抽象聚合物被广泛用于不同的领域,并且对提取和组织信息的有效方法的需求正在增加。使用机器学习的自动化方法可以准确地从科学论文中提取相关信息,从而为使用带注释的培训数据提供了一种有希望的解决方案,以自动化信息提取。在本文中,我们引入了一个与聚合物相关的本体论,该本体论具有至关重要的实体和关系,以增强聚合物科学领域的信息提取。我们的本体论是可以自定义的,以适应特定的研究需求。我们提出了Polynere,一种高品质的命名实体识别(NER)和关系提取(RE)语料库,其中包括使用我们的本体学注释的750个聚合物摘要。Polynere的独特特征包括多种实体类型,关系类别,对各种NER设置的支持以及在不同层面上主张实体和关系的能力。Polynere还通过支持证据来促进RE任务中的推理。我们的最新高级方法实验取得了令人有希望的结果,但挑战持续将NER和RE从摘要调整为全文段落。这强调了在聚合物域中需要强大的信息提取系统的需求,这使我们的语料库成为未来发展的宝贵基准。
2我使用的“事物”一词比哲学话语中的技术术语“实质”更宽,该术语“实质”是指特定特定的特定特定特定(属于某种自然类型)的特定的亚里士多德(本质主义)概念,或者是指其后来的一些衍生物,例如,例如,精神物质的cartesian contessian concement cortsus versus versus versuse versance versance versance dialismiss()。值得强调的是,在上面给出的定义中,“事物”也是一个技术术语,它暗示了对单词的日常理解,但不一定与之一致。3对于显着例外,请参见Seibt(2016)中过程哲学史的概述。seibt是第一个在当代分析形而上学的背景下促进过程哲学的人,他曾多次诊断出西方形而上学,因为它是“物质神话”的咒语,例如4然而,所谓的新机制,物质本体论和过程本体论之间的关系是复杂的。新机械师不否认过程的存在和相关性;取而代之的是,它们大多数认可二元本体论,根据哪些机制由实体和活动组成(后者也称为相互作用或操作)(Machamer等人。2000,Bechtel 2006,Illari&Williamson 2013)。 然而,将这些叙述与真实过程本体论账户区分开来的是,可以独立于涉及的活动或过程独立地确定组成机制的实体。2000,Bechtel 2006,Illari&Williamson 2013)。然而,将这些叙述与真实过程本体论账户区分开来的是,可以独立于涉及的活动或过程独立地确定组成机制的实体。这符合进一步的本体论原则,在每个过程中,必须有一个在本体论依赖的物质。5 A close affinity to process ontology is also apparent in Hans Jonas' philosophy of the organism (Jonas 1966) as well as in the organicist movement in biology in the mid of last century (most notably, Waddington 1956), both currently being rediscovered by today's philosophers of biology (Meincke 2018a, Weber & Varela 2002, Gilbert & Sarkar 2000, Nicholson & Gawne 2015)。
如果物理主义是正确的,那么一切都是物理。换句话说,一切都超过或必须由物理上的一切。在连贯的物理学本体论中,与逻辑和数学相关的抽象和心理实体没有余地。因此,如果存在逻辑/数学事实,则必须从物理现实来理解它们。世界的身体事实必须需要它们。因此,在物理学本体论中,必须回答以下两个问题:1)逻辑/数学事实是什么?换句话说:世界的身体事实必须需要什么?2)这种必需品是如何产生的?物理主义数学哲学的目的([1]中概述的第一个)是澄清这些问题,并解释如何在纯粹的物理本体论中构成逻辑和数学。在本文中,我将阐明基本
维护管理活动中的摘要,工程师需要选择维护策略,以执行技术维护措施。单个设备由几个具有不同故障模式的组件组成。每个人都应该有一种维护策略;虽然某些组件可以运行使用纠正性维护,但其他组件则无法承受失败,并且应实施预防或预测策略。选择和评估维护策略是一项复杂的任务,应检索许多来源的信息。来自故障模式,效果和批判性分析的信息,成本 - 利益风险分析,计算维护管理系统,经常被工程师选择和评估维护策略。通常不会随着时间的推移评估选定的策略以检查其有效性。该策略可能需要调整或由更有效的策略代替,例如,基于条件的策略代替了基于时间的策略。为了促进维护策略的选择和评估,当前的研究提出了一种用于维护策略选择和评估的本体论模型(OMSSA)。OMSSA是维护策略中的正式术语框架,可用于开发智能计算代理,可以帮助您选择和评估维护策略的决策过程。为了促进其未来的重复利用和与工业领域中其他本体论的融合,OMSSA通过使用顶级领域中立本体论(基本的正式本体论)来建立本体论发展的状态发展状态。
R. Blair Frost 多伦多大学,加拿大多伦多 人工智能治理系统:加拿大背景下的本体论探索(海报)
