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CDP Architectonics：升级再造环状二肽
分子结构学的本质在于通过合理利用非共价力来定制设计和构建分子组装，以构建具有新特性和功能的理想结构。这种设计非共价系统的概念使我们能够构建用于生物和非生物应用的功能结构，同时加强我们对受控分子组装技术的理解。在这种情况下，生物分子或具有内置分子识别信息的仿生辅助物可以指导功能模块单元的受控分子组装，以构建纳米、微和宏观结构。环二肽 (CDP) 是环肽的最简单形式，由于具有众多组装和功能特性，可以作为分子构建块设计中的功能核心和辅助物。CDP 是主要的副产品，人们一直在努力抑制或防止肽合成过程中的副产品形成。在我们的实验室中，我们承担了将 CDP 升级为具有仿生和生物医学应用的主流产品的任务，这被称为 CDP 结构学。在本次演讲中，我将介绍 CDP 架构及其潜在应用。
单链环状 DNA 治疗诊断
过去十年见证了核酸治疗和诊断（治疗诊断学）的蓬勃发展。与传统的小分子药物或蛋白质生物制剂不同，核酸治疗诊断学具有以下特征：作为“信息药物”，它具有编码和执行遗传和治疗诊断信息的内在能力、易于进行核酸工程编程、内在刺激或调节免疫调节、多功能功能以及在热变性或化学变性后易于构象恢复。单链环状 DNA (circDNA) 是一类具有共价闭合拓扑结构的单链 DNA (ssDNA)。除了核酸基材料的基本优势（例如低成本、生物相容性和化学修饰简单性）外，circDNA 中没有末端可防止核酸外切酶降解，从而相对于相应的线性 ssDNA 具有增强的生物稳定性。circDNA 已被用于多种治疗诊断应用。例如，circDNA 已被广泛研究作为生物分析信号扩增的模板和通过滚环扩增 (RCA) 和滚环转录 (RCT) 技术合成纳米/微米/宏观生物材料。circDNA 也被常用作多功能 DNA 折纸自组装的支架。最后，circDNA 已被用作治疗诊断适体、miRNA 抑制剂以及成簇的规律间隔的短回文重复序列 - CRISPR 相关蛋白 (CRISPR-Cas) 基因编辑供体。在这篇综述文章中，我们将讨论 circDNA（不包括双链环状 DNA，如质粒）的化学性质、特性和治疗诊断应用；我们还将展望该研究领域的挑战和机遇。
具有平面内 σ‐ 的稳定环状 (R2SnAu)3 阴离子...
具有四个价电子的 被称为不稳定的反芳香阴离子，而具有三个二价锡配体的 3 @ 则是稳定的芳香阴离子，其具有前所未有的 Mçbius 轨道阵列，这与 3 @ 的扰动 MO 和 CCSD 分析预测的结果一致。原子电子排布为 [Xe]4f 14 5d 10 6s 1 的金是贵金属，其化学目前是发展最快的化学领域之一。[1] 金化学研究涉及许多主题，包括金纳米粒子、小的金单核和多核分子、它们对各种有机反应的催化作用以及它们的键合和结构的理论方面。金的氧化态通常为 +1、+3 和 +5，但由于较大的相对论效应及其相对较高的电子亲和力，会出现相当不寻常的 @1 态； [1a] 如碱金属金化物（如 RbAu、CsAu、[2] 和 (NMe 4 )Au）所示，[3] Au @ 通常充当较重的拟卤化物，如 Br @ 和 I @ 。虽然最近已经合成了许多单核和多核金分子和离子，并通过 X 射线分析、核磁共振光谱等进行了表征，但对其键合性质和化学性质的了解仍然有限。
评论文章：铁死亡和环状 RNA
对环状RNA的广泛研究揭示了它们的多种作用，从分子调节剂到癌细胞系中铁死亡的关键影响因素。研究结果强调了环状RNA在调节影响癌症发展关键方面的分子通路方面的重要性，包括细胞存活、增殖和转移。详细分析描述了这些通路，揭示了环状RNA影响铁死亡的分子机制。基于最近的实验结果，该研究评估了靶向环状RNA诱导铁死亡的治疗潜力。通过识别与癌症病因相关的特定环状RNA，该分析为开发利用癌细胞弱点的靶向疗法铺平了道路。本综述巩固了对铁死亡和环状RNA的现有理解，强调了它们在癌症治疗中的作用，并为这一动态领域的持续研究提供了动力。关键词：环状RNA、铁死亡、癌症治疗、分子调控
环状单链 DNA 是一种优良的同源性 - ...
