1 巴黎 CARPEM 癌症研究所、AP-HP、AP-HP 中心、乔治蓬皮杜欧洲医院肝胃肠病学和消化肿瘤学系,法国巴黎勒布朗街 20 号,75015; arnaud.bayle@aphp.fr (AB); debora.basile@aphp.fr (数据库); geraldine.perkins@aphp.fr (GP) 2 巴黎癌症研究所 CARPEM, AP-HP, AP-HP。乔治蓬皮杜欧洲医院生物化学系中心,法国巴黎 75015; simon.garinet@aphp.fr (新加坡); pierre.laurent-puig@aphp.fr(PL-P.); helene.blons@aphp.fr (HB) 3 科德利埃研究中心,法国巴黎索邦大学 INSERM,75015 巴黎,法国 4 巴黎 CARPEM 癌症研究所,AP-HP,AP-HP.Center,医学生物信息学系,乔治蓬皮杜欧洲医院,75015 巴黎,法国; bastien.rance@aphp.fr * 通信地址:jtaieb75@gmail.com † AB 和 DB 对这项工作做出了同等贡献。
方法:本研究从Gracilaria coronopifolia中经过富集培养、初筛和复筛获得菌株GDSX-4,并初步通过形态学和16SrDNA对其进行表征。对菌株GDSX-4纯培养物进一步进行细菌基因组测序组装和生物信息学分析。具体来说,利用同源组簇(COG)注释、CAZy(碳水化合物活性酶)数据库注释和CAZyme基因组簇(CGCs)注释来识别潜在的多糖降解功能。在不同条件下评估酶活性,包括底物、温度、pH和金属离子的存在。使用薄层色谱法(TLC)和电喷雾电离质谱法(ESI-MS)分析水解产物。
头颈癌易感基因的外显子组测序 Yao Yu,1* Bingjian Feng,2* Chun-Pin Chang,3 Russell Bell,4 Austin Wood,4 Erich Sturgis,5 Guojun Li,6 Andrew Olshan,7 Chien-Jen Chen,8 Pen-Jen Lou,9 Wan-Lun Hsu,10 Melissa Cessna,11 Benjamin Witt,12 Deb Neklason,13 Mia Hashibe,14 Chad Huff,1 Sean Tavtigian 4 1. 德克萨斯州休斯顿 MD 安德森癌症中心流行病学系、癌症预防和人口科学分部 2. 犹他大学医学院皮肤病学系,犹他州盐湖城 3. 犹他大学医学院家庭和预防医学系公共卫生分部,犹他州盐湖城 4.犹他州盐湖城犹他医学院 5. 休斯顿贝勒医学院耳鼻咽喉头颈外科系
• PMTN distinguishes true somatic variants from likely benign germline variants by directly comparing the tumor sample to the patient's own nor- mal DNA in a blood sample • PMTN is a gold-standard method for calculating tumor mutational burden (TMB), which is used to determine immune checkpoint eligibility 1 • PMTN addresses the health equity problem of racial and ethnic under- representation in normative databases by using each患者自己的DNA作为种系减法的参考样本•PMTN在OncoExtra测试中的集成意味着医生在有效的时间范围内为每位患者提供了这些优势。接受测试的患者中有98%的自付费用为$ 0,并且在收到两个样本后14天内,医生在4天内收到结果4
1 法国格勒诺布尔阿尔卑斯大学先进生物科学研究所、INSERM U1209、CNRS UMR 5309、38000 格勒诺布尔、不孕症遗传学表观遗传学和治疗团队; EXT-CCazin@chu-grenoble.fr(抄送); corinne.loeuillet@univ-grenoble-alpes.fr (法语); christophe.arnoult@univ-grenoble-alpes.fr(加拿大); PRay@chu-grenoble.fr (PFR) 2 UM GI-DPI, CHU Grenoble Alpes, 38000 格勒诺布尔, 法国; ilordey@chu-grenoble.fr 3 日内瓦大学医学院遗传医学与发展系,CH-1211 Genève 4,瑞士; Yasmine.NEIRIJNCK@univ-cotedazur.fr(YN); Lydia.Wehrli@unige.ch (LW); Francoise.Kuhne@unige.ch (FK); Serge.Nef@unige.ch (SN) 4 突尼斯医疗援助中心,Polyclinique les Jasmins,Centre Urbain Nord,突尼斯 1003; fourati_selima@yahoo.fr(SFBM); aminbouker@gmail.com (AB); raoudha.zouari@cliniquelesjasmins.com.tn (RZ) 5 TIMC-IMAG,CNRS 和格勒诺布尔阿尔卑斯大学,38000 格勒诺布尔,法国; Nicolas.Thierry-Mieg@univ-grenoble-alpes.fr * 通信地址:ZEKherraf@chu-grenoble.fr;电话:+33-(0)4-7676-8303
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。CC-BY 4.0 国际许可(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 1 月 14 日发布。;https://doi.org/10.1101/2025.01.13.632555 doi:bioRxiv 预印本
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