动机:代谢组学研究旨在报告与特定实验条件有关的代谢特征(代谢物清单)。这些签名在识别生物标志物或个体的分类中具有重要作用,但是它们的生物学和生理解释仍然是一个挑战。为了支持这项任务,我们介绍了论坛:知识图(kg),提供了基于生命科学数据库和科学文献存储库的化学物质与生物医学概念之间关系的语义表示。结果:在生物学数据上使用语义网络框架使我们能够将基于本体论的推理应用于实体之间的新关系。我们表明,这些新关系提供了不同水平的抽象,并可以为新假设打开道路。我们使用富集分析估算每个提取关系,明确或推断的统计相关性,并将它们实例化为KG中的新知识,以支持结果解释/进一步的查询。可用性和实现:浏览和下载提取的关系的Web接口,以及直接探测整个论坛kg的SPARQL端点,可在https://forum-webapp.semantic-metabolo mics.fr上获得。可以在https://github.com/emetabohub/forum-疾病中获得复制Triplestore所需的代码。联系人:clement.frainay@inrae.fr补充信息:补充数据可从BioInformatics在线获得。
Omia(Nicholas等人 2024)是一种免费的,精心策划的在线知识基础,可为用户提供有关脊椎动物中已知功能变体的最新摘要信息,以及有关已知遗传疾病和其他继承性状的背景信息。 OMIA is modelled on and reciprocally hyperlinked to Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM, Online Men delian Inheritance in Man, 2024 ), and provides further links to PubMed and Gene records at the National Center for Bio technology Information (NCBI, Sayers et al. 2024),授予欧洲生物信息学研究所(EBI)的Ensembl(Mar Tin等人 2023),最近引入了与蒙多疾病本体论的联系(Mondo,Vasilevsky等人。 2022)和脊椎动物本体论(VBO,Mullen等人 2024)。Omia(Nicholas等人2024)是一种免费的,精心策划的在线知识基础,可为用户提供有关脊椎动物中已知功能变体的最新摘要信息,以及有关已知遗传疾病和其他继承性状的背景信息。OMIA is modelled on and reciprocally hyperlinked to Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM, Online Men delian Inheritance in Man, 2024 ), and provides further links to PubMed and Gene records at the National Center for Bio technology Information (NCBI, Sayers et al.2024),授予欧洲生物信息学研究所(EBI)的Ensembl(Mar Tin等人2023),最近引入了与蒙多疾病本体论的联系(Mondo,Vasilevsky等人。2022)和脊椎动物本体论(VBO,Mullen等人2024)。
血脑屏障(BBB)在阿尔茨海默氏症和其他神经退行性疾病中的作用仍然是许多研究的主题。然而,由于缺乏基因本体论(GO)注释,描述蛋白质在BBB正常功能中的作用而损害了那些使用高通量方法的研究。GO财团提供了用于分析和解释大型生物医学数据集的金标准生物信息学资源。但是,其他研究社区也使用了GO,因此必须满足有关提供的信息的广度和深度的各种要求。为了满足阿尔茨海默氏症研究界的需求,我们重点介绍了BBB的注释,超过100张运输或交界蛋白优先考虑注释。该项目导致与BBB相关的GO术语相关的人类蛋白质数量大幅增加,并且在许多其他过程中对这些蛋白质的更全面注释。此外,还策划了调节这些优先蛋白表达的microRNA的数据。因此,该项目增加了这些优先级BBB蛋白的注释的广度和深度。
Urban Air Mobility(UAM)是通过涉及各种相互关联系统的系统(SOS)实现的先进航空概念。基于模型的系统工程(MBSE)非常适合定义此类SOS的体系结构。但是,尽管UAM SOS有一些共同的基本特征,但特定的体系结构和操作参数将从一个都会区变成另一个都会区。在每个都会区的UAM体系结构和运营的适当模型可能会导致不一致,混乱,并最终导致操作困难。为了防止这种结果,本文提出了一个结构化框架,用于利用本体论和参考模型来阐述UAM体系结构。这些用于得出Metro-rarea-特定的架构和操作模型。本体论统一了对UAM SOS中系统,关系和过程的理解。以本体论为基础,基线档位的参考模型是地铁区特异性建筑模型的模板。组合有助于快速生成特定的UAM架构和用例,如本文所示。我们总结了为什么专门为UAM准备的完全模块化和可重复使用的框架这一步骤可以加速进步,以实现这一雄心勃勃的概念。
