摘要CRISPR-CAS系统为原核宿主提供了针对移动遗传元件的适应性免疫力。许多噬菌体编码抑制宿主防御的抗危机(ACR)蛋白。ACR蛋白的识别由于其尺寸小和高序列多样性而具有挑战性,并且迄今为止仅表征有限的数字。在这项研究中,我们报告了一种新型ACR蛋白Acrib2的发现,该蛋白是由φCD38-2梭状芽胞杆菌艰难梭菌噬菌体编码的,可有效抑制宿主的I型I型CRISPR-CAS系统的干扰,并可能充当DNA模拟物。大多数艰难梭菌菌株包含两个CAS操纵子,一个编码一套全套干扰和适应蛋白,另一种仅编码干扰蛋白。出乎意料的是,我们证明了只有部分操纵子才能进行干扰,并且会受到Acrib2的抑制作用。
rebyota是一种基于微生物组的治疗方法,用于防止复发性艰难梭菌感染。它是最后一次剂量抗生素后24-72小时给药。rebyota是一种单剂量治疗。在管理之前,应要求患者在可能的情况下清空膀胱和肠子。应将患者放置在左侧的位置,左侧的左侧弯曲,手臂舒适地放在左侧。将润滑的给药管轻轻地插入直肠大约五英寸,朝向肚脐略微插入。袋子缓慢抬起,以使Rebyota随着重力逐渐流动。一旦整个袋子交付,捏合夹子就会关闭,并且管子缓慢拔出,使患者处于左侧位置15分钟。完成后,患者可以自由移动而无需使用洗手间。报告的最常见的不良反应是腹痛,腹泻,腹胀,肠胃气胀和恶心。
梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染(CDI)每年在美国约30万住院,相关的货币成本为数十亿美元。肠道微生物组营养不良对CDI很重要。据我们所知,元文字组合(MT)仅用于表征肠道微生物组组成和功能,在一项涉及CDI患者的先前研究中。因此,我们利用MT研究了CDI+(n = 20)和CDI-(n = 19)样品在微生物类群和表达基因方面的活性群落多样性和组成的差异。根据CDI状态,未检测到有关丰富性或偶数的显着(Kruskal-Wallis,p> 0.05)的显着差异。但是,基于CDI状态的聚类对于活性微生物分类群和表达的基因数据集都很重要(Permanova,P≤0.05)。此外,与CDI-样品相比,CDI+中的差异特征分析表明,机会性病原体的肠球菌病原体和Ruminococcus gnavus的表达更大。仅考虑真菌序列时,糖霉菌科在CDI-中表达了更多的基因,而其他31种真菌分类群则被确定为显着(Kruskal-Wallisp≤0.05,log(LDA)≥2)与CDI+相关。我们还检测到基于CDI状态的各种基因和途径(Kruskal-Wallisp≤0.05,log(LDA)≥2)显着差异。值得注意的是,与生物膜形成相关的差异基因通过艰难梭菌表达。这为艰难梭菌对抗生素的抵抗和体内频繁复发提供了另一个可能的贡献。此外,更多的CDI+相关真菌分类群构成了额外的证据,表明该分枝杆菌对CDI发病机理很重要。未来的工作将集中于确定艰难梭菌在感染过程中是否积极产生生物膜,以及任何特定的真菌分类群在CDI中是否特别有影响力。
我们在本次演讲中的讨论将包括前瞻性陈述,这些陈述受重大风险和不确定性的影响,可能导致实际结果与此类陈述明示或暗示的结果大不相同。我们包括有关辉瑞艰难梭菌 (C. difficile) 候选疫苗(包括其潜在益处等)的前瞻性陈述,这些陈述涉及重大风险和不确定性,可能导致实际结果与此类陈述明示或暗示的结果大不相同。风险和不确定性包括但不限于研究和开发固有的不确定性,包括达到预期的临床终点的能力、临床试验的开始和/或完成日期、监管提交日期、监管批准日期和/或发布日期,以及出现不利的新临床数据和对现有临床数据的进一步分析的可能性;辉瑞是否以及何时会进行艰难梭菌疫苗的潜在开发,以及此类开发是否以及何时会成功;临床试验数据可能受到监管机构不同解释和评估的风险;监管机构是否会对我们临床研究的设计和结果感到满意;是否以及何时可以为艰难梭菌候选疫苗提交任何生物制品许可申请;此类申请是否以及何时能获得监管机构的批准,这将取决于多种因素,包括确定产品的益处是否大于已知风险、确定产品的有效性,以及如果获得批准,艰难梭菌候选疫苗是否能取得商业成功;监管机构作出影响标签、制造工艺、安全性和/或其他可能影响艰难梭菌候选疫苗可用性或商业潜力的事项的决定;能否从疫苗技术委员会和其他公共卫生当局获得有关艰难梭菌候选疫苗的建议存在不确定性,以及任何此类申请对商业影响的不确定性
在辉瑞工作期间,我帮助领导了多个项目的战略和执行,最终获得了众多疫苗和治疗方法的许可,其中包括13价肺炎球菌结合疫苗PREVNAR 13;美国首个获得许可的针对B血清群引起的侵袭性脑膜炎球菌病的疫苗TRUMENBA;首个获得许可的基于mRNA的疫苗COMIRNATY的菌株变化和下一代研发;一流的抗病毒药物PAXLOVID;以及有史以来最复杂的成人和儿童疫苗PREVNAR 20;以及首个二价预融合F呼吸道合胞病毒疫苗ABRYSVO,用于老年人和孕妇保护新生儿免受呼吸道合胞病毒疾病的侵害。
