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环状RNA初学者指南
引导 RNA - circRNA 可通过结合靶向序列与 DNA 靶标结合以及结合 Cas 蛋白的支架序列来设计，以引导 CRISPR-Cas 基因编辑系统中的 Cas 核酸酶
环状二肽：生物学和结构...
作者：J Bojarska · 2021 · 被引用 67 次 — 摘要：环状二肽，也称为二酮哌嗪 (DKP)，是自然界中广泛存在的最简单的环状肽形式，其无与伦比的...
环状RNA及其应用研究进展
环状RNA（circRNA）是一种新型的内源性非编码RNA（ncRNA），与microRNA（miRNA）一样，是一个迅速兴起的RNA研究课题。与传统的线性RNA（具有5'和3'端）不同，circRNA具有不受RNA外切酶影响的闭环结构。因此，circRNA具有持续表达并且对降解不太敏感。由于circRNA具有许多miRNA结合位点，因此消除其对靶基因的抑制作用可以大大增强其表达。circRNA通过特定的circRNA-miRNA相互作用在疾病的发生和进展中发挥重要调控作用。我们在本综述中总结了目前在阐明circRNA机制和生物合成方面的进展。特别是，circRNA主要可以作为miRNA海绵发挥作用，调节宿主基因表达和蛋白质运输。最后，我们讨论了基于circRNA的疗法的应用前景和重大挑战。
对环状温度依赖性性能的调查
图2。（a）QD的吸收和PL光谱，（b）LMZO在溶液中的吸收光谱（c）QLED（d）的层（d），层堆栈（e）的能级比对，QLED结构（f）的横截面TEM图像（f）和性能参数。（g）中的插图显示了在12 V.
靶向蛋白质的环状肽的设计 -
摘要：近年来已经确定了超过930,000个蛋白质蛋白质相互作用（PPI），1个，但它们的理化特性与常规药物靶标有所不同，这使使用2种常规小分子作为模态复杂化。环状肽是靶向3种蛋白质蛋白相互作用（PPI）的一种有希望的方式，但是很难预测靶蛋白4环状肽复合物的结构或设计使用5个计算方法与靶蛋白结合的环状肽序列。最近，具有环状偏移的Alphafold已启用了预测环状肽的结构6，从而实现了从头环状肽设计。我们开发了一个环状肽7复合物的偏移，以实现靶蛋白和环状肽络合物的结构预测，而8种具有环状肽络合物复合物偏移量的Alphafold2可以高精度预测结构。我们9还将环状肽复合物的偏移量应用于Afdesign的粘合剂幻觉方案，即使用Alphafold的10新蛋白设计方法，我们可以设计高预测的局部距离11差异测试和比天然MDM2/P53 12结构的单位界面区域的分离差异11差异测试和较低的分离结合能。此外，该方法被应用于其他12种蛋白质肽复合物和13个蛋白质蛋白质复合物。我们的方法表明，可以设计针对PPI的假定环状肽14个序列。15
环状 CrO3 簇对热力学的敏感性...
利用密度泛函理论讨论了环状三氧化铬团簇与各种气体的相互作用。研究了 n=1 至 6 的环状 (CrO 3 ) n 团簇。相互作用的气体包括 CO、H 2 、NH 3 、CH 4 和 O 2 。所有相互作用的气体都会从 CrO 3 团簇中吸收氧原子（O 2 除外），留下缺氧的团簇，而环境空气中的 O 2 会重新氧化这些团簇。CrO 3 缺氧团簇具有较低的能隙，这提高了这些团簇对相互作用气体的敏感性。讨论了相互作用的热力学，包括对吉布斯自由能、焓和反应熵的评估。反应温度的变化使用吉布斯能量值显示了反应发生的温度范围。一些气体反应是放热的还是吸热的，具体取决于焓的值。自然键轨道 (NBO) 分析显示了 CrO 3 团簇和气体中每个原子上的电荷。这些电荷解释了团簇和气体之间的反应静电。可以使用能隙和反应速率的变化来计算气体对这些气体的相对敏感度。
局限性环状肉芽肿中的 HLA 抗原
在本研究中，GA 患者和对照者之间的 HLA 抗原分布没有统计学上的显著差异。人类组织相容性抗原 HLA-8 8 和 HLA-Bw 15 在胰岛素依赖型糖尿病中数量增加 (7)。因此，本研究的结果不能支持局部性 GA 与胰岛素依赖型糖尿病之间存在关联的理论。我们的研究结果证实了 F1iedman Birnbaum. Haim. Gideone & Barzilai (4) 在一组小规模患者 (11 = 13) 中的最新观察结果。至于在斯堪的纳维亚半岛罕见的全身性 GA。他们在 19 名 HLA-Bw 35 患者中发现显著相关性。这可能表明全身性 GA 与糖尿病之间存在联系。此前碳水化合物耐受性研究已提出这一观点 (5)。需要进一步研究来阐明这种关联。
环状纤维肽偶联物作为整合素...
摘要：为了研究靶向肿瘤光活化化疗的潜力，手性氟氨酸抗癌弹头，λ /δ-[ru（pH 2 phen）2（oh 2）2] 2+，通过直接的METARE和METAR均与METAR共轭含有RGD的AC-MRGDH-NH 2肽连接到含RGD的AC-MRGDH-NH 2肽。此设计提供了两个环状金属肽的两个非映异构体λ-[1] Cl 2和δ-[1] Cl 2。在黑暗中，唯一的螯合肽具有三重作用。首先，它防止其他生物分子与金属中心协调。第二，它的亲水性[1] Cl 2两亲性使其在培养基中自组装成纳米颗粒。第三，它通过与整联蛋白的强烈结合（K d =0.061μm）作为λ-[1] Cl 2与αIIIBβ3的结合）充当肿瘤靶向基序，从而导致受体介导的偶联物在体外的摄取。在A549，U87MG和PC-3人类癌细胞系和U87mg三维（3D）肿瘤球体的二维（2D）单层中的光毒性研究的机理研究表明，这种光毒性是由于光动力疗法（PDT）和光活化化疗（PACT）作用的结合，这是由活性氧的产生和肽摄取的肽产生的。最后，在皮下U87mg胶质母细胞瘤小鼠模型中的体内研究表明，注射后12小时12小时有效地在肿瘤中有效地积累了[1] Cl 2，其中绿光辐照比非核心的模拟拟态谱系复合物产生更强的肿瘤作用[2] Cl [2] Cl 2。考虑到治疗的小鼠缺乏全身毒性，这些结果表明了基于光敏的整联蛋白靶向氟苯甲酸抗癌化合物的高潜力，用于在体内治疗脑癌。
标题 染色体外环状 DNA 促进...
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 1 月 24 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.22.634016 doi：bioRxiv preprint