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 12 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.01.518578 doi：bioRxiv preprint
子宫内膜癌中的环状 RNA（综述）
摘要：子宫内膜癌（EC）是西方发达国家女性死亡的主要原因之一，是严重威胁女性健康的常见妇科恶性肿瘤。近年来，EC 呈年轻化趋势，总体发病率逐渐上升。环状 RNA（circRNA）是一类新的内源性转录本，由于其共价闭环结构，与其他类型的 RNA 不同，其编码蛋白质的能力有限。越来越多的证据表明，circRNA 在肺癌、胃癌、乳腺癌、EC 等恶性肿瘤中发挥着重要作用，并通过多种途径影响这些恶性肿瘤的发生发展，进一步证明了 circRNA 作为恶性肿瘤诊断、治疗和预后的分子生物标志物的潜力。本综述的目的是总结目前对环状RNA的生物发生和作用的理解，并讨论环状RNA在EC中的表达、功能和潜在机制，以便识别潜在的新生物标志物。
受体结合域的双靶向环状肽（...
严重急性呼吸综合症冠状病毒2（SARS-COV-2）的受体结合结构域（RBD）及其主要蛋白酶（MPRO）在病毒颗粒的进入和复制中起着至关重要的作用，并且它们的同时推动两者可能是对SARS-COV-2感染的一种诱人方法，可以通过建立“ Double Life ofer of” doubd offer。但是，很少有双重RBD/MPRO靶向剂的报道。在这里，通过结合基于分子对接的筛选和分子动力学模拟的综合虚拟筛选方案发现了四个新型RBD/MPRO双靶向肽，称为MRS 1-4。所有这些分别具有14.4至39.2 nm和22.5 - 40.4 nm的RBD和MPRO的纳摩尔结合。进一步的假病毒感染测定法显示，四个选定的肽在5 µM的浓度下对SARS-COV-2假病毒的抑制作用> 50％，对宿主细胞没有明显的细胞毒性。这项研究导致一类双RBD/MPRO靶向剂的鉴定，这些剂可能被开发为潜在且有效的SARS-COV-2疗法。
组合化学开发的环状肽脂蛋白抑制剂
摘要：Furin是一种负责激活许多生理相关细胞底物的人丝氨酸蛋白酶，还参与了各种病理状况的发展，包括炎症性疾病，癌症，病毒和细菌感染。因此，具有抑制脂蛋白的蛋白水解作用能力的化合物被视为潜在的疗法。在这里，我们采用了组合化学方法（由2000种肽组成），以获得新的，强和稳定的肽脂蛋白抑制剂。广泛研究的胰蛋白酶抑制剂SFTI-1用作领先结构。进一步修饰了选定的单核抑制剂，以最终产生五个在亚洋摩尔范围内的K I值的单一或双环脂蛋白抑制剂。抑制剂5是最活跃的（K I = 0.21 nm），并且比文献中描述的参考脂蛋白抑制剂具有更明显的蛋白水解耐药性。此外，它降低了panc-1细胞裂解物中的液样活性。还报道了使用分子动力学模拟对脂蛋白 - 抑制剂复合物进行详细分析。关键字：弗林，向日葵胰蛋白酶抑制剂1，抑制剂，肽库，组合化学