元活动最广泛的方法之一。尽管有大量可用的细胞外探针设计，但尖峰分类软件要求的电极通道顺序和相对几何形状的映射这一耗时过程总是留给最终用户。因此，这个手动过程容易出现错误映射，进而导致不良的尖峰分类误差和效率低下。在这里，我们介绍了 ProbeInterface，这是一个开源项目，旨在通过消除在尖峰分类之前手动进行探针映射的步骤来统一神经探针元数据描述，以分析细胞外神经记录。ProbeInterface 首先是一个 Python API，使用户能够以任何所需的复杂度级别创建和可视化探针和探针组。其次，ProbeInterface 有助于以可重现的方式生成任何特定数据采集设置的全面接线描述，这通常涉及使用记录探头、探头、适配器和采集系统。第三，我们与探头制造商合作编译了一个可用探头的开放库，可以使用我们的 Python API 在运行时下载。最后，使用 ProbeInterface，我们定义了一种用于探头处理的文件格式，其中包含 FAIR 探头描述的所有必要信息，并且与神经科学中的其他开放标准兼容且互补。
具有无标记探针
胃癌是全球与癌症相关死亡的第二大主要原因。早期诊断显着增加了生存的机会；因此，需要改进的辅助探索和筛选技术。以前，我们通过将光学探针插入仪器通道中使用了增强的多光谱内窥镜。然而，有限的视野和在组织上留下的光学活检留下的标记使探测的可疑区域的导航和重新访问变得复杂。在这项贡献中引入了两种创新工具，以显着提高临床实践中患者的可追溯性和监测：（i）视频镶嵌以建立对大型胃区域的更全面和全景的视野； （ii）具有内镜图像的靶向和注册的光学活检。所提出的基于光流的镶嵌技术选择了最小化纹理不连续性的图像，尽管缺乏纹理和照明变化，但仍有坚固的不连续性。光学活检的靶向基于内窥镜视图中自由标记探针的自动跟踪，使用深度学习在探索过程中动态估算其姿势。假设器官的小目标区域几乎是平坦的，姿势估计的精度足以确保标准白光颜色图像和高光谱探针图像的精确重叠。这允许将所有时空跟踪的活检位点映射到全景镶嵌上。从医院的患者获得的视频中进行了实验验证。所提出的技术纯粹是基于软件的，因此很容易地整合到临床实践中。它也是通用的，并且与连接到圆柱纤维镜连接的任何成像方式兼容。
使用高密度神经质探针
。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2021年6月4日。; https：//doi.org/10.1101/2021.03.11.435053 doi：biorxiv Preprint
qpcrbio探针混合Lo-rox
底漆设计：对于在快速循环条件下有效扩增，我们建议在80bp和200bp之间的扩增子长度。与所有制造商主人混合了较短的扩增子长度，反应可以循环越快。放大长度不得超过400bp。引物应使用默认引物3设置（https://bioinfo.ut.ee/primer3/）的预测熔点约为60°C。对于Taqman®探针，选择接近5'底漆的探针，避免终末鸟苷残基。对于Taqman®探针，选择接近5'底漆的探针，避免终末鸟苷残基。
荧光探针和脂质
NBD探针对环境敏感，对胺和硫醇高度反应。 这种环境敏感性提供了关键优势，可促进生物分子相互作用和缓冲系统内的自组装。 硝基群的强大电子撤回性质导致NBD衍生能够进行芳族替代（如果存在合适的离开组），从而帮助研究人员开发了各种不同的感应基序来为生物核粒子。 这些关键的化学特性导致荧光团易于化学修饰，并且可以连接到多种蛋白质以及其他生物分子上。 由于可以将NBD固定在生物分子上，因此它使NBD化合物在脂质膜研究，溶酶体脂质体分析和药物筛查中具有宝贵的资产。NBD探针对环境敏感，对胺和硫醇高度反应。这种环境敏感性提供了关键优势，可促进生物分子相互作用和缓冲系统内的自组装。硝基群的强大电子撤回性质导致NBD衍生能够进行芳族替代（如果存在合适的离开组），从而帮助研究人员开发了各种不同的感应基序来为生物核粒子。这些关键的化学特性导致荧光团易于化学修饰，并且可以连接到多种蛋白质以及其他生物分子上。由于可以将NBD固定在生物分子上，因此它使NBD化合物在脂质膜研究，溶酶体脂质体分析和药物筛查中具有宝贵的资产。
论原子探针断层扫描对于……的重要性
摘要 — 原子探针断层扫描是唯一能够以亚纳米分辨率测量所有化学元素的三维空间分布而不受质量或原子序数限制的技术。该技术在各种半导体器件的开发中发挥着重要作用。然而，在世界最发达地区之外，它仍然鲜为人知。考虑到这一点，本文旨在向巴西微电子学会介绍和讨论原子探针断层扫描技术，更重要的是，讨论它对纳米级器件开发的影响。首先，我们介绍原子探针断层扫描的工作原理和实验程序。接下来，我们介绍一些该技术在设备开发中应用的真实例子。最后，我们简要讨论了一个尚未实现的应用的可能性，即亚单层量子点的原子探针断层扫描。
除草剂作为植物生物学探针
除草剂是抑制植物生化途径和/或生理过程中特定分子靶位点的小分子。对这些部位的抑制通常会产生灾难性的后果，对植物致命。这些化合物对各自目标位点的亲和力使它们成为研究和剖析植物生化和生理过程的复杂性的有用工具。例如，阐明光合电子传输链的一部分是通过使用除草剂（例如Terbutryn和Paraquat）来实现的，这些链分别对光系统II和I作用，作为生理探针。源于发现PS II抑制除草剂的约束地点的作品最终于1988年获得诺贝尔奖。尽管不像光合作用的开创性工作那样享有声望，但我们对许多其他植物过程的了解通过巧妙地使用抑制剂作为分子探针而显着扩展。示例突出了除草剂在扩展我们对卟啉合成基本方面的理解和非层状途径的基本方面所起的关键作用标记。关键词：分子探针，除草剂作为工具，化学遗传学，蛋白质组学，代谢组学，基因组学，作用方式。