人类肠道的治疗评估。2作者:Alex Carr 1,2,Nitin S. Baliga 1,2,3,4,Christian Diener 1,5,**和Sean M. 3 Gibbons 1,2,6,7,* 4隶属关系:5 6 1 1 6 1 Systems Biology Institute for Systems Biology,Seattle,西雅图,西雅图,华盛顿州西部,美国华盛顿州,美国7 2分子工程学计划 Seattle, WA, USA 9 4 Lawrence Berkeley National Lab, Berkeley, CA, USA 10 5 Diagnostic and Research Institute of Hygiene, Microbiology and Environmental 11 Medicine, Medical University of Graz, Graz, Austria 12 6 Departments of Bioengineering and Genome Sciences, University of Washington, 13 Seattle, WA, USA 14 7 eScience Institute, University of Washington, Seattle, WA, USA 15 * correspondence can be addressed to cdiener@isbscience.org和162作者:Alex Carr 1,2,Nitin S. Baliga 1,2,3,4,Christian Diener 1,5,**和Sean M. 3 Gibbons 1,2,6,7,* 4隶属关系:5 6 1 1 6 1 Systems Biology Institute for Systems Biology,Seattle,西雅图,西雅图,华盛顿州西部,美国华盛顿州,美国7 2分子工程学计划 Seattle, WA, USA 9 4 Lawrence Berkeley National Lab, Berkeley, CA, USA 10 5 Diagnostic and Research Institute of Hygiene, Microbiology and Environmental 11 Medicine, Medical University of Graz, Graz, Austria 12 6 Departments of Bioengineering and Genome Sciences, University of Washington, 13 Seattle, WA, USA 14 7 eScience Institute, University of Washington, Seattle, WA, USA 15 * correspondence can be addressed to cdiener@isbscience.org和16
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结果:与对照组相比,最近的PPI和抗生素的综合作用[或AB+PPI = 17.51(17.48–17.53)]对CDI风险的效果强于个人效应[或AB = 15.37(14.83-15.93);或PPI = 2.65(2.54– 2.76)]。结果在前几个月内暴露不足。剂量 - 反应分析显示,暴露量增加与CDI风险相关[最近使用:或AB = 6.32(6.15–6.49);或PPI = 1.65(1.62–1.68)每个处方增加]。与没有复发的个体(RCDI)相比,最近[或AB = 1.30(1.23–1.38)]和先前[或AB = 1.23(1.16–1.31);或PPI = 1.12(1.03–1.21)]使用也影响了复发的风险,但两者之间没有显着相互作用。最近的大环内酯/林糖酰胺/链球菌素;包括硝基咪唑包括衍生物在内的其他抗菌剂;非苯甲霉素β乳糖酰和喹诺酮与CDI风险和复发性最强的关联,尤其是最近使用时。PPI最近和前面的使用都进一步增加了与几乎所有抗生素类别相关的CDI风险。
梭状芽胞杆菌差的差异(以前是梭状芽胞杆菌[1])是发达国家与医院相关腹泻的主要原因。近年来,其流行率归因于高呼吸菌株的出现,尤其是属于BI/NAP1/PCR Ribotype 027(RT 027)的菌株的出现,这些菌株会详细征集毒素A/B的高滴度,从而产生二元毒素,并产生二元毒素并表现出增加孢子的倾向[2]。将其基因组测序的第一个RT 027菌株是R20291菌株[3],负责2006年在英国Stoke Mandeville医院发生重大爆发。,R20291已成为研究最多的实验室菌株之一。对梭形基因组序列数据的全面开发依赖于正向和反向遗传学工具的应用[4],最著名的是基于内含子重新定位的封闭技术[5]。初始
DBT-NIAB 科学家研究印度奶牛以获取治疗结核病的药物 结核病 (TB) 是全球主要死亡原因之一。2018 年全球约有 1000 万新发病例和 150 万人死亡。它是艾滋病毒感染者的主要杀手,也是与抗菌素耐药性 (AMR) 相关死亡的主要原因。印度是该病负担最重的国家,估计发病率约为 269 万例。据报道,相当一部分人类结核病是由牛分枝杆菌引起的,牛分枝杆菌是牛结核病 (牛结核病或 BTB) 的主要病原菌。换句话说,牛是人畜共患结核病的主要宿主。更糟糕的是,牛的结核病也是由人类结核杆菌 M. Tuberculosis 引起的。由于多种原因,牛结核病和人畜共患结核病对印度的健康提出了独特的挑战。